间变性胶质细胞瘤中免疫浸润核心基因ZAP70与患者预后的相关性研究

目的探索间变性胶质细胞瘤中有预后价值的免疫浸润相关基因。方法下载TCGA(The Cancer Genome Atlas)数据库中转录组数据,量化间变性胶质细胞瘤样本的免疫浸润情况,并分为低、中、高免疫浸润组,进而对组间的差异基因进行分析,筛选出预后相关的核心基因ZAP70。研究ZAP70表达量与间变性胶质细胞瘤患者生存时间以及临床特征的关系,利用免疫组织化学染色验证ZAP70在临床间变性胶质细胞瘤样本中的表达量与患者预后的关系。通过GSEA(Gene Set Enrichment Analysis)富集分析了解ZAP70在间变性胶质细胞瘤中的相关功能通路。结果TCGA数据库中236例间变性胶质细胞瘤样本被分为低、中、高3个免疫浸润组,低免疫浸润组的预后最佳,中免疫浸润组次之,高免疫浸润组的预后最差。差异分析与单因素Cox回归分析筛选出ZAP70为间变性胶质细胞瘤免疫浸润相关的核心基因。K-M生存曲线显示,ZAP70高表达间变性胶质细胞瘤患者生存时间显著少于ZAP70低表达患者(P<0.05)。高表达ZAP70与多种不良的临床特征相关。61例临床间变性胶质细胞瘤样本的免疫组化染色分析验证了高表达ZAP70预后不佳的趋势。GSEA富集分析结果显示高表达ZAP70与耐药、细胞粘附、细胞外基质反应及恶性通路激活相关。在肿瘤免疫方面,ZAP70与白细胞迁移及固有免疫缺失相关。结论ZAP70有望成为间变性胶质细胞瘤患者中预后不佳亚群的诊断标记物及有效治疗靶点。

人脑胶质瘤lncRNA PIK3CD-AS2表达及临床意义

目的探讨lncRNA PIK3CD-AS2在人脑胶质瘤中的表达及临床意义。方法计算机检索TCGA和GTEx数据库关于PIK3CD-AS2在胶质瘤和正常脑组织中表达的RNA数据,应用生物信息学方法分析PIK3CD-AS2表达与胶质瘤病人预后的关系。收集2010年9月至2015年6月我院手术切除的胶质瘤组织127例以及2018年1月至2019年10月颅脑损伤内减压术中切除的正常脑组织38例,qRT-PCR检测PIK3CD-AS2表达量。127例胶质瘤病人随访至2020年6月或病人死亡,分析PIK3CDAS2表达与胶质瘤病人预后的关系。结果生信分析和临床病例分析结果显示,与正常脑组织相比,胶质瘤组织PIK3CD-AS2表达显著升高(P<0.05);胶质瘤WHO分级越高,PIK3CD-AS2的表达水平也越高(P<0.05);PIK3CD-AS2高表达是胶质瘤病人预后不佳的独立预测因子(P<0.05),PIK3CD-AS2高表达病人总生存期显著低于PIK3CD-AS2低表达病人(P<0.05)。结论PIK3CD-AS2在胶质瘤中高表达,可作为胶质瘤病人的预后标志物。