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基于网络药理学和分子对接探讨木犀草素抗急性肺损伤的分子机制
1
作者
汪雪峰
潘信芝
+3 位作者
曹宁
孙可一
RANA Dhar
汤慧芳
《中国药理学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第8期1583-1591,共9页
目的通过网络药理学及分子对接技术探讨木犀草素抗急性肺损伤的作用机制,并进行实验验证。方法利用PubChem和SwissTargetPrediction数据库预测木犀草素作用的相关靶点;通过GeneCards数据库收集急性肺损伤相关靶点;以Venny 2.1绘制韦恩图...
目的通过网络药理学及分子对接技术探讨木犀草素抗急性肺损伤的作用机制,并进行实验验证。方法利用PubChem和SwissTargetPrediction数据库预测木犀草素作用的相关靶点;通过GeneCards数据库收集急性肺损伤相关靶点;以Venny 2.1绘制韦恩图,并得到药物与疾病的共同靶点;应用String在线平台建立蛋白互作网络(PPI),通过Cytoscape 3.8.2软件筛选出核心靶点;利用DAVID数据库将共同靶点进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析,将其结果可视化;最后,通过Auto Dock软件进行分子对接,并运用Pymol对分子结果进行可视化。构建小鼠急性肺损伤模型,采用苏木精伊红(HE)染色检测组织病理学,蛋白免疫印迹(Western blot)检测肺组织中相关蛋白。结果经筛选得到85个共同靶点,其中,核心靶点有AKT1、EGFR、SRC、MMP9、ESR1、PTGS2等。GO富集分析获得生物过程265条,主要包括信号转导、蛋白磷酸化、凋亡过程的负调控等过程;细胞组成48条,主要包括质膜、细胞溶质、细胞质等;分子功能107条,主要包括ATP结合、蛋白丝氨酸/苏氨酸/酪氨酸激酶活性、蛋白激酶活性等。KEGG通路富集分析共获得92条信号通路,主要作用于PI3K-AKT信号通路、ErbB信号通路、VEGF信号通路等。分子对接结果显示木犀草素与核心靶点AKT1、EGFR、SRC、MMP9、ESR1、PTGS2、MMP2、GSK3B、KDR、PARP1均具有良好的对接活性,其中ERS1、GSK3B、MMP2结合能低于-5.0 kal·mol^(-1),与木犀草素之间的亲和力更强。肺组织病理学结果显示,木犀草素在LPS诱导的小鼠急性肺损伤模型中,能够抑制炎症浸润,有较强的抗炎作用。Western blot实验显示,木犀草素可能通过抑制AKT的磷酸化缓解炎症反应。结论木犀草素可通过多靶点、多途径机制发挥抗急性肺损伤的作用,其中可能与抑制AKT的磷酸化密切相关。
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关键词
网络药理学
分子对接
木犀草素
急性肺损伤
急性呼吸窘迫综合征
作用机制
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题名
基于网络药理学和分子对接探讨木犀草素抗急性肺损伤的分子机制
1
作者
汪雪峰
潘信芝
曹宁
孙可一
RANA Dhar
汤慧芳
机构
浙江中医药大学附属第二医院药剂科
浙江中医药大学药学院
浙江大学医学院
出处
《中国药理学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第8期1583-1591,共9页
基金
国家自然科学基金资助项目(No.82374186)
浙江省医药卫生科技计划项目(No.2022KY928)。
文摘
目的通过网络药理学及分子对接技术探讨木犀草素抗急性肺损伤的作用机制,并进行实验验证。方法利用PubChem和SwissTargetPrediction数据库预测木犀草素作用的相关靶点;通过GeneCards数据库收集急性肺损伤相关靶点;以Venny 2.1绘制韦恩图,并得到药物与疾病的共同靶点;应用String在线平台建立蛋白互作网络(PPI),通过Cytoscape 3.8.2软件筛选出核心靶点;利用DAVID数据库将共同靶点进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析,将其结果可视化;最后,通过Auto Dock软件进行分子对接,并运用Pymol对分子结果进行可视化。构建小鼠急性肺损伤模型,采用苏木精伊红(HE)染色检测组织病理学,蛋白免疫印迹(Western blot)检测肺组织中相关蛋白。结果经筛选得到85个共同靶点,其中,核心靶点有AKT1、EGFR、SRC、MMP9、ESR1、PTGS2等。GO富集分析获得生物过程265条,主要包括信号转导、蛋白磷酸化、凋亡过程的负调控等过程;细胞组成48条,主要包括质膜、细胞溶质、细胞质等;分子功能107条,主要包括ATP结合、蛋白丝氨酸/苏氨酸/酪氨酸激酶活性、蛋白激酶活性等。KEGG通路富集分析共获得92条信号通路,主要作用于PI3K-AKT信号通路、ErbB信号通路、VEGF信号通路等。分子对接结果显示木犀草素与核心靶点AKT1、EGFR、SRC、MMP9、ESR1、PTGS2、MMP2、GSK3B、KDR、PARP1均具有良好的对接活性,其中ERS1、GSK3B、MMP2结合能低于-5.0 kal·mol^(-1),与木犀草素之间的亲和力更强。肺组织病理学结果显示,木犀草素在LPS诱导的小鼠急性肺损伤模型中,能够抑制炎症浸润,有较强的抗炎作用。Western blot实验显示,木犀草素可能通过抑制AKT的磷酸化缓解炎症反应。结论木犀草素可通过多靶点、多途径机制发挥抗急性肺损伤的作用,其中可能与抑制AKT的磷酸化密切相关。
关键词
网络药理学
分子对接
木犀草素
急性肺损伤
急性呼吸窘迫综合征
作用机制
Keywords
network pharmacology
molecular docking
luteolin
acute lung injury
acute respiratory distress syndrome
mechanism of action
分类号
R-332 [医药卫生]
R284.1 [医药卫生—中药学]
R322.35 [医药卫生—人体解剖和组织胚胎学]
R319 [医药卫生—基础医学]
R563.8 [医药卫生—呼吸系统]
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作者
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1
基于网络药理学和分子对接探讨木犀草素抗急性肺损伤的分子机制
汪雪峰
潘信芝
曹宁
孙可一
RANA Dhar
汤慧芳
《中国药理学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2024
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