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受磷蛋白的空间结构及其分子动力学模拟
1
作者
汤孛
巩克
+2 位作者
王靖方
李亦学
魏冬青
《科学通报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2010年第9期773-778,共6页
受磷蛋白通过可逆的磷酸化来调控肌浆网钙泵活性,它在生物体中的空间结构一直是一个受关注的焦点.本文通过总结受磷蛋白空间结构的研究进展,利用分子动力学方法对其空间结构进行了系统的模拟和研究.我们将核磁共振所得到的风铃草结构单...
受磷蛋白通过可逆的磷酸化来调控肌浆网钙泵活性,它在生物体中的空间结构一直是一个受关注的焦点.本文通过总结受磷蛋白空间结构的研究进展,利用分子动力学方法对其空间结构进行了系统的模拟和研究.我们将核磁共振所得到的风铃草结构单链的前22个残基取出,并且分别保持原始结构;而对第16位进行磷酸化,第9位进行单点突变,从而得到3个不同的肽段.通过在水环境中进行10ns的分子动力学模拟,我们发现原始结构的第3~15个残基很好地保持了螺旋结构,而第16位残基的磷酸化和第9位残基的突变会减少周围残基呈现螺旋状态的几率,这与一些具体实验中的结论一致.这一变化也可能是降低受磷蛋白对肌浆网钙泵活性抑制作用的原因.
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关键词
受磷蛋白
空间结构
磷酸化
单点突变
螺旋结构
分子动力学模拟
原文传递
题名
受磷蛋白的空间结构及其分子动力学模拟
1
作者
汤孛
巩克
王靖方
李亦学
魏冬青
机构
上海交通大学生命科学与技术学院
上海交通大学系统生物医学研究院
出处
《科学通报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2010年第9期773-778,共6页
基金
国家高技术研究发展计划生物信息专项(编号:2007AA02Z333)
国家重点基础研究发展计划(编号:2005CB724303)
+1 种基金
国家自然科学基金(批准号:30870476
20773085)资助项目
文摘
受磷蛋白通过可逆的磷酸化来调控肌浆网钙泵活性,它在生物体中的空间结构一直是一个受关注的焦点.本文通过总结受磷蛋白空间结构的研究进展,利用分子动力学方法对其空间结构进行了系统的模拟和研究.我们将核磁共振所得到的风铃草结构单链的前22个残基取出,并且分别保持原始结构;而对第16位进行磷酸化,第9位进行单点突变,从而得到3个不同的肽段.通过在水环境中进行10ns的分子动力学模拟,我们发现原始结构的第3~15个残基很好地保持了螺旋结构,而第16位残基的磷酸化和第9位残基的突变会减少周围残基呈现螺旋状态的几率,这与一些具体实验中的结论一致.这一变化也可能是降低受磷蛋白对肌浆网钙泵活性抑制作用的原因.
关键词
受磷蛋白
空间结构
磷酸化
单点突变
螺旋结构
分子动力学模拟
分类号
Q51 [生物学—生物化学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
受磷蛋白的空间结构及其分子动力学模拟
汤孛
巩克
王靖方
李亦学
魏冬青
《科学通报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2010
0
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已选择
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