儿童手足口病重症病例影响因素的病例对照研究

目的:探讨儿童手足口病(hand-foot-mouth disease,HFMD)重症病例发生的影响因素。方法:采用性别、年龄、入院时间的1∶2匹配的方法对江苏省南京、镇江、扬州、常州市级医疗机构收治的手足口重症病例和轻症病例进行问卷调查,数据分析采用Cox比例风险模型进行单因素和多因素分析。手足口病原学的检测采用PCR方法进行确认。结果:单因素分析显示:发病-入院天数(OR=1.668,95%CI:1.307～2.128)、发热(OR=5.181,95%CI:1.939～13.844)、发热持续天数(OR=1.562,95%CI:1.1421～2.135)、颈项强直(OR=3.188,95%CI:1.055～9.634)、白细胞计数偏高(OR=1.038,95%CI:1.013～1.064)、中性粒细胞计数偏高(OR=1.235,95%CI:1.108～1.378)、Enterovirus 71(EV71)阳性感染(OR=5.069,95%CI:2.472～10.393)是儿童患手足口重症的危险因素,淋巴细胞计数增高(OR=0.968,95%CI:0.944～0.992)、Coxsackievirus A16(CoxA16)阳性(OR=0.191,95%CI:0.094～0.388)患手足口重症的风险比例较小;多因素分析结果显示:发病-入院天数、WBC计数偏高、中性粒细胞计数偏高是儿童患手足口重症的危险因素,其OR值分别为1.668(95%CI:1.122～2.477)、1.304(95%CI:1.080～1.575)、1.088(95%CI:1.001～1.184);CoxA16阳性的儿童患手足口重症的风险比例较小,其OR值为0.169(95%CI:0.038～0.753)。结论:加强对手足口患儿的临床监测和病原学监测,早期诊断,早期治疗,可以有效预防手足口患儿发展成重症的可能性。

江苏省2009年甲型H1N1流感流行病学及病原学特征分析

目的:探讨2009年度江苏省甲型H1N1流感流行特点及其病原遗传学特征。方法:对2009年6月12日～10月15日在"甲型H1N1流感监测系统"中报告确诊的1888例病人信息进行描述性分析,并对3例输入性病例分离的病毒进行全基因组序列分析。结果:甲型H1N1流感输入后疫情呈现上升趋势,36周达到高峰,随后疫情有所下降;苏南、苏中、苏北地区的确诊病例数占总病例数的构成比分别为48.18%、29.45%、22.14%,全省甲型H1N1流感病例主要集中于学生和青壮年人群。3例输入性病例分离毒株的8个基因片段核苷酸序列同源性高达99%～100%。与参考株相比,分离株A/Nanjing/1/2009HA蛋白突变的5个氨基酸中有一个位于Ca抗原位点208位氨基酸(R→K)。分离株同时具有人、禽和猪流感病毒的分子特点,不具备高致病性禽流感病毒的分子基础。结论:江苏省甲型H1N1流感输入后疫情发展存在地区差异,学生和青壮年人群是主要的发病群体;随着病毒在人群中的进一步适应和持续存在,除了抗原漂移外,病毒的某些分子特征也可能发生变化,应特别关注这些变化对病毒的传播力和致病性的影响。

甲型H1N1流感重症病例的危险因素

目的:分析甲型H1N1流感患者发生重症临床表现的危险因素。方法:调查江苏省2009年6～12月间甲型H1N1流感确诊病例,利用统一设计的调查表收集信息,应用SAS9.1.3软件进行单因素和多因素非条件Logistic回归分析重症危险因素和风险比值比(OR值)。结果:单因素Logistic回归分析显示,年龄、发病与首次就诊时间间隔、体重指数(BMI)、妊娠和慢性基础性疾病史为导致重症的影响因素(P<0.01)。多因素Logistic回归分析显示,年龄、发病与首次就诊时间间隔、BMI和慢性基础性疾病史进入了最终模型(P<0.05),其中慢性基础性疾病史对模型贡献最大(标准化回归系数β=0.72),其他依次为年龄(β=0.43)、BMI(β=0.35)和发病与首次就诊时间间隔(β=0.25)。因素合并分析显示,发病风险随着危险因素数量的增加而增加,存在剂量效应关系(P<0.01)。结论:有慢性基础性疾病史、5岁以下儿童和年龄较大者、超重或肥胖者为甲型H1N1流感重症高危人群,感染甲型H1N1流感应尽量早期就诊,减少重症情况的发生。

20例人感染新型布尼亚病毒病的临床和流行病学特征分析

目的分析人感染新型布尼亚病毒病的临床特点和流行病学特征,为制定预防控制措施提供依据。方法采用统一的诊断标准和流行病学个案调查表对病例进行调查。结果 2010年江苏省境内报告的33例疑似病例中有20例确诊人感染新型布尼亚病毒病,病死率为30%。临床表现主要为发热(100%)、乏力(80%)、畏寒和呕吐(60%);血常规检查有血小板计数减少(100%)和白细胞计数减少(90%);病例多来自丘陵地区,以男性、中老年、农民为主,发病时间呈两个高峰,分别为6～7月和9～10月,部分病例发病前有明确的蜱叮咬史。结论 SFTS病例发病初期临床症状不典型,发病有地域特征,散发病例多见,但不排除人与人传播的可能。

江苏省手足口病病原阳性检出率相关因素及病原学特征

目的:了解江苏省手足口病(Hand-foot-mouth disease,HFMD)肠道病毒阳性检出率相关因素,并对其EV71病毒的VP1基因特征进行分析。方法:在2008年4～12月份,通过监测哨点医院收集全省手足口病病例的咽拭子、粪便或肛拭子、疱疹液、脑脊液、血清标本,并填写病例相关基本信息。结果:共采集手足口病病例的各种类型标本2082份,咽拭子、肛拭子、疱疹液、粪便、脑脊液、血清的总肠道病毒阳性检出率分别为53.52%、41.12%、40.74%、27.27%、25.00%、9.80%,EV71阳性检出率分别为47.03%、30.84%、33.33%、22.73%、25.00%、2.94%,CoxA16阳性检出率分别为5.34%、8.41%、3.70%、0.00%、0.00%、6.68%,不同类型标本的肠道病毒阳性检出率和阳性检出构成均有差异(P值均<0.0001)。总肠道病毒阳性检出率在发病后第2天最高(56.59%),不同发病与采样时间间隔的总肠道病毒阳性检出率和EV71病毒阳性检出率均有统计学意义(P值分别为0.0019、0.0139),而与CoxA16阳性检出率没有统计学意义(P=0.2558)。总肠道病毒阳性检出率在就诊后第2天最高(59.90%),不同就诊与采样时间间隔的总肠道病毒与EV71病毒阳性检出率有统计学差异(P值分别为0.0228、0.0333),与CoxA16阳性检出率没有统计学差异(P=0.3958)。分离的4株EV71病毒均为C4.3基因亚群。结论:标本类型、采样与发病时间间隔、采样与诊断时间间隔均与手足口病病例的肠道病毒阳性检出率密切相关,分离的EV71毒株为C4亚型。

一起敬老院戊肝暴发疫情的流行病学调查

目的了解一起敬老院戊型肝炎(HE)暴发疫情的可能传染源,明确该起疫情的病原特点。方法对疫点和相关人员进行现场访谈和病例对照研究,并采集116人份血标本进行抗-HEV IgM和抗-HEV-IgG检测,通过RT-PCR对病毒感染者和可疑传染源进行HEV RNA检测和序列分析。结果本次疫情共发病19例,亚临床感染11人。病例对照研究显示是否使用公共餐具P=0.062,自带餐具者无感染;人源、水源、猪源HEV毒株均为HEV-Ⅳd亚型,水源和人源毒株同源性100%,人源毒株与猪源同源性93.7%～95.5%。该敬老院自养生猪和自种菜地并施粪肥;食堂操作不规范,可能导致携带HEV的猪粪或污水污染餐具,是引起本起疫情的原因。结论该起暴发疫情与当地生猪HEV病毒携带率高,疫点食堂卫生管理欠规范有关。

江苏省一起急性胃肠炎爆发的疫情调查(英文)

目的调查和分析一起发生在江苏省常州市某小学急性胃肠炎爆发疫情,明确流行病学特征和基因型特征。方法根据统一设计的流行病学调查表,对病例和对照的饮食、饮水和卫生习惯等情况开展病例对照研究。对病例的排毒情况进行跟踪调查,明确排毒期长短。采集病例和对照的标本,进行荧光定量PCR方法检测,对部分阳性结果标本进行测序以明确基因型。结果 11月22日起出现首例病例,11月22日至12月2日为主要发病阶段。此期共发病269例,其中学生发病264例,罹患率17.4%,教师发病5例,罹患率4.4%,两者存在统计学差异(χ2=13,P<0.01);排毒期调查结果显示,本起暴发疫情最短排毒期为发病后3d,最长为14d,中位时间为7d。共采集172份标本,其中82份检测结果为诺如病毒GII型阳性,未检测到轮状病毒及腺病毒,18份诺如病毒GII型阳性标本测序分析显示均为GII.12基因型。结论结合病例临床特征、流行病学调查及实验室检测结果综合分析,判定本起疫情为诺如病毒GII.12型感染导致的急性胃肠炎爆发疫情,该型别在我省尚为首次发现。爆发原因可能为呕吐物-口引起的大范围传播。

江苏省2013年甲型H1N1(09pdm)流感病毒血凝素和神经氨酸酶分子特征分析

目的 ：分析江苏省2013年甲型H1N1（09pdm）流感病毒血凝素（hemagglutinin,HA）和神经氨酸酶（neuraminidase,NA）变异情况,分析其遗传进化特征。方法 ：按照流感样病例定义,收集江苏省各哨点医院流感样病例标本,阳性样本经病毒分离培养及亚型鉴定。选取2013年不同时间段、不同地区具有代表性的14株甲型H1N1（09pdm）阳性毒株,利用特异性引物扩增HA、NA基因,测序并分析其遗传进化特征。结果 ：14株分离毒株与疫苗株A/California/07/2009（H1N1）的HA基因核苷酸和氨基酸同源性分别为97.6%~98.4%和96.5%~98.0%。NA基因核苷酸和氨基酸同源性分别为98.4%~98.9%和97.0%~98.5%。遗传进化分析表明,14株分离株HA和NA基因分属于不同的进化谱系。分子特征表现为HA氨基酸序列出现D114N、K300E、E516K的变异,NA分子特征表现为N44S位点变异。从2013年左右开始甲型H1N1（09pdm）流感基因多样性增加;通过FEL模型得到一个正向压力选择HA氨基酸位点310,一个正向压力选择NA氨基酸位点4,通过REL模型得到9个正向压力选择HA氨基酸位点179、180、239、301、303、310、311、312、313（含位点310）,5个正向压力选择NA氨基酸位点4、23、52、287、374（含位点4）。HA蛋白具有9个潜在糖基化位点,7个位于HA1上,2个位于HA2上;NA蛋白共有9个潜在糖基化位点。14株分离毒株在NA蛋白酶活性中心及周围辅助位点上均未发现变异。结论：2013年江苏省甲型H1N1（09pdm）流感HA、NA基因变异加快,遗传多样性增加,未来的遗传进化值得进一步关注。

江苏省2004～2011年感染性腹泻病流行特征分析

目的:分析江苏省感染性腹泻病流行特征,为综合防控措施的科学制订和综合监测工作的有效开展提供科学依据。方法:对2004～2011年江苏省感染性腹泻病的发病情况和近5年各类感染性腹泻病的病原学监测结果进行分析,对全省所有县及县以上医疗机构在感染性腹泻病实验室检测方面的相关工作开展情况进行调查。结果:2004～2010年全省感染性腹泻病发病率呈现逐年下降趋势,2011年发病率有所反弹,年平均发病率43.79/10万;2004年以来其他感染性腹泻病在感染性腹泻病中所占的构成比增加趋势明显;感染性腹泻病总体呈较为典型的夏季高峰,但伤寒+副伤寒的季节分布近8年中有6年在8、9、10月呈现"V"字型分布,有一定的特殊性和规律性;各类感染性腹泻病的职业分布集中在农民、散居儿童、学生和工人4类人群;发病以男性为主,性别构成比逐年略有增加;随着年龄段上升发病率逐渐下降;报告发病率和实验室检测工作开展率均为苏南高于苏中,苏中高于苏北。病原学监测结果显示,近年来,我省霍乱和痢疾的菌群和菌型分布有所变化,伤寒+副伤寒菌群和菌型分布较为稳定。结论:江苏省感染性腹泻病近年来得到了较好的控制,总体和各分类病种发病特征有一定的规律性和趋势性,今后除继续做好此类传染病的监测和防控工作外,应进一步加强腹泻类传染病病原检测能力、提高实验室诊断率和病原学诊断结果的报告率。

江苏省病毒性乙型肝炎流行趋势GIS空间分析

目的探讨江苏省2003-2009年乙肝疫情空间分布规律,分析影响乙肝流行的因素,为乙肝的预防和控制提供理论依据。方法建立江苏省2003-2009年乙肝发病数据库,应用GIS对乙肝疫情进行空间自相关分析、时空聚类分析及趋势面分析。结果全局自相关结果显示从整体研究区域来看江苏省乙肝发病呈集聚性分布;乙肝高发地区集聚于中部及西南部地区,其中2004-2006年乙肝疫情以南京市为中心,包含28个县区,呈高度聚集;建立乙肝发病趋势面分析图,2003-2009年江苏省乙肝发病在东西方向呈微弱的倒U形分布趋势,而从南向北方向呈缓慢下降趋势。结论江苏省乙肝发病有明显的地域分布规律,应根据乙肝发病空间分布特点,制定相应的防治措施。

江苏省1996-2010年人狂犬病疫情分析

目的分析1996-2010年江苏省人狂犬病流行特征与流行趋势。方法用描述流行病学方法对江苏省人狂犬病疫情资料进行分析。结果 1996年以来江苏省出现了全省范围的狂犬病流行,疫情呈迅速的定向扩散,波及全省82.3%的县级行政区;1996-2010年报告病例占同期中国大陆的5.1%,死亡病例排在所有法定报告传染病前4位;同期1 235例人狂犬病统计,农民占73.1%,男女性别比2.0∶1,报告病例数集中于15岁以下和35～75岁年龄范围。结论江苏省处于我国重要的狂犬病流行区,人狂犬病的大范围流行表明犬间疫情的流行强度较高,如果不能有效控制犬间狂犬病的流行,人间疫情很难得到控制。

江苏省HIV/AIDS时空流行特征分析

目的分析江苏省HIV/AIDS时空流行特征,为制定防控策略和措施提供参考。方法以GIS为基础,结合时空扫描分析技术对江苏省1997-2011年HIV/AIDS疫情的动态趋势及变化特征进行综合分析。结果 1997-2011年全省累计报告HIV/AIDS病例6174例,流行水平呈逐年增长的长期趋势。单纯时间扫描分析发现2008-2011年存在一个聚类区域(RR=7.81,LLR=2900.53,P<0.0001)。单纯空间扫描分析结果显示,1997-2003年间HIV/AIDS病例空间分布无聚集性,2004-2011年间每年均探测到2-4个聚类区域,主要分布在苏南地区,并且覆盖区县数逐渐增多。时空二维扫描分析探测到3个时空聚类区域:一类聚集区发生在2008-2011年(RR=6.97,LLR=1744.48,P<0.0001),聚类区县主要分布在南京、无锡等苏南地区;二类时空聚集区中一个发生在2008-2011年(RR=4.21,LLR=731.11,P<0.0001),聚类区县主要分布在苏南的苏州、无锡以及苏中的南通地区;另一个二类聚集区发生在2005-2011年(RR=5.14,LLR=206.06,P<0.0001),仅覆盖徐州铜山区。结论江苏省HIV/AIDS疫情仍处于较低的流行水平,但2008年以来疫情迅速攀升,防控形势严峻。HIV/AIDS病例在时间、空间两个维度均呈聚集性分布,南京、苏州、无锡、常州等苏南地区需要重点防制,苏中、苏北地区存在局部高发的区县,应予以高度关注。

一起皮肤炭疽疫情病原的实验室检测及毒力基因鉴定

目的对2012年江苏省连云港市赣榆县一起皮肤炭疽疫情的病人临床标本及病牛肉标本进行快速分子诊断及毒力基因的鉴定。方法用Real-time PCR方法对病人的血、焦痂标本及病牛肉标本进行炭疽杆菌染色体编码的rpoB基因及质粒PXO1、PXO2上pag、capA基因的检测,并对质粒上4种毒力基因(cya,pag,lef,cap)进行扩增并测序。结果病人焦痂标本和病牛肉标本中均检测出rpoB基因和质粒PXO1、PXO2基因,4种毒力基因的测序结果证实扩增序列为炭疽杆菌质粒基因片段,病人标本与病牛肉标本的基因序列完全一致。结论实验室检测结果证实此次皮肤炭疽疫情是由当地村民宰杀携带炭疽杆菌强毒株的病牛引起。

肠道病毒71型灭活疫苗上市后安全性监测与评价

目的 评价不同细胞基质制备的肠道病毒71型（EV71）灭活疫苗上市后常规免疫安全性。 方法 EV71灭活疫苗疑似预防接种异常反应（AEFI）数据来源于中国免疫规划信息管理系统，为2017年接种EV71 灭活疫苗后江苏省报告的监测数据；受种儿童人口学信息和接种剂次数来源于江苏省预防接种信息管理系统。 结果 2017年江苏省共接种EV71灭活疫苗316 889剂，报告AEFI 208例，报告发生率为65.64/10万剂（95% CI ：56.72/10万剂～74.56/10万剂），其中一般反应55.54/10万剂（95% CI ：47.34/10万剂～63.74/10万剂），异常反应 7.89/10万剂（95% CI ：4.80/10万剂～10.98/10万剂）；不同细胞基质的疫苗AEFI发生率（χ 2 =35.61， P ＜0.01）和一般反应发生率（χ 2 =34.09， P ＜0.01）差异有统计学意义，异常反应发生率差异无统计学意义（χ 2 =1.88， P =0.17），均未见严重异常反应，208例AEFI均未住院且均痊愈。EV71灭活疫苗（Vero细胞）首剂接种一般反应发生率高于第二剂（χ 2 =6.94， P ＜0.01），不同季度接种EV71灭活疫苗（人二倍体细胞）一般反应发生率差异有统计学意义（χ 2 =18.86， P ＜0.01）。 结论 不同细胞基质的EV71灭活疫苗在常规免疫接种中AEFI发生率均不高，有良好的安全性；一般反应以发热为主，异常反应以过敏性-荨麻疹、过敏性皮疹和过敏性斑丘疹等过敏性反应为主。

BP神经网络在痢疾发病趋势预测中的应用研究

目的研究BP神经网络在痢疾发病趋势预测中的应用。方法用江苏省1995～2010年的痢疾月发病数作为试验数据,采用不同的样本构建策略进行BP模型拟合,从不同网络结构的模型中选择最优模型对2011年的痢疾发病数进行预测分析。结果最终选择的BP神经网络模型结构为:以过去3年同期发病数为网络输入,当前周期发病数为对应的期望输出,隐含层神经元数目为8个。模型预测值与实际值的平均绝对误差率为7.97%。据此模型推算,2011年全省痢疾发病数为5515例,将延续2004年以来逐年下降的长期趋势。结论 BP神经网络很好的拟合了痢疾发病的动态趋势,预测效果理想,可用于常规预测分析。采用历史同期发病数为网络输入,当前周期发病数为期望输出的样本构建策略在具有明显季节性发病特征的传染病神经网络预测分析中具有推广意义。

发热伴血小板减少综合症病毒核酸快速检测方法的建立与应用

目的建立发热伴血小板减少综合症病毒(severe fever with thrombocytopenia syndrome virus,SFTSV)核酸快速检测方法,并对276例SFTSV疑似感染病例进行检测。方法 SFTSV JS3株基因组相对保守的序列,设计针对其S片段引物及Taqman探针,建立常规RT-PCR和real-time RT-PCR检测方法,进行敏感性,特异性试验,用2种方法分别对276例SFTSV疑似感染病例进行检测。结果常规RT-PCR和real-time RT-PCR两种核酸检测方法都有较好的特异性,对阳性对照核酸检测限分别为1.0×10-4和1.0×10-3 TCID50。疑似病例中,常规RT-PCR和real-time RT-PCR分别检出30份和41份阳性,阳性率为10.9%和14.9%。后者的检出率比前者高(P<0.05)。结论成功的建立了SFTSV核酸快速检测方法,为SFTSV感染的防治提供了有力的依据。

CUSUM模型在流行性腮腺炎早期预警中的应用研究

目的探讨累积和控制图模型(cumulative sum control chart,CUSUM)在流行性腮腺炎早期预警中的应用价值,为流行性腮腺炎的应急防制提供科学依据,也为其他传染病突发公共卫生事件的预警研究提供参考和借鉴。方法以江苏省各区县每日发病数为基础,从2012年1月1日起以CUSUM模型进行前瞻性试验,用灵敏度、特异度、及时性等3个指标对预警结果进行评价,并比较CUSUM模型预警与国家传染病自动预警系统(CIDARS)之间的优劣。结果应用CUSUM模型进行预警分析全年共产生1688条预警信号,比自动预警系统产生的信号数少35.30%。CUSUM模型预警灵敏度为100%、特异度为95.84%,均高于自动预警系统(χ2=6.087,P=0.0136;χ2=602.48,P<0.0001);CUSUM模型预警及时性的中位数为3.5天,自动预警系统为6天,两者无统计学差异(Z=0.9173,P=0.3590)。结论江苏省腮腺炎疫情数据CUSUM模型预警分析效果优于自动预警系统,且有进一步提高的空间。

江苏省2009年手足口病流行特征的聚类分析

目的:描述和分析江苏省2009年手足口病的流行特征。方法:利用"中国疾病预防控制信息系统"数据库,统计2009年江苏省手足口病各月发病数,不同年龄组及不同地区发病率,根据《江苏统计年鉴—2009》所提供的影响手足口病发病的社会经济因素相关资料,采用系统聚类方法分别对其进行统计分析。结果:江苏省2009年手足口病不同月份的发病数、15岁以下年龄组的发病率、不同地区的发病率及社会经济影响均聚集成3类。结论:江苏省手足口病流行具有明显的季节性、人群性以及地区性;聚类分析可以作为判定手足口病流行特征的一种统计方法。

基于GroEL基因的实时荧光定量PCR检测恙虫病东方体方法的建立及评价

目的建立一种敏感、特异的实时荧光定量PCR方法,用于检测临床标本中的恙虫病东方体。方法根据恙虫病东方体GroEL蛋白基因序列设计引物和探针,建立实时荧光定量PCR检测方法。并从灵敏度、特异度、重复性及临床标本的检测能力等方面对本方法进行综合评价。结果建立的实时荧光定量PCR方法具有良好的特异性,可检测出恙虫病东方体Gilliam、Karp、Kato和Kawasaki株。建立的标准曲线循环阈值(Ct)与模板拷贝数呈现良好的线性关系(r=0.99),灵敏度分析显示样品最低检出浓度为21.8拷贝/μL。批内及批间重复性实验变异系数均小于1.5%,显示本方法具有良好的重复性。对本实验室保存的82份临床标本进行检测,并与常规巢式PCR方法比较,本方法检测出26份阳性标本中的25份,检出率为96.15%。结论本研究建立的实时荧光定量PCR方法具有较高的敏感性、特异性和稳定性,可用于临床病人及暴发疫情的实验室快速检测。

江苏省2010年O1群霍乱疫情分离株病原学特征分析

目的 :分析2010年江苏省O1群霍乱疫情分离株病原学特征,为霍乱疫情分析及临床治疗提供实验室依据。方法 :对2010年江苏省O1群霍乱疫情分离株进行毒力基因检测、ctx B基因序列分析、抗生素敏感性实验、脉冲场凝胶电泳分子分型分析。结果:2010年江苏省O1群霍乱疫情分离株均携带毒力基因ctx A、ace、zot、tox R、tcp I、omp U、rtx C、tcp AEL、hly AEL,且CTXB氨基酸序列为古典型;对庆大霉素、诺氟沙星、环丙沙星100%敏感,对复方新诺明、链霉素100%耐药,且均为多重耐药株;除VC201014外,其余14株菌脉冲场凝胶电泳图谱相似度达100%。结论:2010年9月初至10月初,发生在江苏省徐州、淮安、宿迁、南京4个地市的O1群霍乱疫情可能是有关联的暴发流行,2010年8月底发生在连云港的O1群霍乱疫情是一起散发疫情,与上述四地的霍乱疫情可能没有流行病学关联,所有疫情的病原均为非典型埃尔托型霍乱弧菌,庆大霉素、诺氟沙星、环丙沙星可作为临床治疗的首选药物。