目的 基于网络药理学和分子对接探讨“寒凉”中药黄连、黄芩、黄柏(三黄)治疗痴呆的作用机制。方法 通过数据挖掘《宣明论方》,筛选出符合“寒凉”属性并且是治疗“痴呆症”的常见中药黄芩、黄连、黄柏。通过中药系统药理学数据库与分...目的 基于网络药理学和分子对接探讨“寒凉”中药黄连、黄芩、黄柏(三黄)治疗痴呆的作用机制。方法 通过数据挖掘《宣明论方》,筛选出符合“寒凉”属性并且是治疗“痴呆症”的常见中药黄芩、黄连、黄柏。通过中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform, TCMSP)数据库检索“三黄”的有效成分和作用靶点,在GeneCards、DrugBank等数据库检索痴呆症(dementia)靶点。利用Cytoscape3.7.2构建“药物-成分-靶点”网络,用VENNY2.1获得“三黄”和痴呆症的交集靶点后,构建蛋白质互作网络(protein-protein interaction networks, PPI),利用Metascape库对核心靶点进行GO、KEGG富集分析,并构建“三黄”药物-成分-靶点-通路-疾病网络,最后利用分子对接,以反向验证“三黄”活性成分与核心靶点之间的关系。结果 筛选出“三黄”治疗痴呆症的重要活性成分有槲皮素、β-谷甾醇、小檗碱、黄连碱等,关键核心靶点有TP53、AKT1、IL6、JUN、MAPK14、TNF等。KEGG通路分析有129条,主要有AGE-RAGE信号介导的糖尿病并发症通路、PI3K-Akt信号通路、钙信号通路等;GO功能中,分子功能117条,细胞组成61条,生物过程1 366条,主要涉及配体激活转录因子活性、DNA结合转录因子结合等分子功能,膜微区、突触后膜等细胞组成,活性氧代谢过程、对脂多糖的反应、炎症反应等生物过程。分子对接结果可以看出重要活性成分与核心靶点全部对接成功。结论 本研究结果表明,“三黄”特有的药性优势,可以通过多成分、多靶点、多通路的方式治疗痴呆症,为“三黄”治疗痴呆症临床应用和机制研究提供了依据。展开更多
文摘目的 基于网络药理学和分子对接探讨“寒凉”中药黄连、黄芩、黄柏(三黄)治疗痴呆的作用机制。方法 通过数据挖掘《宣明论方》,筛选出符合“寒凉”属性并且是治疗“痴呆症”的常见中药黄芩、黄连、黄柏。通过中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform, TCMSP)数据库检索“三黄”的有效成分和作用靶点,在GeneCards、DrugBank等数据库检索痴呆症(dementia)靶点。利用Cytoscape3.7.2构建“药物-成分-靶点”网络,用VENNY2.1获得“三黄”和痴呆症的交集靶点后,构建蛋白质互作网络(protein-protein interaction networks, PPI),利用Metascape库对核心靶点进行GO、KEGG富集分析,并构建“三黄”药物-成分-靶点-通路-疾病网络,最后利用分子对接,以反向验证“三黄”活性成分与核心靶点之间的关系。结果 筛选出“三黄”治疗痴呆症的重要活性成分有槲皮素、β-谷甾醇、小檗碱、黄连碱等,关键核心靶点有TP53、AKT1、IL6、JUN、MAPK14、TNF等。KEGG通路分析有129条,主要有AGE-RAGE信号介导的糖尿病并发症通路、PI3K-Akt信号通路、钙信号通路等;GO功能中,分子功能117条,细胞组成61条,生物过程1 366条,主要涉及配体激活转录因子活性、DNA结合转录因子结合等分子功能,膜微区、突触后膜等细胞组成,活性氧代谢过程、对脂多糖的反应、炎症反应等生物过程。分子对接结果可以看出重要活性成分与核心靶点全部对接成功。结论 本研究结果表明,“三黄”特有的药性优势,可以通过多成分、多靶点、多通路的方式治疗痴呆症,为“三黄”治疗痴呆症临床应用和机制研究提供了依据。
