2018-2021年新疆维吾尔自治区乌鲁木齐市5岁以下住院患儿病毒性腹泻病原学特征分析

目的分析新疆维吾尔自治区(新疆)乌鲁木齐市<5岁腹泻住院患儿病毒性腹泻流行病学及病原学特证,为病毒性腹泻病的防控工作提供依据。方法收集2018年1月至2021年12月乌鲁木齐市哨点医院<5岁因腹泻住院患儿粪便标本和相关流行病学信息,采用实时荧光定量聚合酶链式反应检测方法筛查标本中的A组轮状病毒(RVA)、诺如病毒(NV)、札如病毒(SaV)、星状病毒(AstV)和肠道腺病毒(EAdV)5种病毒的核酸。采用巢式反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)方法对RVA和NV进行G和P基因分型检测。结果4年共检测粪便标本1173份,检出阳性865份,总阳性率为73.7%,4年5种病毒阳性率分别为RVA(40.8%、54.4%、53.2%、53.9%),NV(20.4%、18.5%、22.6%、26.8%),EAdV(11.%、12.7%、8.6%、13.4%),AstV(2.8%、3.0%、0.5%、2.9%)和SaV(3.8%、4.9%、0.5%、2.6%)。其中单一病毒构成比分别为83.9%、75.5%、75.0%、76.8%,混合感染构成比分别为16.1%、24.5%、25.0%、23.2%。不同月龄段分布中,13~24月龄段检出率最高79.3%(371/468),37~59月龄段阳性率最低60.3%(73/119),不同月龄段中阳性率差异有统计学意义(χ^(2)=24.482,P<0.001)。男女性之间阳性率分别为72.9%(510/700)、75.1%(355/473),不同性别间差异有统计学意义(χ^(2)=1173.000,P<0.001)。冬春季高发分别为86.0%(259/301)、82.4%(229/278)。4个不同季度间阳性率差异有统计学意义(χ^(2)=102.576,P<0.001)。农村患儿阳性率为74.5%(184/247),高于城市患儿73.5%(681/926),城市和农村间阳性率差异有统计学意义(χ^(2)=1173.000,P<0.001)。RVA阳性病例中G9P[8]型处于优势地位82.1%(485/591),NV中GⅡ基因型为主94.9%(243/256)。结论RVA和NV是乌鲁木齐市<5岁腹泻住院患儿的主要病原,2岁以下婴幼儿是RVA免疫接种的重点人群,根据优势病原和高发季节,对该地区采取有针对性的防控措施。

2012-2014年乌鲁木齐市5岁以下急性腹泻儿童患者诺如病毒感染及基因型研究

目的了解2012—2014年新疆维吾尔自治区(新疆)乌鲁木齐市<5岁住院儿童患者诺如病毒的分子流行病学特征。方法收集2012—2014年乌鲁木齐市895例<5岁急性腹泻儿童患者粪便标本和流行病学资料,应用实时荧光反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)进行诺如病毒检测,阳性样本通过RT-PCR扩增、测序和序列分析。结果诺如病毒的检出率为16.8%(150/895),不同年份阳性率差异有统计学意义(χ2=21.080,P<0.05);不同年龄组阳性率差异有统计学意义(χ2=13.367,P=0.020)。137份样本获得聚合酶区序列,其中89份获得衣壳蛋白区序列。聚合酶区和衣壳区分别包括11和9个基因型。根据89株双分型结果,GⅡ.4 Den Haag 2006b和GⅡ.Pe/GⅡ.4 Sydney 2012分别占21.3%和32.6%,GⅡ.P12/GⅡ.3占29.2%。根据衣壳区分型结果,在GⅡ.4基因型中,2012—2014年GⅡ.4 DenHaag 2006b所占比例分别为90.0%、0%和0%;GⅡ.Pe/GⅡ.4Sydney 2012所占比例分别为10.0%、100%和100%。结论新疆乌鲁木齐市急性腹泻儿童诺如病毒具有遗传多样性;GⅡ.Pe/GⅡ.4 Sydney 2012在新疆地区出现,逐渐替代GⅡ.4 DenHaag 2006b成为新的流行优势株。

2017-2019年新疆维吾尔自治区乌鲁木齐市5岁以下腹泻住院患儿诺如病毒分子流行病学特征

目的了解2017—2019年新疆维吾尔自治区(新疆)乌鲁木齐市5岁以下腹泻住院患儿诺如病毒的分子流行病学特征。方法收集2017—2019年乌鲁木齐市5岁以下腹泻住院患儿粪便标本和相应临床资料,应用实时荧光反转录聚合酶链式反应(real time RT-PCR)进行诺如病毒核酸检测,阳性样本通过RT-PCR扩增、测序和序列分析,并结合临床资料分析流行病学特征。结果腹泻住院患儿粪便标本核酸检测阳性率为25.20%(246/976),不同年份阳性率差异有统计学意义(χ^(2)=40.724,P<0.0001);0.5~1岁年龄组最高(30.61%,101/330),不同年龄组阳性率差异无统计学意义。110份样本获得ORF1/ORF2重叠区序列,包括7个基因型,其中GⅡ.4 Sydney[P31]为流行优势株,占59.09%(65/110),其次是GⅡ.3[P12](18.18%,20/110)和GⅡ.2[P16](17.27%,19/110),其他型别包括GⅡ.6[P7](2.72%,3/110)、GⅡ.4 Sydney[P16](0.91%,1/110)、GⅡ.1[P16](0.91%,1/110)和GⅠ.4[P4](0.91%,1/110)。GⅡ.2[P16]自2017年第二季度出现,在2019年第三季度成为流行优势株。结论在新疆地区诺如病毒是引起5岁以下儿童腹泻的主要病原之一,GⅡ.4 Sydney[P31]、GⅡ.3[P12]和GⅡ.2[P16]是该地区流行的主要基因型。

2018-2020年乌鲁木齐市婴幼儿病毒性腹泻监测及病原学分析

目的分析乌鲁木齐市2018-2020年<5岁婴幼儿病毒性腹泻流行病学与病原学特征,为本地区病毒性腹泻防控提供参考依据。方法收集2018-2020年乌鲁木齐市哨点医院门诊<5岁婴幼儿病毒性腹泻流行病学信息和粪便标本,用实时荧光定量PCR方法检测A组轮状病毒(RV)、札如病毒(SAV)、诺如病毒(NV)、肠道腺病毒(EADV)和星状病毒(ASV)核酸,并用反转录聚合酶链反应(RT-PCR)检测A组RV基因分型。结果445份标本中病毒阳性率分别为A组RV 45.02%、NV 10.33%、EADV 9.04%、SAV 5.35%、ASV 1.29%,混合感染率为28.97%,7~12月龄组阳性率最高为69.8%,25~36月龄组最低为2.4%。不同季节A组RV、SAV、ASV阳性率差异有统计学意义(χ^(2)=37.582、21.047、17.685,均P<0.001),A组RV 12月份和1月份检出高峰。A组RV的G血清型以G9为主占61.8%,P血清型以P[8]为主占87.7%;NV基因型以GⅡ型为主,3年检出率分别为93.54%、88.64%、100.00%;病毒性腹泻冬春季高发分别为26.5%、28.5%。结论乌鲁木齐市2018-2020年<5岁婴幼儿病毒性腹泻中,2岁以下阳性率最高,A组RV和NV病毒为主要病原。

2016-2017年乌鲁木齐市5岁以下婴幼儿轮状病毒感染状况及病原学分析

目的调查2016-2017年新疆维吾尔自治区(新疆)乌鲁木齐市<5岁婴幼儿轮状病毒(RV)流行趋势和病原学特征,为婴幼儿RV防控提供依据。方法收集2016年1月1日至2017年12月31日乌鲁木齐市儿童医院因腹泻住院的597例婴幼儿患者的流行病学资料和粪便标本,用酶联免疫吸附试验(ELISA)检测RV抗原,并用反转录–聚合酶链式反应(RT-PCR)检测RV核酸和基因分型。结果 A群RV抗原阳性率为32.5%(194/597),对阳性病例标本进一步进行基因分型分析,检测出G1~4型、G9型等,以G9型最为常见,阳性检出率为11.6%(69/597)。检出P[4]型、P[6]型、P[8]型等,以P[8]型最多,阳性检出率为22.7%(44/194)。G、P基因型组合中G3P[8](31.4%)、G9P[8](25.3%)、G2P[4](18.0%)、G1P[8](8.8%)检出较多。13~18月龄组RV阳性率最高(40.0%)、0~6月龄组RV阳性率最低(23.4%),不同月龄组间RV阳性率差异有统计学意义(χ~2=13.698,P=0.033)。2016年和2017年RV阳性率分别为35.8%(108/302)、29.2%(86/295)(χ~2=2.971,P=0.085)。城市患儿RV阳性率为32.8%(173/527),高于农村患儿30.0%(21/70)(χ~2=0.225,P=0.635)。结论乌鲁木齐市婴幼儿对RV普遍易感,RV毒株基因型呈多样性,以G3P[8]型为主,居住城市、年龄为1~2岁组婴幼儿是接种疫苗防控的重点人群。

2008-2016年乌鲁木齐市5岁以下腹泻住院儿童轮状病毒感染状况调查

目的分析2008-2016年乌鲁木齐市5岁以下腹泻患儿轮状病毒（rotavirus，RV）感染流行病学特征及病原学特征。方法收集2008年1月至2016年12月乌鲁木齐市某儿童医院因腹泻住院的2461例5岁以下患儿流行病学资料，并采集粪便标本。采用ELISA法检NBV，对阳性标本进行核酸提取并采用RT—PCR法进行毒株分型鉴定。结果研究对象Rv阳性检出率为45．1％（1110／2461）。对阳性病例分型鉴定，G分型有G1、G2、G3、G4、G8和G9；P分型有P[41、P[6]、P[8]和P[10]。GP基因型组合中，G9P[8]、G3P[8]、G2P[4]和G1P[8]检出较多，分别占40．3％（180／447）、26．4％（118／447）、13．6％（61／447）和10．3％（46／447）。研究对象阳性检出率的高峰年龄为9-11月龄（55．2％，264／478）。Rv阳性检出率最高为10月（65．0％，134／206），最低为7月（37．9％，110／290）。城市（46．3％，920／1988）、农村（37．8％，131／347）和城乡结合部（46．8％，59／126）患儿RV阳性检出率差异有统计学意义（χ2=8．83，P=0．012）。结论2008—2016年乌鲁木齐市5岁以下腹泻患儿RV阳性检出率较高，毒株基因型呈现多样性，优势株为G9P[8]。冬春季节、小月龄组、居住在城市或城乡结合部儿童是防控重点。

乌鲁木齐市某哨点医院婴幼儿病毒性腹泻症候群病原学检测

目的分析2013年1月—2016年12月新疆乌鲁木齐市某哨点医院婴幼儿病毒性腹泻症候群病人的流行病学及病原学特征,为制定病毒性腹泻的预防控制措施提供依据。方法收集2013年1月—2016年12月乌鲁木齐市某哨点医院门诊5岁以下腹泻患儿的流行病学资料及粪便标本274份,检测粪便标本中的人轮状病毒(human rotavirus,HRV)、人杯状病毒(human caliciviruses,HuCV、星状病毒(astrovirus,AstV)和肠道腺病毒(enteral adenovirus,EAdV),采用酶联免疫吸附试验(ELISA)检测HRV并进行G/P基因分型,同时提取核酸;采用RT-PCR方法检测HRV,HuCV,AstV和EAdV4种病毒的核酸。结果HRV,HuCV,AstV和EAdV病原体的检出率分别为45.3%(124/274),4.7%(13/274),1.8%(5/274)和1.1%(3/274);HRV和HuCV全年各月均可检出,其中HRV中G型以G9和G3为主,P型以P8为主,有明显的季节特征、发病高峰在秋冬季;阳性病例中城市患儿占91.0%(132/145)、农村患儿占9.0%(13/145),差异有统计学意义(χ^2=6.388,P<0.05)。结论乌鲁木齐市哨点医院婴幼儿病毒性腹泻的主要病原是HRV,不同类别病毒感染的流行病学及病原学特点不同;秋冬季节在小月龄组和城市居住的儿童中实施防控措施是今后防控工作的重点。

2008-2011年新疆维吾尔自治区5岁以下腹泻儿童人杯状病毒感染分析

目的了解新疆5岁以下腹泻儿童人杯状病毒感染的流行特征。方法收集2008-2011年新疆782份5岁以下腹泻儿童粪便标本，利用RT-PCR方法进行杯状病毒检测。结果杯状病毒阳性率为12．7％，其中男性儿童中为12．4％，女性为13．1％；2008-2011四年阳性率分别为11．3％、16．0％、11．9％和11．5％；城镇地区为12．1％，农村地区为16．0％；不同年度、地区和性别之间差异均无统计学意义。5岁以下儿童中，6月以下、6-12月、1-2岁、〉2岁年龄组阳性率分别为10．2％、15．6％、13．8％、3．0％，差异有统计学意义（x2=8．149，P〈0．05）。结论杯状病毒感染是引起新疆5岁以下儿童腹泻的主要病原之一，2008-2011年间的阳性率为12．7％，2岁以下儿童感染风险最高。

四种商品化诺如病毒实时荧光RT-PCR检测试剂盒的效果比较

目的比较四种商品化诺如病毒实时荧光RT-PCR检测试剂盒的效果。方法将美国疾控中心诺如病毒检测方法作为标准方法,使用4种商品化试剂盒对30份已知诺如病毒基因型阳性样本(5种GI和8种GII基因型)和50份腹泻患者粪便样本进行检测,对检测结果进行比较。同时对轮状病毒、星状病毒、肠道腺病毒和札如病毒进行特异性检测。结果30份已知基因型样本四种商品化试剂盒与标准方法均检测阳性。轮状病毒、星状病毒、肠道腺病毒和札如病毒检测阴性。试剂盒A、B、C、D和标准方法分别检测50份腹泻样本,检出率分别为52.0%(26/50)、46.0%(23/50)、50.0%(25/50)、48.0%(24/50)、54.0%(27/50);试剂盒A、B、C、D与标准方法的一致性分别为96.3%、85.2%、92.6%和88.9%。试剂盒C的GI检测范围为10^4~10^8 copies/μL,GII检测范围为10^2~10^8 copies/μL。结论四种试剂盒均能检测本研究出现的诺如病毒基因型,试剂盒A和C检测效果优于试剂盒B和D。