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基于多步降维和半监督学习的蛋白质质谱特征提取算法
被引量:
2
1
作者
游晓璐
祝磊
+1 位作者
曹凯敏
韩斌
《航天医学与医学工程》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第4期312-316,共5页
目的提出一种基于半监督学习的多步降维特征提取方法。方法算法首先运用t-test对样本特征进行筛选,初步降低特征维度;然后进行离散小波变换,对小波系数进行相对熵排序,筛选出新的特征子集;接着进行主成分分析,提取主成分;最后运用半监...
目的提出一种基于半监督学习的多步降维特征提取方法。方法算法首先运用t-test对样本特征进行筛选,初步降低特征维度;然后进行离散小波变换,对小波系数进行相对熵排序,筛选出新的特征子集;接着进行主成分分析,提取主成分;最后运用半监督学习算法BB-LLGC进行标签传递,充分提取有标记和无标记样本的判别信息。结果在公共卵巢癌数据集OC-WCX2b和公共前列腺癌数据集PC-H4上获得了99.13%和97.20%分类准确率。在浙江省肿瘤医院临床乳腺癌数据集BC-WCX2a上获得了92.78%的分类准确率和100%的敏感性。结论多步降维的特征提取方法可以有效降低SELDI质谱数据的特征维度,结合半监督学习算法BB-LLGC,可以获得较好的分类效果。
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关键词
蛋白质质谱
多步降维
半监督学习
特征提取
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职称材料
基于聚类分析和半监督学习的蛋白质质谱数据分类
被引量:
2
2
作者
祝磊
曹凯敏
+2 位作者
游晓璐
徐平
应南娇
《航天医学与医学工程》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第5期367-372,共6页
目的针对高维冗余的SELDI蛋白质质谱数据,提出一种基于聚类分析和半监督学习的数据分类方法。方法算法首先运用t-test对蛋白质质谱数据进行初步降维;然后将处理后的数据用聚类分析算法进行进一步降维;最后运用半监督学习算法传递标签,...
目的针对高维冗余的SELDI蛋白质质谱数据,提出一种基于聚类分析和半监督学习的数据分类方法。方法算法首先运用t-test对蛋白质质谱数据进行初步降维;然后将处理后的数据用聚类分析算法进行进一步降维;最后运用半监督学习算法传递标签,充分提取有标记样本和无标记样本的信息,从而进行分类。结果在公共卵巢癌数据集OC-WCX2b和公共前列腺癌数据集PC-H4上获得了99.15%和96.75%分类准确率。在浙江省肿瘤医院临床乳腺癌数据集BC-WCX2a上获得了95.18%的分类准确率和100%的敏感性。结论基于聚类分析的半监督学习方法能够有效利用未标记的质谱样本信息,与经典的监督学习算法相比,其分类性能更理想、实用性更好。
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关键词
蛋白质质谱
聚类分析
半监督学习
特征提取
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职称材料
守望者的莆田
3
作者
李钰
陈曼欣
+3 位作者
宋嘉伟
徐学仕
周建飞
游晓璐
《中国国家旅游》
2015年第7期88-97,11,共10页
莆田位于福建中部沿海地区,西依戴云山脉,东邻台湾海峡,夹峙在福州与泉州之间。现代莆田以重商闻名,它独特的人文气韵为外人所不知。当地有这样一群人文守护者,以不同的方式挖掘、保护红砖厝、方言民谣、龙眼木雕等莆田最具代表性...
莆田位于福建中部沿海地区,西依戴云山脉,东邻台湾海峡,夹峙在福州与泉州之间。现代莆田以重商闻名,它独特的人文气韵为外人所不知。当地有这样一群人文守护者,以不同的方式挖掘、保护红砖厝、方言民谣、龙眼木雕等莆田最具代表性的文化符号,经由他们,我们可以重新感知一地文化的兴味和温度,也得以发现更多文化自觉的可能性。
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关键词
莆田
守望者
文化自觉
沿海地区
台湾海峡
人文
原文传递
题名
基于多步降维和半监督学习的蛋白质质谱特征提取算法
被引量:
2
1
作者
游晓璐
祝磊
曹凯敏
韩斌
机构
杭州电子科技大学生物医学工程与仪器研究所
出处
《航天医学与医学工程》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第4期312-316,共5页
基金
国家自然科学基金资助项目(60801054
60801055)
+1 种基金
浙江省公益性技术应用研究项目(2010C33017)
浙江省医药卫生科学研究基金资助项目(2010KYA041)
文摘
目的提出一种基于半监督学习的多步降维特征提取方法。方法算法首先运用t-test对样本特征进行筛选,初步降低特征维度;然后进行离散小波变换,对小波系数进行相对熵排序,筛选出新的特征子集;接着进行主成分分析,提取主成分;最后运用半监督学习算法BB-LLGC进行标签传递,充分提取有标记和无标记样本的判别信息。结果在公共卵巢癌数据集OC-WCX2b和公共前列腺癌数据集PC-H4上获得了99.13%和97.20%分类准确率。在浙江省肿瘤医院临床乳腺癌数据集BC-WCX2a上获得了92.78%的分类准确率和100%的敏感性。结论多步降维的特征提取方法可以有效降低SELDI质谱数据的特征维度,结合半监督学习算法BB-LLGC,可以获得较好的分类效果。
关键词
蛋白质质谱
多步降维
半监督学习
特征提取
Keywords
protein mass spectrometry
multi-step dimensionality reduction
semi-supervised learning
feature extraction
分类号
R318.04 [医药卫生—生物医学工程]
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职称材料
题名
基于聚类分析和半监督学习的蛋白质质谱数据分类
被引量:
2
2
作者
祝磊
曹凯敏
游晓璐
徐平
应南娇
机构
杭州电子科技大学生命信息与仪器工程学院
出处
《航天医学与医学工程》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第5期367-372,共6页
基金
国家自然科学基金(60801054
61205200)
浙江省自然科学基金(LY12F01005)
文摘
目的针对高维冗余的SELDI蛋白质质谱数据,提出一种基于聚类分析和半监督学习的数据分类方法。方法算法首先运用t-test对蛋白质质谱数据进行初步降维;然后将处理后的数据用聚类分析算法进行进一步降维;最后运用半监督学习算法传递标签,充分提取有标记样本和无标记样本的信息,从而进行分类。结果在公共卵巢癌数据集OC-WCX2b和公共前列腺癌数据集PC-H4上获得了99.15%和96.75%分类准确率。在浙江省肿瘤医院临床乳腺癌数据集BC-WCX2a上获得了95.18%的分类准确率和100%的敏感性。结论基于聚类分析的半监督学习方法能够有效利用未标记的质谱样本信息,与经典的监督学习算法相比,其分类性能更理想、实用性更好。
关键词
蛋白质质谱
聚类分析
半监督学习
特征提取
Keywords
proteomic mass spectrometry
cluster analysis
semi-supervised learning
feature extraction
分类号
R318.04 [医药卫生—生物医学工程]
下载PDF
职称材料
题名
守望者的莆田
3
作者
李钰
陈曼欣
宋嘉伟
徐学仕
周建飞
游晓璐
出处
《中国国家旅游》
2015年第7期88-97,11,共10页
文摘
莆田位于福建中部沿海地区,西依戴云山脉,东邻台湾海峡,夹峙在福州与泉州之间。现代莆田以重商闻名,它独特的人文气韵为外人所不知。当地有这样一群人文守护者,以不同的方式挖掘、保护红砖厝、方言民谣、龙眼木雕等莆田最具代表性的文化符号,经由他们,我们可以重新感知一地文化的兴味和温度,也得以发现更多文化自觉的可能性。
关键词
莆田
守望者
文化自觉
沿海地区
台湾海峡
人文
分类号
V279 [航空宇航科学与技术—飞行器设计]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于多步降维和半监督学习的蛋白质质谱特征提取算法
游晓璐
祝磊
曹凯敏
韩斌
《航天医学与医学工程》
CAS
CSCD
北大核心
2013
2
下载PDF
职称材料
2
基于聚类分析和半监督学习的蛋白质质谱数据分类
祝磊
曹凯敏
游晓璐
徐平
应南娇
《航天医学与医学工程》
CAS
CSCD
北大核心
2014
2
下载PDF
职称材料
3
守望者的莆田
李钰
陈曼欣
宋嘉伟
徐学仕
周建飞
游晓璐
《中国国家旅游》
2015
0
原文传递
已选择
0
条
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统计分析
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