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香榧花粉TgPUX10基因克隆与表达
1
作者
汤天羽
汪承巧
+3 位作者
刘佳乐
曹岳英伦
张瑞
吴家胜
《东北林业大学学报》
CAS
北大核心
2025年第2期58-65,共8页
以香榧(Torreya grandis‘Merrillii’)花粉RNA反转录的cDNA为模板,利用RT-PCR技术分离出一条类似拟南芥PUX10-like cDNA序列,命名为TgPUX10,并对该基因进行鉴定、克隆、表达分析。结果表明:TgPUX10基因的完整开放阅读框(ORF)为1437 bp...
以香榧(Torreya grandis‘Merrillii’)花粉RNA反转录的cDNA为模板,利用RT-PCR技术分离出一条类似拟南芥PUX10-like cDNA序列,命名为TgPUX10,并对该基因进行鉴定、克隆、表达分析。结果表明:TgPUX10基因的完整开放阅读框(ORF)为1437 bp,编码477个氨基酸残基。TgPUX10蛋白的氨基酸序列包含UBA、HP、UAS、UBX功能结构域。通过构建瞬时表达载体,并利用拟南芥悬浮细胞转化体系,发现TgPUX10蛋白定位于油体细胞器。在花粉萌发的0、2、4 d时,油体相关基因TgOLE及TgCLO的表达量呈下降趋势,TgPUX10的表达量显著上升,证明TgPUX10影响香榧花粉萌发,且参与油体的降解过程。TgPUX10在各品种香榧中表达较为保守。与其他品种相比,细榧(Torreya grandis‘xifei’)的花粉活性较高,萌发率达到35.5%。
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关键词
香榧
TgPUX10基因
生物信息学分析
亚细胞定位
下载PDF
职称材料
基于16S rRNA基因分析虫草寄主蝠蛾的系统进化关系
被引量:
2
2
作者
彭树英
李俊
+7 位作者
万胜豪
汪敏
汪玲
汪承巧
韩蒙蒙
汪雨晨
耿雪侠
张海军
《淮北师范大学学报(自然科学版)》
CAS
2020年第1期59-65,共7页
为了解虫草寄主昆虫的系统进化关系,基于线粒体DNA(mtDNA)16S rRNA基因对7种虫草寄主蝠蛾、2种其他蝠蛾及其他科蛾类的系统进化关系进行研究.用ClustalX 2.1软件对11种蝠蛾16S rRNA基因进行序列对位排列,DAMBE软件分析基因序列的碱基组...
为了解虫草寄主昆虫的系统进化关系,基于线粒体DNA(mtDNA)16S rRNA基因对7种虫草寄主蝠蛾、2种其他蝠蛾及其他科蛾类的系统进化关系进行研究.用ClustalX 2.1软件对11种蝠蛾16S rRNA基因进行序列对位排列,DAMBE软件分析基因序列的碱基组成及AT或GC偏斜性.用MEGA 7.0统计不同基因序列间的位点数目以及蝠蛾科蝠蛾种间遗传间距,并以果蝇(Drosophila yakuba)做外群,构建分子系统进化树.结果表明:11种蝠蛾的16S rRNA基因序列进行比对排列后,共1411 bp,其A+T的平均含量为85.3%,保守位点1054个,简约位点143个,可变位点310个.11种蝠蛾种间遗传距离为0.005~0.117,其中人支蝠蛾与阿尔泰蝠蛾和贡嘎蝠蛾的种间遗传距离均为0.005,Triodia sylvina与蒲氏钩蝠蛾遗传距离最大(0.117).分别以16S rRNA和16S rRNA联合COⅠ基因构建分子系统树,分析表明蝠蛾科虫草寄主蝠蛾间的关系较近,而与其他蛾类关系较远,其亲缘关系远近与其地理分布有一定关系,与形态学分类观点相吻合.以上结果说明,16S rRNA基因是适用于虫草寄主蝠蛾分类研究的一种有效标记基因.
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关键词
16S
rRNA基因
虫草
寄主昆虫
蝙蝠蛾科
系统进化
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职称材料
题名
香榧花粉TgPUX10基因克隆与表达
1
作者
汤天羽
汪承巧
刘佳乐
曹岳英伦
张瑞
吴家胜
机构
省部共建亚热带森林培育国家重点实验室(浙江农林大学)
出处
《东北林业大学学报》
CAS
北大核心
2025年第2期58-65,共8页
基金
国家重点研发计划项目(2022YFD2200400)。
文摘
以香榧(Torreya grandis‘Merrillii’)花粉RNA反转录的cDNA为模板,利用RT-PCR技术分离出一条类似拟南芥PUX10-like cDNA序列,命名为TgPUX10,并对该基因进行鉴定、克隆、表达分析。结果表明:TgPUX10基因的完整开放阅读框(ORF)为1437 bp,编码477个氨基酸残基。TgPUX10蛋白的氨基酸序列包含UBA、HP、UAS、UBX功能结构域。通过构建瞬时表达载体,并利用拟南芥悬浮细胞转化体系,发现TgPUX10蛋白定位于油体细胞器。在花粉萌发的0、2、4 d时,油体相关基因TgOLE及TgCLO的表达量呈下降趋势,TgPUX10的表达量显著上升,证明TgPUX10影响香榧花粉萌发,且参与油体的降解过程。TgPUX10在各品种香榧中表达较为保守。与其他品种相比,细榧(Torreya grandis‘xifei’)的花粉活性较高,萌发率达到35.5%。
关键词
香榧
TgPUX10基因
生物信息学分析
亚细胞定位
Keywords
Torreya grandis
TgPUX10 gene
Bioinformatics analysis
Subcellular localization
分类号
Q785 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
基于16S rRNA基因分析虫草寄主蝠蛾的系统进化关系
被引量:
2
2
作者
彭树英
李俊
万胜豪
汪敏
汪玲
汪承巧
韩蒙蒙
汪雨晨
耿雪侠
张海军
机构
淮北师范大学生命科学学院资源植物生物学安徽省重点实验室
出处
《淮北师范大学学报(自然科学版)》
CAS
2020年第1期59-65,共7页
基金
2018省级大学生创新创业训练计划项目(201810373103)
2019年度安徽省自然科学基金项目(1908085MC86)
淮北师范大学开放实验重点项目(2019年度)
文摘
为了解虫草寄主昆虫的系统进化关系,基于线粒体DNA(mtDNA)16S rRNA基因对7种虫草寄主蝠蛾、2种其他蝠蛾及其他科蛾类的系统进化关系进行研究.用ClustalX 2.1软件对11种蝠蛾16S rRNA基因进行序列对位排列,DAMBE软件分析基因序列的碱基组成及AT或GC偏斜性.用MEGA 7.0统计不同基因序列间的位点数目以及蝠蛾科蝠蛾种间遗传间距,并以果蝇(Drosophila yakuba)做外群,构建分子系统进化树.结果表明:11种蝠蛾的16S rRNA基因序列进行比对排列后,共1411 bp,其A+T的平均含量为85.3%,保守位点1054个,简约位点143个,可变位点310个.11种蝠蛾种间遗传距离为0.005~0.117,其中人支蝠蛾与阿尔泰蝠蛾和贡嘎蝠蛾的种间遗传距离均为0.005,Triodia sylvina与蒲氏钩蝠蛾遗传距离最大(0.117).分别以16S rRNA和16S rRNA联合COⅠ基因构建分子系统树,分析表明蝠蛾科虫草寄主蝠蛾间的关系较近,而与其他蛾类关系较远,其亲缘关系远近与其地理分布有一定关系,与形态学分类观点相吻合.以上结果说明,16S rRNA基因是适用于虫草寄主蝠蛾分类研究的一种有效标记基因.
关键词
16S
rRNA基因
虫草
寄主昆虫
蝙蝠蛾科
系统进化
Keywords
16S rRNA gene
Ophiocordyceps sinensis
host insect
Hepialidae
phylogenetic evolution
分类号
Q963 [生物学—昆虫学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
香榧花粉TgPUX10基因克隆与表达
汤天羽
汪承巧
刘佳乐
曹岳英伦
张瑞
吴家胜
《东北林业大学学报》
CAS
北大核心
2025
0
下载PDF
职称材料
2
基于16S rRNA基因分析虫草寄主蝠蛾的系统进化关系
彭树英
李俊
万胜豪
汪敏
汪玲
汪承巧
韩蒙蒙
汪雨晨
耿雪侠
张海军
《淮北师范大学学报(自然科学版)》
CAS
2020
2
下载PDF
职称材料
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