厦门禽类标本禽流感病毒检出率的相关因素分析

目的探索厦门禽类标本禽流感病毒阳性检出率的相关因素。方法在2011年1月-2014年7月间,收集厦门市禽类外环境标本,采用荧光定量RT-PCR方法对标本进行核酸检测,分析禽流感病毒阳性检出率的相关因素。结果 593份标本中,检出禽流感阳性178份,阳性率为30%,来源于城乡活禽市场的标本高于家禽规模养殖场和家禽散养户的标本,禽类饮水、清洗禽类污水、笼具表面擦拭标本和案板表面擦拭标本阳性率较禽类粪便标本高,第一季度标本的阳性率高于其余季度的标本,标本送检及时,阳性率越高。结论监测场所、标本种类、标本采集时间、标本送检是否及时与禽流感病毒阳性检出率相关。

2004-2013年厦门市流感病原监测结果分析

目的：分析2004-2013年厦门市流感监测结果，了解流感病毒的流行规律，为科学制定防制措施提供依据。方法对厦门市流感监测哨点医院的流感病例样本极其病原检出情况用描述性流行病学方法进行分析。结果2004-2013年，厦门市共采集流感样病例标本8726份，检出1402株流感病毒，检出率为16．07％，其中季节性流感H1N1共111份，季节性流感H3N2共353份，甲型H1N1流感518份，B型流感420份，不同年份和月份流感活动水平和病原构成差异有统计学意义（ P＜0．001）。结论厦门市流感活动水平和病原构成变化较快，应加强监测。

流感样病例中流感病毒阳性检出率的相关因素分析

目的了解流感样病例中流感病毒阳性检出率的相关因素。方法 2011-2013年,通过流感监测网络收集厦门市流感哨点医院和流感聚集性或暴发疫情的流感样病例咽拭子标本3 091份,填写病例相关基本信息,采用荧光定量RT-PCR方法对标本进行核酸检测,分析流感病毒阳性检出率的相关因素。结果 3 091份标本中,流感病毒阳性484份,总阳性率为15.7%,其中小学和初中学生标本的阳性率最高,聚集性或爆发疫情的标本高于哨点医院的标本、第1和第2季度的标本高于第3和第4季度的标本,标本送检越及时,阳性率越高。结论研究对象职业、标本来源、标本采集时间、标本送检是否及时与流感病毒阳性检出率相关。

禽类外环境H7N9禽流感病毒检出率及其影响因素

目的探索禽类外环境标本H7N9禽流感病毒阳性检出率的影响因素。方法 2014年1月—2015年4月间,通过监测网络收集厦门市禽类外环境标本886份,填写标本相关信息,采用荧光定量RT-PCR方法对标本进行核酸检测,分析H7N9禽流感病毒阳性检出率的相关因素。结果 886份标本来源于69个监测点,检出H7N9阳性标本113份,阳性率为12.8%,39个监测点有H7N9阳性标本检出,阳性率为56.52%;来源于活禽市场的标本高于家禽规模养殖场和家禽散养户的标本,禽类饮水和清洗禽类污水检出率最高;标本送检越及时,阳性率越高;活禽市场采取休市后,若清洗和消毒不到位,短期内外环境仍有H7N9禽流感病毒检出,但人群发病数仍可迅速减少。结论人感染H7N9疫情流行前期,各地应通过合理布点提早开展禽类外环境监测,根据监测结果尽早采取各项干预措施;疫情流行期间,重点关注活禽市场,外环境中一旦检出H7N9禽流感病毒,要及时采取休市或关闭活禽市场等措施。

2011年-2014年厦门市环境和职业暴露人群禽流感监测分析

目的了解厦门环境禽流感病毒分布情况及职业暴露人群高致病性禽流感病毒感染情况。方法采用实时RT-PCR对环境标本进行禽流感病毒核酸检测;采用血凝抑制试验对职业暴露人群血清标本进行H5N1抗体检测,2014年增加H7N9抗体检测。结果环境标本A型流感病毒阳性率为40.08%,各病原阳性率由高到低依次为H9(33.97%)、H7(5.22%)、H5(3.82%)。25家城乡活禽市场,H9阳性24家,H7阳性15家,H5阳性11家;6处家禽散养户集中的地区,H9和H5阳性各1处;4家家禽规模养殖场(户)均无阳性。H9阳性率以12月-次年1月最高。5种类型标本阳性率由高到低依次为宰杀或摆放禽肉案板表面的擦拭标本(50.00%)、禽类饮水(44.88%)、清洗禽类的污水(44.44%)、笼具表面擦拭标本(44.38%)、粪便(34.27%)。574份职业暴露人群血清H5N1、H7N9抗体均阴性。结论厦门市城乡活禽市场存在H9、H7、H5;家禽散养户集中的地区仅个别地区个别时间存在H9和H5;家禽规模养殖场(户)未发现禽流感病毒。职业暴露人群未发现H5N1和H7N9感染。

厦门市人群A群C群脑膜炎奈瑟菌抗体水平调查

目的了解厦门市人群A群、C群脑膜炎奈瑟菌(Nm-A、Nm-C)抗体水平,为流脑防控提供依据。方法 2016年,分层随机采集厦门市常住人口2 112份血清样本,用酶联免疫吸附试验(ELISA)检测Nm-A、Nm-C的IgG水平。结果厦门市人群Nm-A、Nm-C抗体阳性率分别为97.8%和88.7%(年龄性别标化后为98.9%和92.8%)。除了6月龄至<1岁组,各年龄组Nm-A抗体阳性率均≥90%;Nm-C抗体阳性率≥3岁组均≥90%,而<3岁组的抗体阳性率则较低,在0~、6~和12~月龄组中,Nm-C抗体阳性率分别为15.0%、47.0%和76.5%。结论厦门市人群对A、C群流脑有较高的免疫力,但<3岁婴幼儿Nm-C抗体阳性率较低,建议将6月龄婴儿接种A+C流脑蛋白结合苗纳入免疫规划,以进一步提高人群免疫水平。

厦门地区17株B型流感病毒的基因组测序分析

目的了解2015年厦门地区17株B型流感病毒的基因组序列特征。方法利用高通量测序对17株B型流感病毒进行全基因组序列测定,并分析基因进化特性。结果成功获得17株B型流感病毒的全基因组序列,其中Yamagata系病毒16株,Victoria系病毒1株。与WHO推荐的疫苗株B/Massachusetts/2/2012比较,Yamagata系病毒的HA和NA氨基酸序列均发生了变异。结论厦门地区人群中流行的乙型流感病毒的抗原性和基因特性在逐渐发生变异,HA和NA基因序列部分位点与疫苗株存在差异,可能导致其抗原性发生改变。

霍乱弧菌H2C全基因组测序及序列分析

目的 了解霍乱弧菌产毒株的基因序列,为霍乱基因组学研究提供资料,对可能发生的公共卫生突发事件提供保障。方法 利用Illumina Hiseq测序平台对1株霍乱弧菌(Vibrio cholerae)H2C进行了全基因组测序,对基因组进行组装、基因预测和功能注释。结果 H2C基因组大小为4.09 Mb,GC含量为47.34%,预测编码基因3 642个。在H2C基因组中注释到3 252个基因具有直系同源蛋白簇分类,共查到111个tRNA和9个rRNA基因。与代谢通路相关基因2 366个,与毒力相关基因417个。通过KEGG定位到RTX、CTX和TCP毒力相关基因簇。结论 霍乱弧菌H2C携带多种毒力相关基因,对该菌致病性及环境适应性起到关键作用。