自然发生SARS病例的病毒基因溯源分析

目的SARS病毒基因分型特别有助于病毒的溯源和控制。方法对GenBank登记的SARS病毒和SARS样病毒等有关病毒序列进行了分析,以牛冠状病毒,鸟冠状病毒和冠状病毒科的Breda病毒为外组,构建了SARS病毒和SARS样病毒系统进化树,并进行单核苷酸变异分析。结果发现两次SARS自然流行的病毒可分为两个明显不同的聚类;首次把第二次流行时从人类中分离的SARS病毒和从果子狸等动物中分离的SARS样病毒分为H和P基因型;H/P型的主要依据在病毒的非结构多蛋白基因序列而不是Spike基因序列。结论两次SARS自然流行的病毒可能以不同的特性感染人类而不是简单的重复。结合流行病学资料,对第二次流行时的SARS病毒进行分子水平的溯源分析,前两例指标患者的病毒和果子狸等动物的SARS样病毒基因序列的直接关系仍不明确。并对SARS病毒的原型、蝙蝠中的冠状病毒牵连等提出了一些新的观点。

应用多重PCR技术鉴定食源性沙门菌血清型的研究

目的:建立多重PCR技术鉴定食源性鼠伤寒沙门菌血清型的方法。方法:从60株菌株中随机选取4株食源性的沙门菌(分别命名为84号,95号,99号和06号),采用多重PCR法扩增其鞭毛抗原(H抗原)I相鞭毛素编码基因fliC和II相鞭毛素编码基因fljB,经测序比对鉴定各菌株的血清型。结果:多重PCR技术鉴定结果与生化鉴定法结果完全一致,84号菌株血清型模式为1,4:z4,12:e,h:1,2,其血清型为S.Saintpaul;95号血清型模式为1,4,12:i:1,2,其血清型为S.Typhimurium;99号菌株血清型模式为6,8:z4,z23:e,n,z15,其血清型为S.Chailey;06号菌株血清型模式为8,20:i:z6,不能确定其血清型。此外,测序结果还发现上述菌株存在新的变异位点。结论:本研究建立的多重PCR技术结果可靠,操作方便,适用于食品中沙门菌血清型的鉴定。