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基于数据挖掘和生物信息学探讨专利中药复方治疗酒精性肝病的用药规律及作用机制
1
作者
高松林
韦柳婷
+5 位作者
温文建
管晓
梁菲
卢容兰
覃雁
黄贵华
《科学技术与工程》
北大核心
2024年第25期10715-10725,共11页
专利中药复方是实用性较强的验方,但其治疗酒精性肝病(alcoholic liver disease,ALD)的用药规律和作用机制尚不明确。采用数据挖掘方法探讨中药专利复方治疗ALD的用药规律,运用生物信息学探索核心药对调节铁死亡治疗ALD的潜在作用机制...
专利中药复方是实用性较强的验方,但其治疗酒精性肝病(alcoholic liver disease,ALD)的用药规律和作用机制尚不明确。采用数据挖掘方法探讨中药专利复方治疗ALD的用药规律,运用生物信息学探索核心药对调节铁死亡治疗ALD的潜在作用机制。通过中医传承计算平台(V3.0)对治疗ALD的专利中药复方进行数据挖掘,提取核心药对。从GSE28619数据集、FerrDb和BATMAN-TCM数据库中获取“核心药对-ALD-铁死亡”共同分子靶点的差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)并分析其相关性和富集分析。构建机器学习模型筛选关键DEGs,构建列线图模型预测ALD的患病风险并验证。共获得229个专利中药复方,包含609味中药。高频药物有丹参、甘草等23味,以补虚药、利水渗湿药、清热药和活血化瘀药为主,丹参-山楂是核心药对。共有10个共同分子靶点DEGs,它们具有相互调控、介导促性腺激素释放激素、糖尿病并发症中晚期糖基化终产物及其受体等信号通路的作用。RF机器学习模型的预测效果最佳,磷酸丝氨酸转氨酶1(phosphoserine aminotransferase 1,PSAT1)、早期生长反应因子1(early growth response factor 1,EGR1)、醌氧化还原酶1(NADPH quinone oxidoreductase 1,NQO1)、醛酮还原酶1C3(aldo-keto reductase 1C3,AKR1C3)、JUN原癌基因(Jun proto-oncogene,JUN)是关键的DEGs。列线图模型能够准确地预测ALD的患病风险。结果表明:中药专利复方治疗ALD以扶正祛邪为基本原则,用药以补虚药为主,兼以利水渗湿、清热、活血化瘀等药物。核心药对丹参-山楂调节铁死亡治疗ALD可能与PSAT1、EGR1、NQO1等DEGs及其介导的促性腺激素释放激素、糖尿病并发症中晚期糖基化终产物及其受体等信号通路有关。
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关键词
酒精性肝病
中药专利复方
铁死亡
数据挖掘
用药规律
生物信息学
作用机制
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职称材料
基于“阳黄治胃,阴黄治脾”探讨黄疸病的辨证思路
2
作者
毕若娴
梁馨允
+1 位作者
温文建
黄贵华
《中国中医基础医学杂志》
CAS
CSCD
2024年第9期1469-1472,共4页
通过对中医古籍追本溯源和对现代医学文献深入研究,探析古今医家对黄疸病“阳黄治胃,阴黄治脾”治法其背后病机的认识。总结出黄疸病的相关脏腑主要在脾胃,与肝胆关系不大。治疗时应该注意治疗脾胃为主,兼顾他脏,同时注意脾胃分治,提炼...
通过对中医古籍追本溯源和对现代医学文献深入研究,探析古今医家对黄疸病“阳黄治胃,阴黄治脾”治法其背后病机的认识。总结出黄疸病的相关脏腑主要在脾胃,与肝胆关系不大。治疗时应该注意治疗脾胃为主,兼顾他脏,同时注意脾胃分治,提炼出黄疸的特色辨证思路及治疗方法。深入挖掘从“阳黄治胃,阴黄治脾”理论辨治黄疸之阴黄、阳黄临证特色,可以为今后中医药治疗黄疸病提供更加开阔的思路和方法。
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关键词
阳黄治胃
阴黄治脾
黄疸
阴黄
阳黄
辨证
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职称材料
基于生物信息学探讨非酒精性脂肪性肝炎铜死亡相关基因及中药预测
3
作者
高松林
张鹏
+5 位作者
梁馨允
梁菲
管晓
温文建
唐嘉扬
黄贵华
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第6期1111-1120,共10页
本研究旨在运用生物信息学方法筛选非酒精性脂肪性肝炎(non-alcoholic steatohepatitis,NASH)的铜死亡相关基因和诊断性生物标志物,并预测调控铜死亡基因治疗NASH的潜在中药。从GEO数据库获取GSE89632数据集作为训练数据集,提取NASH中...
本研究旨在运用生物信息学方法筛选非酒精性脂肪性肝炎(non-alcoholic steatohepatitis,NASH)的铜死亡相关基因和诊断性生物标志物,并预测调控铜死亡基因治疗NASH的潜在中药。从GEO数据库获取GSE89632数据集作为训练数据集,提取NASH中差异表达的铜死亡基因(differentially expressed cuproptosis-related genes,DECRGs),运用R4.2.2软件对DECRGs进行相关性分析和富集分析。基于DECRGs对NASH患者进行聚类分型,构建机器学习模型,筛选关键基因并验证。通过COREMINE数据库预测调控铜死亡基因治疗NASH的潜在中药,运用中医传承计算平台(Traditional Chinese Medicine Inheritance Computer System)v3.5软件挖掘用药规律。筛选得到9个DECRGs,DECRGs间存在相互调控的作用,富集分析发现DECRGs主要介导硫辛酸代谢、碳代谢、三羧酸循环等途径干预NASH。共识聚类将NASH患者分为3个亚型;支持向量机模型(support vector machine,SVM)为最合适的机器学习模型;NFE2L2、LIAS、GLS和GCSH和PDHB等5个与NASH最相关的铜死亡基因可作为NASH的诊断性生物标志物。在调控铜死亡基因治疗NASH的中药中,四气以寒、温、平为主,五味以苦、甘、辛味为主,主归肝、脾经,功效方面以补虚、清热、活血化瘀为主。本研究发现了NASH的铜死亡相关基因、诊断性生物标志物及对应中药的用药规律,可为中医药治疗NASH的临床应用和新药研发提供思路。
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关键词
非酒精性脂肪性肝炎
铜死亡相关基因
生物信息学
机器学习
中药预测
原文传递
桂派中医大师黄贵华教授从六经辨证论治食管瘅
4
作者
梁菲
温文建
+3 位作者
梁馨允
管晓
高松林
黄贵华
《内蒙古中医药》
2024年第10期73-76,共4页
食管瘅(胃食管反流病)为临床常见脾胃疾病,多以反酸、烧心、咽部异物感等为主要症状。本文总结了黄贵华教授以六经辨证论治食管瘅的临床经验:太阳经治以祛邪降逆之桂枝汤;阳明经治以清宣郁热之栀子豉汤;少阳经治以清透少阳邪热之小柴胡...
食管瘅(胃食管反流病)为临床常见脾胃疾病,多以反酸、烧心、咽部异物感等为主要症状。本文总结了黄贵华教授以六经辨证论治食管瘅的临床经验:太阳经治以祛邪降逆之桂枝汤;阳明经治以清宣郁热之栀子豉汤;少阳经治以清透少阳邪热之小柴胡汤;太阴经治以温补脾胃之甘草干姜汤;少阴经治以温阳散寒之四逆汤;厥阴经治以调和寒热之乌梅丸,为经方的临床应用提供了新思路。
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关键词
食管瘅
胃食管反流
六经辨证论治
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职称材料
题名
基于数据挖掘和生物信息学探讨专利中药复方治疗酒精性肝病的用药规律及作用机制
1
作者
高松林
韦柳婷
温文建
管晓
梁菲
卢容兰
覃雁
黄贵华
机构
广西中医药大学第一临床医学院
广西中医药大学第一附属医院
出处
《科学技术与工程》
北大核心
2024年第25期10715-10725,共11页
基金
广西研究生教育创新计划(YCBZ2023148)
广西科技基地和人才专项(桂科AD19245168)
+3 种基金
国医大师黄瑾明学术思想与临床诊疗传承发展研究中心建设项目(桂中医大党[2022]24号)
国家中医药管理局第七批全国老中医药专家学术经验继承工作项目(国中医药人教函[2022]76号)
黄贵华桂派中医大师培养项目(桂中医药科教发[2022]6号)
黄贵华广西名中医传承工作室项目(桂卫中医发[2017]2号)。
文摘
专利中药复方是实用性较强的验方,但其治疗酒精性肝病(alcoholic liver disease,ALD)的用药规律和作用机制尚不明确。采用数据挖掘方法探讨中药专利复方治疗ALD的用药规律,运用生物信息学探索核心药对调节铁死亡治疗ALD的潜在作用机制。通过中医传承计算平台(V3.0)对治疗ALD的专利中药复方进行数据挖掘,提取核心药对。从GSE28619数据集、FerrDb和BATMAN-TCM数据库中获取“核心药对-ALD-铁死亡”共同分子靶点的差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)并分析其相关性和富集分析。构建机器学习模型筛选关键DEGs,构建列线图模型预测ALD的患病风险并验证。共获得229个专利中药复方,包含609味中药。高频药物有丹参、甘草等23味,以补虚药、利水渗湿药、清热药和活血化瘀药为主,丹参-山楂是核心药对。共有10个共同分子靶点DEGs,它们具有相互调控、介导促性腺激素释放激素、糖尿病并发症中晚期糖基化终产物及其受体等信号通路的作用。RF机器学习模型的预测效果最佳,磷酸丝氨酸转氨酶1(phosphoserine aminotransferase 1,PSAT1)、早期生长反应因子1(early growth response factor 1,EGR1)、醌氧化还原酶1(NADPH quinone oxidoreductase 1,NQO1)、醛酮还原酶1C3(aldo-keto reductase 1C3,AKR1C3)、JUN原癌基因(Jun proto-oncogene,JUN)是关键的DEGs。列线图模型能够准确地预测ALD的患病风险。结果表明:中药专利复方治疗ALD以扶正祛邪为基本原则,用药以补虚药为主,兼以利水渗湿、清热、活血化瘀等药物。核心药对丹参-山楂调节铁死亡治疗ALD可能与PSAT1、EGR1、NQO1等DEGs及其介导的促性腺激素释放激素、糖尿病并发症中晚期糖基化终产物及其受体等信号通路有关。
关键词
酒精性肝病
中药专利复方
铁死亡
数据挖掘
用药规律
生物信息学
作用机制
Keywords
alcoholic liver disease
patented Chinese herbal compounds
ferroptosis
data mining
medication rule
bioinformatics
mechanism of action
分类号
R285 [医药卫生—中药学]
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职称材料
题名
基于“阳黄治胃,阴黄治脾”探讨黄疸病的辨证思路
2
作者
毕若娴
梁馨允
温文建
黄贵华
机构
广西中医药大学
广西中医药大学第一附属医院
出处
《中国中医基础医学杂志》
CAS
CSCD
2024年第9期1469-1472,共4页
基金
黄贵华广西名中医传承工作室项目(桂卫中医发〔2017〕2号)
黄贵华桂派中医大师培养项目(桂中医药科教发〔2022〕6号)
国医大师黄瑾明学术思想与临床诊疗传承发展研究中心建设项目(桂中医大党〔2022〕24号)。
文摘
通过对中医古籍追本溯源和对现代医学文献深入研究,探析古今医家对黄疸病“阳黄治胃,阴黄治脾”治法其背后病机的认识。总结出黄疸病的相关脏腑主要在脾胃,与肝胆关系不大。治疗时应该注意治疗脾胃为主,兼顾他脏,同时注意脾胃分治,提炼出黄疸的特色辨证思路及治疗方法。深入挖掘从“阳黄治胃,阴黄治脾”理论辨治黄疸之阴黄、阳黄临证特色,可以为今后中医药治疗黄疸病提供更加开阔的思路和方法。
关键词
阳黄治胃
阴黄治脾
黄疸
阴黄
阳黄
辨证
分类号
R256.4 [医药卫生—中医内科学]
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职称材料
题名
基于生物信息学探讨非酒精性脂肪性肝炎铜死亡相关基因及中药预测
3
作者
高松林
张鹏
梁馨允
梁菲
管晓
温文建
唐嘉扬
黄贵华
机构
广西中医药大学研究生院
柳州市中医医院
广西中医药大学第一附属医院
出处
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第6期1111-1120,共10页
基金
广西研究生教育创新计划项目(YCBZ2023148)
国医大师黄瑾明学术思想与临床诊疗传承发展研究中心建设项目(桂中医大党[2022]24号)
黄贵华广西名中医传承工作室项目(桂卫中医发[2017]2号)共同资助。
文摘
本研究旨在运用生物信息学方法筛选非酒精性脂肪性肝炎(non-alcoholic steatohepatitis,NASH)的铜死亡相关基因和诊断性生物标志物,并预测调控铜死亡基因治疗NASH的潜在中药。从GEO数据库获取GSE89632数据集作为训练数据集,提取NASH中差异表达的铜死亡基因(differentially expressed cuproptosis-related genes,DECRGs),运用R4.2.2软件对DECRGs进行相关性分析和富集分析。基于DECRGs对NASH患者进行聚类分型,构建机器学习模型,筛选关键基因并验证。通过COREMINE数据库预测调控铜死亡基因治疗NASH的潜在中药,运用中医传承计算平台(Traditional Chinese Medicine Inheritance Computer System)v3.5软件挖掘用药规律。筛选得到9个DECRGs,DECRGs间存在相互调控的作用,富集分析发现DECRGs主要介导硫辛酸代谢、碳代谢、三羧酸循环等途径干预NASH。共识聚类将NASH患者分为3个亚型;支持向量机模型(support vector machine,SVM)为最合适的机器学习模型;NFE2L2、LIAS、GLS和GCSH和PDHB等5个与NASH最相关的铜死亡基因可作为NASH的诊断性生物标志物。在调控铜死亡基因治疗NASH的中药中,四气以寒、温、平为主,五味以苦、甘、辛味为主,主归肝、脾经,功效方面以补虚、清热、活血化瘀为主。本研究发现了NASH的铜死亡相关基因、诊断性生物标志物及对应中药的用药规律,可为中医药治疗NASH的临床应用和新药研发提供思路。
关键词
非酒精性脂肪性肝炎
铜死亡相关基因
生物信息学
机器学习
中药预测
Keywords
Non-alcoholic steatohepatitis
Cuproptosis-related genes
Bioinformatics
Machine learning
Traditional Chinese medicine prediction
分类号
R575.5 [医药卫生—消化系统]
Q811.4 [生物学—生物工程]
原文传递
题名
桂派中医大师黄贵华教授从六经辨证论治食管瘅
4
作者
梁菲
温文建
梁馨允
管晓
高松林
黄贵华
机构
广西中医药大学
出处
《内蒙古中医药》
2024年第10期73-76,共4页
基金
黄贵华桂派中医大师培养项目(桂中医药科教发[2024]1号)
黄贵华广西名中医传承工作室项目(桂卫中医发[2017]2号)
国医大师黄瑾明学术思想与临床诊疗传承发展研究中心建设项目(桂中医大党[2022]24号)。
文摘
食管瘅(胃食管反流病)为临床常见脾胃疾病,多以反酸、烧心、咽部异物感等为主要症状。本文总结了黄贵华教授以六经辨证论治食管瘅的临床经验:太阳经治以祛邪降逆之桂枝汤;阳明经治以清宣郁热之栀子豉汤;少阳经治以清透少阳邪热之小柴胡汤;太阴经治以温补脾胃之甘草干姜汤;少阴经治以温阳散寒之四逆汤;厥阴经治以调和寒热之乌梅丸,为经方的临床应用提供了新思路。
关键词
食管瘅
胃食管反流
六经辨证论治
分类号
R249 [医药卫生—中医临床基础]
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职称材料
题名
作者
出处
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被引量
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1
基于数据挖掘和生物信息学探讨专利中药复方治疗酒精性肝病的用药规律及作用机制
高松林
韦柳婷
温文建
管晓
梁菲
卢容兰
覃雁
黄贵华
《科学技术与工程》
北大核心
2024
0
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职称材料
2
基于“阳黄治胃,阴黄治脾”探讨黄疸病的辨证思路
毕若娴
梁馨允
温文建
黄贵华
《中国中医基础医学杂志》
CAS
CSCD
2024
0
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职称材料
3
基于生物信息学探讨非酒精性脂肪性肝炎铜死亡相关基因及中药预测
高松林
张鹏
梁馨允
梁菲
管晓
温文建
唐嘉扬
黄贵华
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
原文传递
4
桂派中医大师黄贵华教授从六经辨证论治食管瘅
梁菲
温文建
梁馨允
管晓
高松林
黄贵华
《内蒙古中医药》
2024
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职称材料
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