番茄果皮开裂的转录组分析

果皮开裂是造成番茄果实贮藏品质大幅度下降的关键因素。通常,果实开裂受到高温、高湿等外界条件与遗传因素(形状,大小和果皮厚度等)的双重调控。果皮开裂关键调控基因的克隆对优良番茄品种的选育至关重要,有望从源头解决番茄果实开裂的问题。本研究利用显微技术观察果皮开裂后植物细胞组织的变化,发现中果皮薄壁细胞和维管组织受到显著破坏。利用Illumina Hiseq平台对开裂前后的组织进行深度测序,发现果皮开裂后整体植物基因表达数量减少,其中上调植物基因数目1 073个,下调基因数目为972个;通过GO、KEGG和KOG对所有差异表达Reads进行功能分类和富集分析,发现果实开裂与碳代谢、次生物质代谢、信号转导及刺激响应等生命活动密切相关。本研究从细胞和转录水平解析了番茄果皮开裂的机理,也为优质番茄育种提供了良好的理论基础。