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蓝圆鲹雌雄性腺转录组比较分析
1
作者
廖书嘉
陈佳慧
+6 位作者
汤应时
杨少森
温瀚
李水生
甘松永
吴锦辉
张勇
《海南热带海洋学院学报》
2024年第5期1-10,26,共11页
蓝圆鲹(Decapterus maruadsi)是我国一种具有广泛的综合应用价值的重要经济鱼类。本研究对蓝圆鲹的精巢和卵巢进行了转录组测序分析。研究结果显示,共检测出27925个基因,其中87.38%的基因与参考基因组中的基因相对应。通过进一步分析得...
蓝圆鲹(Decapterus maruadsi)是我国一种具有广泛的综合应用价值的重要经济鱼类。本研究对蓝圆鲹的精巢和卵巢进行了转录组测序分析。研究结果显示,共检测出27925个基因,其中87.38%的基因与参考基因组中的基因相对应。通过进一步分析得到21692个差异表达基因(DEGs),其中849个DEGs在卵巢表达,6290个DEGs在精巢表达,14553个DEGs在卵巢和精巢共表达。其中精巢特异性表达的基因cdcd42、ccdc172和gas8与精子形成相关,而代谢相关基因(如LARP6和USP37等)可能为精子形成提供能量。基因Dmrt1在精巢中的表达,表明它可能在性别分化过程中扮演着至关重要的角色。卵巢特异性表达的基因如GLRA4和电压门控钾通道基因可能参与卵子成熟和发育。神经递质受体和离子通道基因的表达表明它们可能在性激素合成和卵巢发育调控中发挥作用。共表达基因如bmp2、bmp3、cyp17a1、cyp19a和StAR对性腺发育和第二性征维持至关重要。KEGG分析显示,多种信号通路如Hedgehog、PPAR等信号通路在配子生成和胚胎发育中显著富集。本研究为理解蓝圆鲹性腺发育的分子机制奠定了坚实基础。
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关键词
蓝圆鲹
转录组
性腺
差异表达基因
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职称材料
题名
蓝圆鲹雌雄性腺转录组比较分析
1
作者
廖书嘉
陈佳慧
汤应时
杨少森
温瀚
李水生
甘松永
吴锦辉
张勇
机构
中山大学生命科学学院
中山大学广东省水生经济动物良种繁育重点实验室
广东省农业技术推广中心
出处
《海南热带海洋学院学报》
2024年第5期1-10,26,共11页
基金
广东省科技计划项目(2023B1212060023)
南方海洋科学与工程广东省实验室(珠海)科研项目(SML2023SP201)。
文摘
蓝圆鲹(Decapterus maruadsi)是我国一种具有广泛的综合应用价值的重要经济鱼类。本研究对蓝圆鲹的精巢和卵巢进行了转录组测序分析。研究结果显示,共检测出27925个基因,其中87.38%的基因与参考基因组中的基因相对应。通过进一步分析得到21692个差异表达基因(DEGs),其中849个DEGs在卵巢表达,6290个DEGs在精巢表达,14553个DEGs在卵巢和精巢共表达。其中精巢特异性表达的基因cdcd42、ccdc172和gas8与精子形成相关,而代谢相关基因(如LARP6和USP37等)可能为精子形成提供能量。基因Dmrt1在精巢中的表达,表明它可能在性别分化过程中扮演着至关重要的角色。卵巢特异性表达的基因如GLRA4和电压门控钾通道基因可能参与卵子成熟和发育。神经递质受体和离子通道基因的表达表明它们可能在性激素合成和卵巢发育调控中发挥作用。共表达基因如bmp2、bmp3、cyp17a1、cyp19a和StAR对性腺发育和第二性征维持至关重要。KEGG分析显示,多种信号通路如Hedgehog、PPAR等信号通路在配子生成和胚胎发育中显著富集。本研究为理解蓝圆鲹性腺发育的分子机制奠定了坚实基础。
关键词
蓝圆鲹
转录组
性腺
差异表达基因
Keywords
Decapterus maruadsi
transcriptome
gonads
differentially expressed gene
分类号
S917.4 [农业科学—水产科学]
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题名
作者
出处
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被引量
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1
蓝圆鲹雌雄性腺转录组比较分析
廖书嘉
陈佳慧
汤应时
杨少森
温瀚
李水生
甘松永
吴锦辉
张勇
《海南热带海洋学院学报》
2024
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