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云南独龙鸡和红原鸡卵巢组织转录组水平的比较分析
1
作者
丁玥竹
任宇
+6 位作者
扈孟雪
燕文荃
郭爱伟
周杰珑
吴培福
陈粉粉
刘莉莉
《江苏农业科学》
北大核心
2023年第5期38-44,共7页
为明确独龙鸡的基因功能和种质特性,试验采集3羽健康状况良好的独龙鸡卵巢组织进行转录组测序,并与饲养条件基本相似并且同周龄的红原鸡卵巢组织进行比较。结果表明,与红原鸡相比,独龙鸡中差异表达基因共有7404个。KEGG和GO富集分析表明...
为明确独龙鸡的基因功能和种质特性,试验采集3羽健康状况良好的独龙鸡卵巢组织进行转录组测序,并与饲养条件基本相似并且同周龄的红原鸡卵巢组织进行比较。结果表明,与红原鸡相比,独龙鸡中差异表达基因共有7404个。KEGG和GO富集分析表明,差异表达基因主要富集在GTP酶激活剂活性、膜结构、泛素蛋白连接酶活性和ATP结合等过程,并参与Ras信号通路、硒化合物的代谢通路、SNARE因子在囊泡运输中的相互作用等通路。对显著性通路分析发现,独龙鸡在蛋品质和免疫抗性上具有一定优势,但在产蛋性能上与红原鸡还存在一定差距。说明NCBP1、NCBP2、TXNRD1、PTEN、ENOX1基因主要富集在抗性、产蛋性能和蛋品质相关通路中,可进一步深入研究。
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关键词
独龙鸡
红原鸡
卵巢组织
转录组测序
差异表达基因
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职称材料
奶牛胃肠道微生物调控乳脂生成的研究进展
2
作者
扈孟雪
丁玥竹
+2 位作者
燕文荃
陈韬
刘莉莉
《黑龙江畜牧兽医》
CAS
北大核心
2023年第10期44-48,共5页
牛奶中含乳脂、乳蛋白和乳糖等物质,是一种天然的优质食品。乳脂中富含的不饱和脂肪酸对人类健康有积极作用。动物胃肠道微生物与宿主共存,并伴随宿主进化,与胃肠道构成了复杂的微生态系统,通过肠-胃轴及肠-脑轴等参与宿主食物降解、营...
牛奶中含乳脂、乳蛋白和乳糖等物质,是一种天然的优质食品。乳脂中富含的不饱和脂肪酸对人类健康有积极作用。动物胃肠道微生物与宿主共存,并伴随宿主进化,与胃肠道构成了复杂的微生态系统,通过肠-胃轴及肠-脑轴等参与宿主食物降解、营养吸收、免疫调节等重要生理活动,对宿主的生产性状和健康产生重要影响。然而,目前对胃肠道微生物及其代谢物调控奶牛乳汁中乳脂的生成机制知之甚少。文章综述了奶牛瘤胃微生物及肠道微生物在乳脂生成过程中的调控作用,以期为深入研究胃肠道微生物在奶牛乳脂生成过程中的作用机制提供参考。
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关键词
奶牛
乳汁
乳脂生成
瘤胃微生物
肠道微生物
胃-肠轴
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职称材料
VPS28通过泛素化信号通路调控奶牛乳腺上皮细胞中乳蛋白的合成
被引量:
2
3
作者
任宇
燕文荃
+5 位作者
丁玥竹
扈孟雪
周杰珑
吴培福
陈粉粉
刘莉莉
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第8期2558-2567,共10页
旨在分析VPS28基因调控乳蛋白合成的分子机制,为奶牛泌乳性状的分子育种奠定理论基础。本研究首先利用RNA干扰(RNA interference,RNAi)技术敲降奶牛原代乳腺上皮细胞(bovine mammary epithelial cells,BMECs)中VPS28基因的表达水平,检...
旨在分析VPS28基因调控乳蛋白合成的分子机制,为奶牛泌乳性状的分子育种奠定理论基础。本研究首先利用RNA干扰(RNA interference,RNAi)技术敲降奶牛原代乳腺上皮细胞(bovine mammary epithelial cells,BMECs)中VPS28基因的表达水平,检测与乳蛋白合成、泛素化-溶酶体和泛素化-蛋白酶体通路相关的11个基因、泛素蛋白的表达水平及蛋白酶体活性;然后抑制BMECs中蛋白酶体和溶酶体的活性,检测酪蛋白相关基因、核糖体蛋白的表达水平;最后利用同位素标记相对和绝对定量(isobaric tags for relative and absolute quantification,iTRAQ)比较蛋白质组学分析敲降前后BMECs的差异表达蛋白。结果表明,敲降VPS28基因后,CSN1S1、CSN2、CSN3、RPS8、UBC、PSMC3、PSMC5基因均显著上调,PSMD12显著下调;抑制蛋白酶体后,CSN1S1、CSN2、CSN3显著上调,RPL13显著下调;抑制溶酶体活性后酪蛋白相关基因表达不显著;iTRAQ结果共筛选出129个差异表达蛋白,下调蛋白主要富集在核糖体、溶酶体、剪切体等相关通路,上调蛋白主要富集在内质网的蛋白质加工、加压素调控的水重吸收过程、RNA转运等通路中。研究表明,VPS28基因可通过泛素化信号通路影响BMECs中乳蛋白的合成。
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关键词
VPS28
乳蛋白
泛素化
RNAI
ITRAQ
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职称材料
题名
云南独龙鸡和红原鸡卵巢组织转录组水平的比较分析
1
作者
丁玥竹
任宇
扈孟雪
燕文荃
郭爱伟
周杰珑
吴培福
陈粉粉
刘莉莉
机构
西南林业大学生命科学学院
出处
《江苏农业科学》
北大核心
2023年第5期38-44,共7页
基金
国家自然科学基金(编号:31902152)
云南省教育厅科学研究基金项目(研究生类)(编号:2021Y267)
+2 种基金
云南省教育厅科学研究基金教师项目(编号:2018JS333)
西南林业大学博士科研启动基金(编号:112119)
云南省科技厅基础研究项目(编号:2019FD06)。
文摘
为明确独龙鸡的基因功能和种质特性,试验采集3羽健康状况良好的独龙鸡卵巢组织进行转录组测序,并与饲养条件基本相似并且同周龄的红原鸡卵巢组织进行比较。结果表明,与红原鸡相比,独龙鸡中差异表达基因共有7404个。KEGG和GO富集分析表明,差异表达基因主要富集在GTP酶激活剂活性、膜结构、泛素蛋白连接酶活性和ATP结合等过程,并参与Ras信号通路、硒化合物的代谢通路、SNARE因子在囊泡运输中的相互作用等通路。对显著性通路分析发现,独龙鸡在蛋品质和免疫抗性上具有一定优势,但在产蛋性能上与红原鸡还存在一定差距。说明NCBP1、NCBP2、TXNRD1、PTEN、ENOX1基因主要富集在抗性、产蛋性能和蛋品质相关通路中,可进一步深入研究。
关键词
独龙鸡
红原鸡
卵巢组织
转录组测序
差异表达基因
分类号
S831.2 [农业科学—畜牧学]
下载PDF
职称材料
题名
奶牛胃肠道微生物调控乳脂生成的研究进展
2
作者
扈孟雪
丁玥竹
燕文荃
陈韬
刘莉莉
机构
西南林业大学生命科学学院
中国移动通信集团云南有限公司
出处
《黑龙江畜牧兽医》
CAS
北大核心
2023年第10期44-48,共5页
基金
国家自然科学基金项目(31902152)
云南省科技厅基础研究项目(2019FD069)
+1 种基金
云南省教育厅教师基础研究项目(2018JS333)
西南林业大学博士科研启动经费项目(119112)。
文摘
牛奶中含乳脂、乳蛋白和乳糖等物质,是一种天然的优质食品。乳脂中富含的不饱和脂肪酸对人类健康有积极作用。动物胃肠道微生物与宿主共存,并伴随宿主进化,与胃肠道构成了复杂的微生态系统,通过肠-胃轴及肠-脑轴等参与宿主食物降解、营养吸收、免疫调节等重要生理活动,对宿主的生产性状和健康产生重要影响。然而,目前对胃肠道微生物及其代谢物调控奶牛乳汁中乳脂的生成机制知之甚少。文章综述了奶牛瘤胃微生物及肠道微生物在乳脂生成过程中的调控作用,以期为深入研究胃肠道微生物在奶牛乳脂生成过程中的作用机制提供参考。
关键词
奶牛
乳汁
乳脂生成
瘤胃微生物
肠道微生物
胃-肠轴
Keywords
dairy cows
milk
milk fat synthesis
rumen microorganisms
gut microorganisms
gastrointestinal axis
分类号
F326.3 [经济管理—产业经济]
下载PDF
职称材料
题名
VPS28通过泛素化信号通路调控奶牛乳腺上皮细胞中乳蛋白的合成
被引量:
2
3
作者
任宇
燕文荃
丁玥竹
扈孟雪
周杰珑
吴培福
陈粉粉
刘莉莉
机构
西南林业大学生命科学学院
出处
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第8期2558-2567,共10页
基金
国家自然科学基金(31902152)
云南省教育厅科学研究基金研究生项目(2021Y267)
+2 种基金
云南省教育厅科学研究基金教师项目(2018JS333)
西南林业大学博士科研启动基金(112119)
云南省科技厅基础研究项目(2019FD06)。
文摘
旨在分析VPS28基因调控乳蛋白合成的分子机制,为奶牛泌乳性状的分子育种奠定理论基础。本研究首先利用RNA干扰(RNA interference,RNAi)技术敲降奶牛原代乳腺上皮细胞(bovine mammary epithelial cells,BMECs)中VPS28基因的表达水平,检测与乳蛋白合成、泛素化-溶酶体和泛素化-蛋白酶体通路相关的11个基因、泛素蛋白的表达水平及蛋白酶体活性;然后抑制BMECs中蛋白酶体和溶酶体的活性,检测酪蛋白相关基因、核糖体蛋白的表达水平;最后利用同位素标记相对和绝对定量(isobaric tags for relative and absolute quantification,iTRAQ)比较蛋白质组学分析敲降前后BMECs的差异表达蛋白。结果表明,敲降VPS28基因后,CSN1S1、CSN2、CSN3、RPS8、UBC、PSMC3、PSMC5基因均显著上调,PSMD12显著下调;抑制蛋白酶体后,CSN1S1、CSN2、CSN3显著上调,RPL13显著下调;抑制溶酶体活性后酪蛋白相关基因表达不显著;iTRAQ结果共筛选出129个差异表达蛋白,下调蛋白主要富集在核糖体、溶酶体、剪切体等相关通路,上调蛋白主要富集在内质网的蛋白质加工、加压素调控的水重吸收过程、RNA转运等通路中。研究表明,VPS28基因可通过泛素化信号通路影响BMECs中乳蛋白的合成。
关键词
VPS28
乳蛋白
泛素化
RNAI
ITRAQ
Keywords
VPS28
milk protein
ubiquitination
RNAi
iTRAQ
分类号
S823.91 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
云南独龙鸡和红原鸡卵巢组织转录组水平的比较分析
丁玥竹
任宇
扈孟雪
燕文荃
郭爱伟
周杰珑
吴培福
陈粉粉
刘莉莉
《江苏农业科学》
北大核心
2023
0
下载PDF
职称材料
2
奶牛胃肠道微生物调控乳脂生成的研究进展
扈孟雪
丁玥竹
燕文荃
陈韬
刘莉莉
《黑龙江畜牧兽医》
CAS
北大核心
2023
0
下载PDF
职称材料
3
VPS28通过泛素化信号通路调控奶牛乳腺上皮细胞中乳蛋白的合成
任宇
燕文荃
丁玥竹
扈孟雪
周杰珑
吴培福
陈粉粉
刘莉莉
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022
2
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