基于GBS简化基因组技术的我国家养雉鸡系统发育分析

为分析我国家养雉鸡遗传背景和起源进化关系,采用高通量简化基因组测序方法对我国家养6个雉鸡群体(美国七彩雉鸡、蒙古雉鸡、黑化雉鸡、白羽雉鸡、绿雉鸡、申鸿七彩雉)的分类起源关系进行分析。结果表明:获得雉鸡Clean base数据分别为330.44×10^(6)Gb,340.64×10^(6)Gb,348.50×10^(6)Gb,291.67×10^(6)Gb,286.44×10^(6)Gb和324.98×10^(6)Gb,Q20≥92%、Q30≥85%,GC分布正常,共挖掘到50078个有效SNP位点。通过系统进化树、主成分和群体遗传结构分析,6个雉鸡种群可分为两大类,申鸿七彩雉、黑化雉鸡、白羽雉鸡、绿雉鸡和美国七彩雉鸡为一类,蒙古雉鸡单独为一类。研究揭示家养雉鸡种群在长期的养殖过程中存在基因交流。