肺腺癌miR-195的表达及靶基因筛选

目的研究miR-195在肺腺癌中的表达差异,筛选miR-195靶基因,分析靶基因作用网络及其对患者生存预后的影响。方法利用TCGA数据库,比较miR-195在肺腺癌癌组织与癌旁正常组织间的表达差异;采用实时荧光定量PCR检测miR-195在临床标本中的相对表达水平。设计miR-195的Hybrid PCR引物,扩增出靶基因的mRNA 3′-非翻译区(3′UTR),菌落PCR筛选靶基因的3′UTR片段进行测序。美国国家生物信息中心网站比对测序结果,得到靶基因的基因注释和全长序列,构建靶基因作用网络并进行生存分析。结果miR-195在肺腺癌癌组织中的相对表达水平低于癌旁正常组织,差异有统计学意义(P<0.01)。Hybrid PCR筛选miR-195候选靶基因显示多个条带。miR-195与靶基因的结合位点在基因3′UTR上有19个。靶基因GCLC、NOB1的低表达与肺腺癌患者的良好预后相关。结论肺腺癌癌组织中miR-195呈低表达。miR-195可能通过直接抑制靶基因GCLC、NOB1的功能,进而影响肺腺癌的发生、发展。