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HIV gp41基因分段低温诱导表达 被引量:1
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作者 袁玉华 毕昌昊 +3 位作者 李菊 王学谦 耿运琪 陈启民 《中国病毒学》 CAS CSCD 2004年第2期179-181,共3页
Clone N3 and C from Human immunodeficiency virus(HIV) gp41 gene were expressed using the pET expression system. When induced by IPTG at 37℃, both two clones did not express in E.coli BL21(DE)3. Howerver, when induced... Clone N3 and C from Human immunodeficiency virus(HIV) gp41 gene were expressed using the pET expression system. When induced by IPTG at 37℃, both two clones did not express in E.coli BL21(DE)3. Howerver, when induced at 16℃, the two clones were both overexpressed, and the amount of the product was about 20% of the total bacteria protein. In Western blotting test, the protein product could react with HIV-positive serum. After IPTG induction, E. coli cells had much higher death rate at 37℃ than at 16℃; [3H]uridine release assay also showed that after IPTG induction, E. coli had a higher release at 37℃. The results suggested that overexpression of the two proteins was due to their decreased toxicity at lower temperature. 展开更多
关键词 人类免疫缺陷病毒 HIV GP41跨膜蛋白 基因 低温诱导 表达 毒性
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影响HIV-GP41N端1/2在E.coli中表达的两段氨基酸序列界定 被引量:1
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作者 袁玉华 毕昌昊 +2 位作者 李菊 耿运琪 陈启民 《南开大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2004年第1期64-68,共5页
GP41蛋白二级结构预测显示 ,前 1 /2片段的 N端 ( 4~ 2 6位氨基酸 )和 C端 ( 1 67~ 1 89位氨基酸 )各有一个富含疏水氨基酸的穿膜螺旋 (可能性 >0 .9) ,分别从 N1 (前 1 /2片段无 C端穿膜螺旋 )的 N端和 N6(前1 /2片段无 N端穿膜螺... GP41蛋白二级结构预测显示 ,前 1 /2片段的 N端 ( 4~ 2 6位氨基酸 )和 C端 ( 1 67~ 1 89位氨基酸 )各有一个富含疏水氨基酸的穿膜螺旋 (可能性 >0 .9) ,分别从 N1 (前 1 /2片段无 C端穿膜螺旋 )的 N端和 N6(前1 /2片段无 N端穿膜螺旋 )的 C端进行缺失构建一系列缺失突变体 ,只有 p ET-N2 ,p ET-N3 ,p ET-N4,p ET-N5在大肠杆菌中获得高效表达 ,其表达量占菌体总蛋白的 2 0 % ,Western blot显示表达蛋白与 HIV阳性血清有良好的反应性 .而 p ET-N1 ,p ET-N6在大肠杆菌中表达量很低或不表达 .从而证明 1~ 6位 ,1 84~ 2 0 1位氨基酸是影响 gp41基因 N端 1 展开更多
关键词 gp41基因 缺失突变体 基因表达
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crtE、crtY、crtI、crtB基因共调控提高β-胡萝卜素产量 被引量:2
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作者 叶立军 毕昌昊 张春枝 《大连工业大学学报》 CAS 北大核心 2016年第3期162-166,共5页
代谢合成途径优化的关键在于途径中多个基因表达的调控,本研究使用不同强度启动子对代谢通路中多个相关基因同时调控以提高大肠杆菌β-胡萝卜素产量。将来源于P.agglomerans的4个基因crtE、crtY、crtI、crtB,通过Golden Gate DNA方法与... 代谢合成途径优化的关键在于途径中多个基因表达的调控,本研究使用不同强度启动子对代谢通路中多个相关基因同时调控以提高大肠杆菌β-胡萝卜素产量。将来源于P.agglomerans的4个基因crtE、crtY、crtI、crtB,通过Golden Gate DNA方法与不同强度启动子组合得到质粒库,并转化到底盘细胞中进行颜色筛选。筛选得到crtE、crtY、crtI、crtB启动子组合各不相同的菌株,β-胡萝卜素产量在0.64-8.82mg/g,最高产量比对照提高了65.2%。本研究验证了通过Golden Gate组装建库对代谢通路多个基因同时调控以提高目的产物产量的可行性。 展开更多
关键词 代谢通量优化 GOLDEN GATE DNA组装 Β-胡萝卜素
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紫色杆菌素在谷氨酸棒状杆菌中异源表达
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作者 孙宏年 毕昌昊 张春枝 《大连工业大学学报》 CAS 北大核心 2017年第2期79-83,共5页
验证了以产L-色氨酸的谷氨酸棒状杆菌为底盘细胞异源表达紫色杆菌素的可行性。从天然产紫色杆菌素的Janthinobacterium lividum获得了相关生物合成途径的结构基因vioA、vioB、vioC、vioD、vioE,并且在每个基因前面添加谷氨酸棒状杆菌的... 验证了以产L-色氨酸的谷氨酸棒状杆菌为底盘细胞异源表达紫色杆菌素的可行性。从天然产紫色杆菌素的Janthinobacterium lividum获得了相关生物合成途径的结构基因vioA、vioB、vioC、vioD、vioE,并且在每个基因前面添加谷氨酸棒状杆菌的保守SD序列元件,与穿梭表达型质粒pEC-XK99E通过Golden-gate DNA装配方法构建,转化到能够产L-色氨酸Corynebacterium glutamicum CICC20192,实现了紫色杆菌素在谷氨酸棒状杆菌中的异源表达。通过对发酵过程中诱导时间的优化,最终90h的摇瓶分批发酵获得了(1 243±207)mg/L紫色杆菌素,结果表明,谷氨酸棒状杆菌是异源表达紫色杆菌素的合适宿主。 展开更多
关键词 紫色杆菌素 谷氨酸棒状杆菌 异源表达
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微生物细胞工厂 被引量:1
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作者 朱欣娜 戴住波 +3 位作者 樊飞宇 赵东东 毕昌昊 张学礼 《科学通报》 EI CAS CSCD 北大核心 2023年第13期1626-1636,共11页
微生物细胞工厂是合成生物学的重要研究方向之一.本文以微生物细胞工厂的产业应用为需求牵引,从物质代谢和能量代谢两方面系统阐述了细胞工厂的合成代谢调控机制,为高效细胞工厂创建奠定了理论基础.本团队在物质代谢方面,建立了新酶元... 微生物细胞工厂是合成生物学的重要研究方向之一.本文以微生物细胞工厂的产业应用为需求牵引,从物质代谢和能量代谢两方面系统阐述了细胞工厂的合成代谢调控机制,为高效细胞工厂创建奠定了理论基础.本团队在物质代谢方面,建立了新酶元件挖掘技术平台,完成了一系列三萜化合物的合成途径解析;开发了染色体多基因文库调控、糖基化酶碱基编辑器(glycosylase base editor, GBE)等途径精准调控使能技术,完成一系列化学品合成途径限速步骤的鉴定,解决了元件与合成途径的适配问题.在能量代谢方面,设计创建了4种葡萄糖新型能量代谢模式,解决了合成途径还原力供给与需求不平衡的问题.在此基础上,创建出一系列微生物细胞工厂, 14个化学品完成技术转让,其中4个化学品实现万吨级产业化,支撑一家企业在科创板上市,推动了微生物细胞工厂的产业应用.最后,对未来微生物细胞工厂的研究进行了展望. 展开更多
关键词 合成生物学 细胞工厂 代谢工程 代谢调控 基因编辑
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HIV-1gp41不同片段表达对E.coli细胞毒性作用分析 被引量:3
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作者 袁玉华 毕昌昊 +3 位作者 李菊 王学谦 耿运琪 陈启民 《科学通报》 EI CAS CSCD 北大核心 2004年第2期173-176,共4页
HIV-gp41基因在E.coli中难以表达,为研究影响其表达的原因,选择gp41不同区域构建表达质粒,通过在E.coli BL21(DE3)中进行表达测定其对细菌的毒性作用.结果表明,IPTG诱导后除质粒pET-HN2表达菌以外其余质粒表达菌大量死亡,目的基因转录的... HIV-gp41基因在E.coli中难以表达,为研究影响其表达的原因,选择gp41不同区域构建表达质粒,通过在E.coli BL21(DE3)中进行表达测定其对细菌的毒性作用.结果表明,IPTG诱导后除质粒pET-HN2表达菌以外其余质粒表达菌大量死亡,目的基因转录的mRNA量也迅速下降,[3H]尿嘧啶释放实验显示释放增加,说明GP41蛋白的毒性作用主要表现为对表达菌细胞膜的破坏而成为其在E.coli中难以表达的主要原因. 展开更多
关键词 HIV GP41蛋白 细胞毒性 基因表达 大肠杆菌 跨膜蛋白
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二氧化碳人工生物转化 被引量:5
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作者 蔡韬 刘玉万 +14 位作者 朱蕾蕾 苏浩 王钰 王国坤 张玲玲 朱之光 盛翔 毕昌昊 马红武 田朝光 张学礼 吴洽庆 孙媛霞 江会锋 马延和 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第11期4101-4114,共14页
二氧化碳(carbon dioxide,CO_(2))资源化利用是全球可持续发展面临的巨大挑战。自然界生物固碳绿色环保,但能效低、速度慢,难以满足工业生产需求;物理化学固碳效率高,但能耗高、产品单一,如何结合生物、物理与化学技术优势,以二氧化碳... 二氧化碳(carbon dioxide,CO_(2))资源化利用是全球可持续发展面临的巨大挑战。自然界生物固碳绿色环保,但能效低、速度慢,难以满足工业生产需求;物理化学固碳效率高,但能耗高、产品单一,如何结合生物、物理与化学技术优势,以二氧化碳为原料进行生物转化利用是当前迫切需要解决的科技难题。本文结合中国科学院天津工业生物技术研究所建所10年来的发展,综述了人工固碳元件、途径与系统的设计与构建等前沿基础领域取得的重要进展,特别是首次实现二氧化碳人工合成淀粉,并对建立二氧化碳人工生物转化技术体系进行了展望。相关进展与展望为助力实现“碳达峰、碳中和”目标提供了新思路。 展开更多
关键词 二氧化碳 资源化 生物转化 人工合成淀粉 “双碳”目标
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大肠杆菌细胞工厂的创建技术 被引量:2
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作者 于勇 朱欣娜 +1 位作者 毕昌昊 张学礼 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第5期1564-1577,共14页
大肠杆菌作为一种重要的模式工业微生物,在医药、化工、农业等方面具有广泛的应用。近30年来,多种代谢工程改造的新策略和新技术,被用于设计、构建和优化大肠杆菌化学品细胞工厂,极大地提高了生物法合成化学品的生产速率和产量。文中将... 大肠杆菌作为一种重要的模式工业微生物,在医药、化工、农业等方面具有广泛的应用。近30年来,多种代谢工程改造的新策略和新技术,被用于设计、构建和优化大肠杆菌化学品细胞工厂,极大地提高了生物法合成化学品的生产速率和产量。文中将从大肠杆菌途径设计、合成途径创建与优化和细胞全局优化三个方面,对大肠杆菌代谢改造起重要推动作用的技术进行综述,并对大肠杆菌代谢工程中关键技术的应用进行了展望。 展开更多
关键词 大肠杆菌 代谢工程 代谢途径 途径优化
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基因组编辑技术及未来发展 被引量:3
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作者 赵东东 宗媛 +4 位作者 尹蕾 毕昌昊 王金 高彩霞 张学礼 《生命科学》 CSCD 北大核心 2021年第12期1462-1468,共7页
基因组编辑技术是合成生物学的一项核心使能技术。CRISPR基因组编辑技术在生命科学领域掀起了一场全新的技术革命,助推了合成生物学快速发展。然而,目前CRISPR基因组编辑技术的性能尚有欠缺,智能设计、表达和投递系统等相关技术也不能... 基因组编辑技术是合成生物学的一项核心使能技术。CRISPR基因组编辑技术在生命科学领域掀起了一场全新的技术革命,助推了合成生物学快速发展。然而,目前CRISPR基因组编辑技术的性能尚有欠缺,智能设计、表达和投递系统等相关技术也不能满足医疗和农业领域的应用需求。未来基因组编辑技术的发展方向,一方面亟待开发更精准、高效、全面和智能的CRISPR基因组编辑技术;另一方面,需利用大数据分析和人工智能技术,开发CRISPR之外全新的颠覆性基因组编辑技术。 展开更多
关键词 基因组编辑 合成生物学 CRISPR 碱基编辑 引导编辑
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大肠杆菌染色体上严谨型启动子的构建 被引量:1
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作者 仇焕娜 赵东东 +3 位作者 满淑丽 毕昌昊 朱欣娜 张学礼 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第8期1693-1704,共12页
【背景】启动子的渗漏表达是代谢工程和合成生物学较为关注的问题,探索严谨型启动子使之能像开关一样控制基因的表达有助于解决这一问题。【目的】为避免在质粒上研究启动子带来的弊端,本研究将在染色体上对严谨型启动子进行构建和评价... 【背景】启动子的渗漏表达是代谢工程和合成生物学较为关注的问题,探索严谨型启动子使之能像开关一样控制基因的表达有助于解决这一问题。【目的】为避免在质粒上研究启动子带来的弊端,本研究将在染色体上对严谨型启动子进行构建和评价。【方法】基于4种调控元件四环素tetO、乳糖lacO、阿拉伯糖araC和鼠李糖rhaR的序列,以及2种来源的启动子PL和Plac序列,设计和组合构建了6个启动子PtetO2、PtetO3、PlacO2、PlacO3、PlacO+ara和PlacO+rha。应用CRISPR/Cas9系统将这6个启动子序列整合到大肠杆菌ATCC 8739染色体上,利用绿色荧光蛋白(Green fluorescent protein,GFP)的表达,分析这6个启动子的相对表达强度和严谨型控制情况。【结果】GFP表达分析显示,启动子PlacO+rha为最佳严谨型启动子,在无诱导剂时表达为0.02,有诱导剂时最大表达强度为lac Z基因启动子的12倍,相对控制范围为600倍。【结论】研究结果将为代谢工程和合成生物学中的精确调控基因表达奠定良好的应用基础。 展开更多
关键词 严谨型 启动子 绿色荧光蛋白 大肠杆菌
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基因组编辑技术在工业生物领域中的应用现状及展望 被引量:2
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作者 杨超 董兴啸 +1 位作者 张学礼 毕昌昊 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第11期4132-4145,共14页
精准且高效的操纵基因表达或改写基因组序列是基因组编辑领域的研究热点,也是助力工业生物技术快速发展的核心使能技术。基因组编辑技术经历了从锌指核酸酶(zinc finger nucleases,ZFNs)、转录激活因子样效应物核酸酶(transcription act... 精准且高效的操纵基因表达或改写基因组序列是基因组编辑领域的研究热点,也是助力工业生物技术快速发展的核心使能技术。基因组编辑技术经历了从锌指核酸酶(zinc finger nucleases,ZFNs)、转录激活因子样效应物核酸酶(transcription activator-like effector nucleases,TALEN)和Cas核酸酶3个发展阶段,目前随着CRISPR/Cas这一基因组编辑工具的蓬勃发展,研究人员在工业生物中建立了一系列基于该技术的一代及二代Cas基因组编辑技术,助力大肠杆菌等原核及酿酒酵母等真核工业生物底盘细胞的建立及优化。本文对目前基于常用底盘细胞的工业生物技术进行介绍,并对技术的发展历程、应用效果等特点进行总结,最后展望工业生物技术的未来发展前景,以期为科研人员提供参考。 展开更多
关键词 基因组编辑 CRISPR/Cas 工业生物技术 工业生物学
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细胞膜合成途径模块化调控与形态改造提高大肠杆菌β-胡萝卜素的积累与产量 被引量:4
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作者 武陶 张柏林 毕昌昊 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第5期703-711,共9页
β-胡萝卜素是类胡萝卜素家族中的典型代表,属于疏水性较强的化合物,前期研究表明,改变细胞膜形态以及增加3-磷酸甘油二酯的供给,均可容纳更多的β-胡萝卜素,从而提高其产量。然而在之前的研究中,没有对细胞膜的磷脂中主要组分磷脂酰乙... β-胡萝卜素是类胡萝卜素家族中的典型代表,属于疏水性较强的化合物,前期研究表明,改变细胞膜形态以及增加3-磷酸甘油二酯的供给,均可容纳更多的β-胡萝卜素,从而提高其产量。然而在之前的研究中,没有对细胞膜的磷脂中主要组分磷脂酰乙醇胺的合成途径对β-胡萝卜素积累的影响进行系统的讨论。本研究将磷脂酰乙醇胺的合成途径分为上中下游3个模块,对它们的多种表达组合策略进行比较。首先过表达了上游模块1,菌株CAR016的β-胡萝卜素的产量与单位细胞的β-胡萝卜素产量均有显著提高,分别可达到44 mg/L以及13.7 mg/g DCW。与对照菌株相比,分别提高30.5%与35.6%。过表达磷脂酰乙醇胺合成的中游模块,β-胡萝卜素的产量以及单位细胞的β-胡萝卜素的产量分别为103.5 mg/L DCW与19.8 mg/g DCW。与对照菌株CAR016(pACYC184-M)相比,分别提高1.4倍与53.5%。将上游模块1与中游模块2共表达,菌株CAR016(pModule1,pModule2)单位细胞的β-胡萝卜素产量为22.3 mg/g DCW。与CAR016(pModule2)相比,单位细胞产量提高18%,与出发菌株CAR016(pTrc99A-M,pACYC184-M)相比,单位细胞的β-胡萝卜素产量提高122%。本研究找到了磷脂酰乙醇胺合成途径表达的最优组合策略,可以产生更大量的细胞膜,为储存β-胡萝卜素提供了更多的空间,从而进一步提高β-胡萝卜素的产量。细胞膜形态和合成途径的模块化改造,是今后提高类胡萝卜素产量的新方向。 展开更多
关键词 Β-胡萝卜素 萜类化合物 细胞膜合成途径 大肠杆菌
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