VLDL-受体的配体结合结构域结构分析

极低密度脂蛋白受体(VLDL-R)的配体结合域具有8个富含半胱氨酸的配体结合重复序列(ligand-binding repeats,LBR),被认为是与配体结合的部位。该受体与含7个类似重复序列的低密度脂蛋白受体(LDL-R)的配体结合特性明显不同。为了明确VLDL-R中8个LBR在配体结合中的作用并探讨结合位点的结构,本研究采用计算机辅助蛋白质结构预测方法,在二级结构分析的基础上,通过同源建模方法预测受体N-端328个氨基酸的配体结合域空间结构,结果显示该区域呈现弧形口袋样结构,其中前3个LBR结构紧凑,呈棒状,负电荷相对集中,推测这一特征结构是配体结合的重要结构基础,结构分析同时表明在LBR5与LBR6之间连接区的弹性结构可以赋予结合位点一定的伸缩性,利于其与不同配体的结合。本研究预测结果首次提出了VLDL-R配体结构域结构及结合位点的结构特征,并与已有的实验结果一致。