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甲状腺乳头状癌的FN1表达增加与BRAF突变、免疫浸润及预后不良有关
被引量:
3
1
作者
陈兴
郑俊杰
+1 位作者
张爱龙
游振辉
(
指导
)
《中国免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第15期1841-1847,共7页
目的:探索甲状腺乳头状癌(PTC)在诊断和预后判断的关键因素。方法:通过下载NCBI-GEO的3个甲状腺乳头状癌数据集并应用R语言进行关键基因的筛选,结合TCGA数据集及在线分析网站对其进行综合分析。同时,利用RTPCR对50例甲状腺乳头状癌及癌...
目的:探索甲状腺乳头状癌(PTC)在诊断和预后判断的关键因素。方法:通过下载NCBI-GEO的3个甲状腺乳头状癌数据集并应用R语言进行关键基因的筛选,结合TCGA数据集及在线分析网站对其进行综合分析。同时,利用RTPCR对50例甲状腺乳头状癌及癌旁组织进行mRNA表达量检测。结果:从3个甲状腺乳头状癌GEO数据集中鉴定出142个差异表达基因,在50例甲状腺乳头状癌组织中检测到FN1表达显著上升且BRAF-V600E基因突变的甲状腺乳头状癌组织中有着更高的FN1表达水平。此外,FN1的表达水平与甲状腺乳头状癌中的不良预后及免疫浸润密切相关,基因共表达分析结果显示FN1共表达的基因富集在p53信号通路。结论:FN1可作为甲状腺乳头状癌诊断及预后标志物,同时FN1在甲状腺乳头状癌中的作用机制可能与BRAF-V600E突变、免疫浸润及p53信号通路相关。
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关键词
甲状腺乳头状癌
FN1
BRAF突变
免疫浸润
p53信号通路
生物信息学
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职称材料
题名
甲状腺乳头状癌的FN1表达增加与BRAF突变、免疫浸润及预后不良有关
被引量:
3
1
作者
陈兴
郑俊杰
张爱龙
游振辉
(
指导
)
机构
福建医科大学省立临床医学院基本外科
出处
《中国免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第15期1841-1847,共7页
基金
福建省自然科学基金计划项目(No.2018J01239)。
文摘
目的:探索甲状腺乳头状癌(PTC)在诊断和预后判断的关键因素。方法:通过下载NCBI-GEO的3个甲状腺乳头状癌数据集并应用R语言进行关键基因的筛选,结合TCGA数据集及在线分析网站对其进行综合分析。同时,利用RTPCR对50例甲状腺乳头状癌及癌旁组织进行mRNA表达量检测。结果:从3个甲状腺乳头状癌GEO数据集中鉴定出142个差异表达基因,在50例甲状腺乳头状癌组织中检测到FN1表达显著上升且BRAF-V600E基因突变的甲状腺乳头状癌组织中有着更高的FN1表达水平。此外,FN1的表达水平与甲状腺乳头状癌中的不良预后及免疫浸润密切相关,基因共表达分析结果显示FN1共表达的基因富集在p53信号通路。结论:FN1可作为甲状腺乳头状癌诊断及预后标志物,同时FN1在甲状腺乳头状癌中的作用机制可能与BRAF-V600E突变、免疫浸润及p53信号通路相关。
关键词
甲状腺乳头状癌
FN1
BRAF突变
免疫浸润
p53信号通路
生物信息学
Keywords
Papillary thyroid cancer
FN1
BRAF mutation
Immune infiltration
p53 signaling pathway
Bioinformatics
分类号
R736 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
甲状腺乳头状癌的FN1表达增加与BRAF突变、免疫浸润及预后不良有关
陈兴
郑俊杰
张爱龙
游振辉
(
指导
)
《中国免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2021
3
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