新疆南疆地区羊口疮病毒的分离鉴定及其遗传进化分析

为确定新疆喀什等地区羊场发生的疑似羊口疮(ORF)的病原,利用GSFs细胞从送检的羊口鼻痂皮中分离获得的毒株,通过PCR鉴定确定该病原为羊口疮病毒(ORFV),命名为ORFV/XJ-NJ/2017/China株。然后对该分离株的B2L基因和ORFV121基因进行克隆,测序,并与其它ORFV序列进行遗传进化分析。结果表明:ORFV/XJ-NJ/2017/China的B2L基因全长为1097bp,编码365个氨基酸,ORFV121基因长889bp,编码296个氨基酸,与Gen Bank中收录的其他ORFV流行株相比,B2L基因核苷酸的同源性为94.7%~98.5%,与疫苗株的核苷酸同源性为97%,推导的氨基酸同源性为95%~97%,;ORFV121基因核苷酸的同源性为93.6%~99.1%,推导的氨基酸同源性87.7~98%。利用软件构建系统进化树分析,根据B2L基因遗传进化树分析结果表明,该分离株与印度分离株亲缘关系最近;由ORFV121基因遗传进化分析结果表明,该分离株与我国NA1/11分离株亲缘关系最近.根据B2L基因和ORFV121基因的遗传进化分析,其分离得到的病毒株可能是国内外流行重组后产生的一个变异株,为羊口疮病毒的后续研究提供依据。