昆明裂腹鱼CYP1A1基因结构与进化分析

通过构建昆明裂腹鱼全长转录组文库获得基因全长,并通过设计引物PCR扩增,验证高通量测序的准确性,同时对CYP1A1基因的CDS序列进行基因结构和生物信息学分析。结果表明:昆明裂腹鱼CYP1A1基因的CDS序列为1498 bp,编码299个氨基酸,与鲤鱼、安水金线鲃、鲫鱼的CDS序列的同源性相似比率分别为91.70%、92.23%、91.63%,氨基酸序列同源性相似比率分别为90.55%、90.16%、89.76%,昆明裂腹鱼CYP1A1基因的氨基酸的相对分子质量为55867.48 KD,理论等电点(pI)为6.44,分子式为C_(2505)H_(3965)N_(671)O_(728)S_(23);分子系统进化树分析表明,与金线鲃、犀角金线鲃和安水金线鲃亲缘关系相近,与斑马鱼亲缘关系较远;昆明裂腹鱼CYP1A1基因存在明显的疏水性区域,有1个信号肽、27个磷酸化位点、2个跨膜区、有1个N-糖基化位点,3个O-糖基化位点;二级结构主要以α-螺旋为主,无规则卷曲次之,β-折叠最少;三级结构分析表明,昆明裂腹鱼CYP1A1基因有1个缺失突变位点,6个Cys位点。该研究为进一步研究昆明裂腹鱼CYP1A1基因的功能奠定了基础。