甲酰胺水溶液的分子动力学模拟

为了解重要的生化模型甲酰胺在水溶液中的微观结构,采用全原子力场在全浓度范围内对甲酰胺溶液进行了分子动力学模拟,得到了溶液的径向分布函数,分析计算了溶质和溶剂分子间的相互作用,对甲酰胺和水分子的氢键缔合情况进行了分析.研究发现羰基侧的H原子与水分子能形成C—H…O弱相互作用.在作者早期的研究中发现,此相互作用对于阻碍甲酰胺的异构化具有重要意义,特别是当甲酰胺在溶液中含量增大时,此相互作用更加不能忽视.全浓度溶液的模拟表明,甲酰胺在稀浓度区可以促进水局部结构的增强,随FM浓度增加,由水的自身缔合转变为水与FM的交叉缔合,在FM高浓度区,两者的交叉缔合将逐渐被甲酰胺自身的线状缔合代替.