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Exportin家族鉴定及其在尼罗罗非鱼中的表达分析
1
作者
张清清
游慧芹
+1 位作者
杜康
陶文静
《西南大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第1期77-86,共10页
输出蛋白(Exportins,XPOs)负责细胞核中蛋白质和RNA的输出,对基因表达调控起着重要的作用,然而Exportin家族的系统进化和表达模式尚不清楚.研究首先对22种代表性动物的Exportin家族进行鉴定并分析了其系统进化,再通过转录组分析和qRT-PC...
输出蛋白(Exportins,XPOs)负责细胞核中蛋白质和RNA的输出,对基因表达调控起着重要的作用,然而Exportin家族的系统进化和表达模式尚不清楚.研究首先对22种代表性动物的Exportin家族进行鉴定并分析了其系统进化,再通过转录组分析和qRT-PCR探究了Exportin家族成员在尼罗罗非鱼各组织中的表达水平,最后通过荧光原位杂交对xpo1a,xpo1b和xpo5在尼罗罗非鱼性腺中的细胞定位进行了分析.结果表明:脊椎动物Exportin家族成员的数量在经过第2轮和第3轮全基因组复制的物种中变化不大,而在经过第4轮时显著增加,暗示Exportin家族成员在第4轮全基因组复制中发生了扩张.xpos主要在精巢中表达,其中xpo1a表达最高;xpos在尼罗罗非鱼孵化后5 d和30 d的表达没有雌雄差异,而在孵化后90,180和300 d出现明显差异,其中负责miRNA出核转运的xpo5在精巢中的表达明显高于卵巢.在尼罗罗非鱼卵巢中,xpo1a,xpo1b和xpo5主要在卵原细胞和卵母细胞中表达;在精巢中,xpo1a和xpo5主要在精原细胞和精母细胞中表达,而xpo1b主要在精细胞中表达.研究系统分析了Exportin家族成员的进化及其在尼罗罗非鱼性腺中的表达,为解析其在脊椎动物生殖发育中的作用奠定了基础.
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关键词
输出蛋白
系统进化分析
表达分析
尼罗罗非鱼
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职称材料
题名
Exportin家族鉴定及其在尼罗罗非鱼中的表达分析
1
作者
张清清
游慧芹
杜康
陶文静
机构
西南大学生命科学学院/淡水鱼类资源与生殖发育教育部重点实验室
出处
《西南大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第1期77-86,共10页
基金
国家自然科学基金面上项目(31972778)
西南大学大学生创新创业训练计划项目(S202110635298).
文摘
输出蛋白(Exportins,XPOs)负责细胞核中蛋白质和RNA的输出,对基因表达调控起着重要的作用,然而Exportin家族的系统进化和表达模式尚不清楚.研究首先对22种代表性动物的Exportin家族进行鉴定并分析了其系统进化,再通过转录组分析和qRT-PCR探究了Exportin家族成员在尼罗罗非鱼各组织中的表达水平,最后通过荧光原位杂交对xpo1a,xpo1b和xpo5在尼罗罗非鱼性腺中的细胞定位进行了分析.结果表明:脊椎动物Exportin家族成员的数量在经过第2轮和第3轮全基因组复制的物种中变化不大,而在经过第4轮时显著增加,暗示Exportin家族成员在第4轮全基因组复制中发生了扩张.xpos主要在精巢中表达,其中xpo1a表达最高;xpos在尼罗罗非鱼孵化后5 d和30 d的表达没有雌雄差异,而在孵化后90,180和300 d出现明显差异,其中负责miRNA出核转运的xpo5在精巢中的表达明显高于卵巢.在尼罗罗非鱼卵巢中,xpo1a,xpo1b和xpo5主要在卵原细胞和卵母细胞中表达;在精巢中,xpo1a和xpo5主要在精原细胞和精母细胞中表达,而xpo1b主要在精细胞中表达.研究系统分析了Exportin家族成员的进化及其在尼罗罗非鱼性腺中的表达,为解析其在脊椎动物生殖发育中的作用奠定了基础.
关键词
输出蛋白
系统进化分析
表达分析
尼罗罗非鱼
Keywords
Exportins
phylogenetic analysis
expression analysis
Oreochromis niloticus
分类号
Q111 [生物学—普通生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
Exportin家族鉴定及其在尼罗罗非鱼中的表达分析
张清清
游慧芹
杜康
陶文静
《西南大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
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