目的:运用网络药理学和分子对接方法探究黄芪仙灵脾汤治疗免疫球蛋白A(IgA)肾病的作用机制。方法:在TCMSP数据库中收集黄芪仙灵脾汤各中药的活性成分及其蛋白作用靶点,通过UniProt数据库转化为基因靶点;在GeneCards、OMIM数据库中获取Ig...目的:运用网络药理学和分子对接方法探究黄芪仙灵脾汤治疗免疫球蛋白A(IgA)肾病的作用机制。方法:在TCMSP数据库中收集黄芪仙灵脾汤各中药的活性成分及其蛋白作用靶点,通过UniProt数据库转化为基因靶点;在GeneCards、OMIM数据库中获取IgA肾病相关靶点;将黄芪仙灵脾汤与IgA肾病的交集基因,利用Cytoscape软件进行药物-成分-靶点网络构建及分析,筛选核心靶点及主要活性成分;通过STRING数据库获取蛋白相互作用(PPI)网络关系数据,用Cytoscape软件绘制出PPI网络图并进行网络拓扑学分析;通过R语言对核心靶点进行基因本体(GO)分析、京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,筛选出具有显著性差异的的生物学过程及信号通路,并构建靶点-信号通路网络;最后通过AutoDockTools软件,对重要的化学成分和靶点分子进行分子对接。结果:获得黄芪仙灵脾汤药物靶点与IgA肾病靶点的交集共63个。槲皮素、山柰酚、木犀草素等是黄芪仙灵脾汤的主要活性成分,白细胞介素-6(IL-6)、肿瘤坏死因子(TNF)、白细胞介素-1β(IL-1β)等是其关键靶点,在糖尿病并发症中的作用(AGE−RAGE signaling pathway in diabetic complications)、流体剪切应力和动脉粥样硬化(fluid shear stress and atherosclerosis)、脂质和动脉粥样硬化(lipid and atherosclero⁃sis)等是关键通路。关键活性成分与关键靶点的对接亲和力介于-8.4~-7.0 kcal/mol。结论:本研究初步验证了黄芪仙灵脾汤治疗IgA肾病的药理学作用机制,揭示黄芪仙灵脾汤治疗IgA肾病具有多成分、多靶点的作用特点。展开更多
文摘目的:运用网络药理学和分子对接方法探究黄芪仙灵脾汤治疗免疫球蛋白A(IgA)肾病的作用机制。方法:在TCMSP数据库中收集黄芪仙灵脾汤各中药的活性成分及其蛋白作用靶点,通过UniProt数据库转化为基因靶点;在GeneCards、OMIM数据库中获取IgA肾病相关靶点;将黄芪仙灵脾汤与IgA肾病的交集基因,利用Cytoscape软件进行药物-成分-靶点网络构建及分析,筛选核心靶点及主要活性成分;通过STRING数据库获取蛋白相互作用(PPI)网络关系数据,用Cytoscape软件绘制出PPI网络图并进行网络拓扑学分析;通过R语言对核心靶点进行基因本体(GO)分析、京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,筛选出具有显著性差异的的生物学过程及信号通路,并构建靶点-信号通路网络;最后通过AutoDockTools软件,对重要的化学成分和靶点分子进行分子对接。结果:获得黄芪仙灵脾汤药物靶点与IgA肾病靶点的交集共63个。槲皮素、山柰酚、木犀草素等是黄芪仙灵脾汤的主要活性成分,白细胞介素-6(IL-6)、肿瘤坏死因子(TNF)、白细胞介素-1β(IL-1β)等是其关键靶点,在糖尿病并发症中的作用(AGE−RAGE signaling pathway in diabetic complications)、流体剪切应力和动脉粥样硬化(fluid shear stress and atherosclerosis)、脂质和动脉粥样硬化(lipid and atherosclero⁃sis)等是关键通路。关键活性成分与关键靶点的对接亲和力介于-8.4~-7.0 kcal/mol。结论:本研究初步验证了黄芪仙灵脾汤治疗IgA肾病的药理学作用机制,揭示黄芪仙灵脾汤治疗IgA肾病具有多成分、多靶点的作用特点。
