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西方蜜蜂表皮蛋白基因apd-like转录起始位点的定位及cDNA序列的分析
被引量:
5
1
作者
孙亮先
黄周英
+1 位作者
郑华军
游燕琳
《昆虫学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第2期224-231,共8页
Apidermin蛋白家族是根据蜜蜂表皮蛋白apidermin1-3(APD1-3)而命名的一个新型的昆虫结构性表皮蛋白家族。为了鉴定西方蜜蜂Apis mellifera基因组序列上毗邻基因簇apd1-3的一个预测基因座LOC727145是否为一个新的apd基因,本研究在用5′Lo...
Apidermin蛋白家族是根据蜜蜂表皮蛋白apidermin1-3(APD1-3)而命名的一个新型的昆虫结构性表皮蛋白家族。为了鉴定西方蜜蜂Apis mellifera基因组序列上毗邻基因簇apd1-3的一个预测基因座LOC727145是否为一个新的apd基因,本研究在用5′LongSAGE标签定位该基因的转录起始位点(TSS)的基础上,利用其中的3条5′LongSAGE标签序列作为上游引物,通过RT-PCR方法克隆了该基因的cDNA序列(GenBank登录号:GU358197,GU358199,GU358198)。生物信息学分析发现,基因座LOC727145含有2个外显子和1个"GT-AG"型内含子,其cDNA序列富含GC(70%),可编码一条长152aa残基的高度疏水性多肽。此多肽序列的氨基酸组成与蜜蜂APD1-3表皮蛋白类似,富含Ala,Gly,Pro,Leu和Val5种氨基酸(占77%),其中Ala残基含量最高(29%)。该多肽序列与蜜蜂APD-1表皮蛋白序列的相似性为50%,且其N末端的预测信号肽序列与APD蛋白的信号肽序列类似。5′LongSAGE标签的基因组定位结果显示,基因座LOC727145在雄蜂头部中表达丰度很高,RNA PolⅡ可从6个不同的TSS上以不同效率起始转录,其中由一个优势TSS上起始了90%的转录。本研究为apidermin表皮蛋白家族增添了一个新成员,命名为apidermin-like(apd-like)。
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关键词
西方蜜蜂
5′LongSAGE
表皮蛋白
apd-like基因
转录起始位点(TSS)
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题名
西方蜜蜂表皮蛋白基因apd-like转录起始位点的定位及cDNA序列的分析
被引量:
5
1
作者
孙亮先
黄周英
郑华军
游燕琳
机构
泉州师范学院
国家人类基因组南方研究中心
出处
《昆虫学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第2期224-231,共8页
基金
国家自然科学基金项目(30300183,31072095)
福建省教育厅省属高校项目(2008F5051)
文摘
Apidermin蛋白家族是根据蜜蜂表皮蛋白apidermin1-3(APD1-3)而命名的一个新型的昆虫结构性表皮蛋白家族。为了鉴定西方蜜蜂Apis mellifera基因组序列上毗邻基因簇apd1-3的一个预测基因座LOC727145是否为一个新的apd基因,本研究在用5′LongSAGE标签定位该基因的转录起始位点(TSS)的基础上,利用其中的3条5′LongSAGE标签序列作为上游引物,通过RT-PCR方法克隆了该基因的cDNA序列(GenBank登录号:GU358197,GU358199,GU358198)。生物信息学分析发现,基因座LOC727145含有2个外显子和1个"GT-AG"型内含子,其cDNA序列富含GC(70%),可编码一条长152aa残基的高度疏水性多肽。此多肽序列的氨基酸组成与蜜蜂APD1-3表皮蛋白类似,富含Ala,Gly,Pro,Leu和Val5种氨基酸(占77%),其中Ala残基含量最高(29%)。该多肽序列与蜜蜂APD-1表皮蛋白序列的相似性为50%,且其N末端的预测信号肽序列与APD蛋白的信号肽序列类似。5′LongSAGE标签的基因组定位结果显示,基因座LOC727145在雄蜂头部中表达丰度很高,RNA PolⅡ可从6个不同的TSS上以不同效率起始转录,其中由一个优势TSS上起始了90%的转录。本研究为apidermin表皮蛋白家族增添了一个新成员,命名为apidermin-like(apd-like)。
关键词
西方蜜蜂
5′LongSAGE
表皮蛋白
apd-like基因
转录起始位点(TSS)
Keywords
Apis mellifera
5'LongSAGE
cuticular protein
apd-like gene
transcription start site(TSS)
分类号
Q966 [生物学—昆虫学]
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题名
作者
出处
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被引量
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1
西方蜜蜂表皮蛋白基因apd-like转录起始位点的定位及cDNA序列的分析
孙亮先
黄周英
郑华军
游燕琳
《昆虫学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011
5
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职称材料
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参考文献
引证文献
统计分析
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