基于线粒体COI与16S rRNA基因序列探讨贻贝属的系统发育

比较分析了贻贝属5个种的线粒体DNA COI及16S rRNA基因片段序列,确定了贻贝属的系统进化关系。以翡翠贻贝(Perna viridis)和条纹隔贻贝(Septifer virgatus)为外群,基于距离法(NJ)、最大简约法(MP)、最大似然法(ML)、贝叶斯演绎法(BI)及贝叶斯联合模型分析法构建分子系统树。系统发育分析结果表明,5种贻贝[Mytilus edulis,紫贻贝(M.galloprovincialis),盖勒贻贝(M.trossulus),厚壳贻贝(M.coruscus),加州贻贝(M.californianus)]在系统树上聚为2支。加州贻贝最为原始,厚壳贻贝次之。其中,紫贻贝和M.edulis具有很近的亲缘关系,而厚壳贻贝和加州贻贝的亲缘关系近。研究结果为贻贝属物种进化、迁移及其育种研究提供了理论基础。

浙江和福建沿海厚壳贻贝Mytilus coruscus群体的COI序列比较分析

基于线粒体DNA COI基因序列分析了浙江和福建沿海的厚壳贻贝Mytilus coruscus群体遗传结构及遗传多样性现状。研究结果显示：在长度为564bp的COI基因片段上，厚壳贻贝的5个群体均呈现较高的单倍型多样度（0．867±0．129～1．000±0．177）和较低的核苷酸多样度（0．007±0．005～0．011±0．008）；邻接关系树显示，5个群体的单倍型相互混杂，仅有1个小的分支存在；厚壳贻贝单倍型网络关系图呈星状结构，存在1个与系统树相对应的分支；不同群体间的FST值较小，且统计检验的结果均不显著，表明浙江、福建沿岸的厚壳贻贝群体间在COI基因上存在同质性；Tajima’s D和Fu’s Fs中性检验的结果（Tajima＇s D=-1．828，P=0．017；Fs=-22．954，P=0．000）都显著偏离中性，提示厚壳贻贝经历了群体扩张。