非小细胞肺癌预后标志物和预测相关性microRNA的研究

目的 非小细胞肺癌(NSCLC)是肺癌死亡的最主要原因,本研究通过获取NSCLC组织和正常组织的mRNA和microRNA表达数据集,分析影响NSCLC预后的基因及其可能的致癌机制。方法 从GEO数据库中获取5个mRNA数据集和1个miRNA数据集,利用limma软件包从mRNA数据集中筛选差异表达基因(DEGs),进一步利用ClueGO插件分析其通路富集信息,并利用GEPIA软件分析DEGs与肿瘤分期和预后的相关性。然后通过ENCORI、GENEMANIA和STRING数据库预测相互作用的miRNA、mRNA和蛋白质,并利用Cytoscape软件构建蛋白-蛋白相互作用(PPI)和miRNA-mRNA网络。结果 本研究共筛选出51个共差异表达基因,这些差异基因主要是在细胞分化、组织重塑和蛋白激酶A调控方面富集,其中ANKRD29、GREM1、IGSF10、THBS2、PPBP和SPP1在NSCLC的预后中起重要作用,IGSF10与无进展生存期(PFS)相关。mRNA-miRNA互作网络结果预测有22个miRNAs参与调控DEGs,其中miR-143-3p与IGSF10和GERM1密切相关。结论本研究中ANKRD29、GREM1、IGSF10、THBS2、PPBP和SPP1在NSCLC中差异表达显著,可能为NSCLC的诊断、治疗和预后提供了潜在靶点,其中IGSF10和GREM1与miR-143-3P的相关性可能为解释其致癌机制提供指导。