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食源性沙门氏菌携带质粒介导的喹诺酮类耐药基因的液相芯片检测技术研究
1
作者
杜强
黎俊宏
+5 位作者
严程
赵莹
屠博文
毛旭健
董昕
张露杰
《食品工业科技》
CAS
北大核心
2023年第9期287-295,共9页
目的:建立应用新型液相芯片技术检测食源性沙门氏菌携带的质粒介导喹诺酮类耐药(PMQR)基因中4种基因:qnrS、aac(6')-Ib-cr、oqxA、oqxB的方法。方法:针对食源性沙门氏菌携带的qnrS、aac(6')-Ib-cr、oqxA、oqxB四种PMQR基因,设...
目的:建立应用新型液相芯片技术检测食源性沙门氏菌携带的质粒介导喹诺酮类耐药(PMQR)基因中4种基因:qnrS、aac(6')-Ib-cr、oqxA、oqxB的方法。方法:针对食源性沙门氏菌携带的qnrS、aac(6')-Ib-cr、oqxA、oqxB四种PMQR基因,设计对应引物和微球,采用液相芯片技术对7株标准菌株进行特异性实验;对4株各含1种PMQR基因的食源性沙门氏菌进行重复性和灵敏度实验;然后检测来自食源性风险监测的71株耐喹诺酮类沙门氏菌,和普通PCR进行对比实验。结果:成功建立了液相芯片技术检测食源性沙门氏菌携带的qnrS、aac(6')-Ib-cr、oqxA、oqxB四种PMQR基因的方法,携带qnrS基因的耐药株检出限为5 CFU/mL、携带aac(6')-Ib-cr基因的耐药株检出限为25 CFU/mL、携带oqxA和oqxB基因的耐药株检出限为10 CFU/mL。所有阳性判定结果荧光中位值(MFI)均≥5倍阴性对照组。重复性实验变异系数(CV)均小于5%,特异性实验结果特异性100%,阴性菌株无阳性信号反应。qnrS检出率29.6%(21/71)、aac(6')-Ib-cr 35.2%(25/71)、oqxA 28.2%(20/71)、oqxB 23.9%(17/71),方法比对的结果符合率为100%。结论:实验建立的液相芯片技术检测食源性沙门氏菌质粒介导喹诺酮类耐药基因qnrS、aac(6')-Ib-cr、oqxA、oqxB的方法具有灵敏度高、特异性好、稳定性强、结果准确的特点,可以为食源性沙门氏菌PMQR基因的检测以及耐药性的监控提供技术支撑。
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关键词
液相芯片技术
xMAP
xTAG
PMQR
食源性沙门氏菌
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职称材料
题名
食源性沙门氏菌携带质粒介导的喹诺酮类耐药基因的液相芯片检测技术研究
1
作者
杜强
黎俊宏
严程
赵莹
屠博文
毛旭健
董昕
张露杰
机构
常州市疾病预防控制中心
昆明理工大学医学院
出处
《食品工业科技》
CAS
北大核心
2023年第9期287-295,共9页
基金
xMAP技术在食源性沙门氏菌耐药基因快速检测中的应用研究(Y2018023)
常州地区禽流感病毒遗传进化及其分子特征分析(CJ201900071)
+3 种基金
常州市科技应用基础计划(中资助)(CJ20200105)
江苏省第十六批六大人才高峰高层次人才项目(SWYY-230)
江苏省卫生健康委科研课题面上项目(H2018098)
常州市重大科技支撑计划社会发展项目(CE20185048)。
文摘
目的:建立应用新型液相芯片技术检测食源性沙门氏菌携带的质粒介导喹诺酮类耐药(PMQR)基因中4种基因:qnrS、aac(6')-Ib-cr、oqxA、oqxB的方法。方法:针对食源性沙门氏菌携带的qnrS、aac(6')-Ib-cr、oqxA、oqxB四种PMQR基因,设计对应引物和微球,采用液相芯片技术对7株标准菌株进行特异性实验;对4株各含1种PMQR基因的食源性沙门氏菌进行重复性和灵敏度实验;然后检测来自食源性风险监测的71株耐喹诺酮类沙门氏菌,和普通PCR进行对比实验。结果:成功建立了液相芯片技术检测食源性沙门氏菌携带的qnrS、aac(6')-Ib-cr、oqxA、oqxB四种PMQR基因的方法,携带qnrS基因的耐药株检出限为5 CFU/mL、携带aac(6')-Ib-cr基因的耐药株检出限为25 CFU/mL、携带oqxA和oqxB基因的耐药株检出限为10 CFU/mL。所有阳性判定结果荧光中位值(MFI)均≥5倍阴性对照组。重复性实验变异系数(CV)均小于5%,特异性实验结果特异性100%,阴性菌株无阳性信号反应。qnrS检出率29.6%(21/71)、aac(6')-Ib-cr 35.2%(25/71)、oqxA 28.2%(20/71)、oqxB 23.9%(17/71),方法比对的结果符合率为100%。结论:实验建立的液相芯片技术检测食源性沙门氏菌质粒介导喹诺酮类耐药基因qnrS、aac(6')-Ib-cr、oqxA、oqxB的方法具有灵敏度高、特异性好、稳定性强、结果准确的特点,可以为食源性沙门氏菌PMQR基因的检测以及耐药性的监控提供技术支撑。
关键词
液相芯片技术
xMAP
xTAG
PMQR
食源性沙门氏菌
Keywords
liquid-phase chip technology
xMAP
xTAG
Plasmid-mediated quinolone resistance
foodborne Salmonella
分类号
TS207.4 [轻工技术与工程—食品科学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
食源性沙门氏菌携带质粒介导的喹诺酮类耐药基因的液相芯片检测技术研究
杜强
黎俊宏
严程
赵莹
屠博文
毛旭健
董昕
张露杰
《食品工业科技》
CAS
北大核心
2023
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