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基于SNP芯片的湖羊群体遗传结构分析 被引量:5
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作者 熊金珂 鲍晶晶 +1 位作者 胡文萍 张莉 《中国畜牧杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第11期89-94,共6页
为探究湖羊种公羊个体间的亲缘关系以及群体遗传结构,本研究使用Illumina Ovine 50K SNP芯片对某规模化养殖场248只湖羊种公羊进行基因分型。结果表明,248只种公羊共获得52843个SNPs标记,平均检出率为99.15%,质控后得到45521个高质量的S... 为探究湖羊种公羊个体间的亲缘关系以及群体遗传结构,本研究使用Illumina Ovine 50K SNP芯片对某规模化养殖场248只湖羊种公羊进行基因分型。结果表明,248只种公羊共获得52843个SNPs标记,平均检出率为99.15%,质控后得到45521个高质量的SNPs位点;湖羊种公羊群体多态信息含量为0.3028,观测杂合度为0.3850,期望杂合度为0.3820;同源遗传距离(Identity by state,IBS)在0.1312~0.3209之间,平均为0.3011;248只种公羊共检测到20214个连续性纯合片段(Runs of Homozygosity,ROH),平均总长度为122.11 Mb,平均近交系数为0.0499;结合主成分分析和进化树结果,248只种公羊可划分为6个家系。本研究从基因组水平揭示了湖羊种公羊个体间亲缘关系和群体遗传结构,为后续育种计划的制定和实施以及种群的利用提供了参考。 展开更多
关键词 湖羊 群体遗传结构 亲缘关系 近交系数
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湖羊SRP68基因多态性及其与生长性状的关联分析
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作者 毕亚珍 尚明玉 +3 位作者 熊金珂 胡文萍 贺建宁 张莉 《中国畜牧兽医》 CAS CSCD 北大核心 2023年第8期3189-3198,共10页
【目的】研究信号识别颗粒68(signal recognition particle 68,SRP68)基因在不同月龄湖羊不同组织中的表达情况,并分析其多态性对湖羊生长性状的影响,以期找到与绵羊生长性状显著相关的分子标记。【方法】利用实时荧光定量PCR检测SRP 6... 【目的】研究信号识别颗粒68(signal recognition particle 68,SRP68)基因在不同月龄湖羊不同组织中的表达情况,并分析其多态性对湖羊生长性状的影响,以期找到与绵羊生长性状显著相关的分子标记。【方法】利用实时荧光定量PCR检测SRP 68基因在湖羊心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏和背最长肌6种组织中的表达情况,以及在初生、45日龄、4月龄和6月龄时湖羊背最长肌中的表达情况;采用绵羊Illumina OvineSNP50 BeadChip对3024只湖羊SRP 68基因多态位点进行基因型检测;使用SPSS 26.0软件对SRP 68基因多态位点与1974只湖羊生长性状进行关联分析。【结果】SRP 68基因在湖羊不同组织中均有表达,在45日龄和4月龄背最长肌、心脏中的表达量极显著高于其他组织(P<0.01),在6月龄背最长肌中的表达量极显著高于其他组织(P<0.01)。SRP 68基因rs421715384 G>A位点在湖羊群体中处于中度多态性(0.25<PIC<0.5),AA和GG基因型个体初生重和2月龄体重均显著高于GA基因型(P<0.05),AA基因型个体5月龄体高显著高于GA和GG基因型(P<0.05),GG基因型个体6月龄体重、管围和胸宽均显著高于AA基因型(P<0.05)。【结论】SRP 68基因与湖羊肌肉发育密切相关,rs421715384 G>A位点可作为湖羊生长性状的潜在分子标记,为湖羊分子育种提供参考。 展开更多
关键词 湖羊 SRP 68基因 组织表达 关联分析
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湖羊胚胎来源成肌细胞的培养方法改良与特性分析 被引量:1
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作者 刘璐璐 胡文萍 +5 位作者 尚明玉 王欣悦 冯勉 刘运辉 熊金珂 张莉 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2022年第7期1440-1451,共12页
为获得湖羊(Ovis aries)胚胎来源骨骼肌成肌细胞,本研究采集72日龄湖羊胚胎四肢骨骼肌组织,并对现有细胞培养技术进行改良和比较,结合差速贴壁法分离和纯化湖羊骨骼肌成肌细胞,对分离获得的骨骼肌成肌细胞进行鉴定、传代培养及诱导分化... 为获得湖羊(Ovis aries)胚胎来源骨骼肌成肌细胞,本研究采集72日龄湖羊胚胎四肢骨骼肌组织,并对现有细胞培养技术进行改良和比较,结合差速贴壁法分离和纯化湖羊骨骼肌成肌细胞,对分离获得的骨骼肌成肌细胞进行鉴定、传代培养及诱导分化等研究。结果表明,本研究采用的改良方法可高效获得湖羊胚胎来源骨骼肌成肌细胞,获得的细胞具有较强的增殖能力,可连续培养30代仍保持正常细胞形态。利用低浓度马血清培养体系,可成功诱导湖羊骨骼肌成肌细胞向肌管分化,同时培养至第10代时肌管数量显著增加。RT-qPCR检测结果表明,骨骼成肌细胞标志性基因PAX7、MYOD、desmin和MYOG均表达,且随传代次数增加表达量逐渐降低;培养至第10代时MYF5基因表达量显著增加。细胞免疫荧光结果表明,第28代骨骼肌成肌细胞标志蛋白横纹肌辅肌动蛋白α(αsarcomeric actin)基因表达。综上所述,本研究采用的改良方法高效可靠,可满足较高纯度湖羊骨骼肌成肌细胞的分离纯化和培养,并为其他动物骨骼肌成肌细胞的分离纯化和培养提供依据和参考。 展开更多
关键词 湖羊 骨骼肌 成肌细胞
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