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海蜇4个自然群体遗传多样性的微卫星标记分析
被引量:
10
1
作者
狄明玉
周遵春
+5 位作者
李云峰
田梅琳
侯红漫
李玉龙
鲍相渤
赫崇波
《水产科学》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第6期762-768,共7页
利用30对荧光标记微卫星引物对天津大港、辽宁盘锦、山东烟台、江苏射阳近海4个自然群体的120个海蜇样本进行遗传多样性分析。结果显示,各群体平均等位基因数为4.0333~6.8333个,平均观测杂合度为0.3906~0.5059,平均期望杂合度为0.4353~0...
利用30对荧光标记微卫星引物对天津大港、辽宁盘锦、山东烟台、江苏射阳近海4个自然群体的120个海蜇样本进行遗传多样性分析。结果显示,各群体平均等位基因数为4.0333~6.8333个,平均观测杂合度为0.3906~0.5059,平均期望杂合度为0.4353~0.5986,4个群体的多态信息含量为0.3902~0.5497。遗传距离分析显示,盘锦群体和烟台群体的遗传距离最小(0.0653),亲缘关系最近;而盘锦群体与射阳群体之间的遗传距离最大(0.1629),亲缘关系最远。基于Nei′s遗传距离构建的系统进化树显示,盘锦和烟台群体聚为一支,之后再与大港群体聚为一支,最后与射阳群体聚为一类。综上,4个群体的遗传多样性水平处于中高程度,遗传距离与试验群体地理距离基本相符。本研究的结果将为海蜇分子遗传育种和种质保护提供参考依据。
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关键词
海蜇
自然群体
微卫星
遗传多样性
下载PDF
职称材料
海蜇微卫星标记开发及自然、养殖群体遗传多样性分析
被引量:
4
2
作者
卢彦先
狄明玉
+5 位作者
李云峰
周遵春
侯红漫
赫崇波
王绍政
高美玲
《水产科学》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第4期472-479,共8页
为探明海蜇养殖群体的种质情况,了解海蜇自然群体与养殖群体的遗传多样性水平,本研究基于Illumina高通量测序获得的海蜇转录组数据,利用MISA软件筛选出5088个微卫星位点,挑选出100个微卫星位点设计引物,58个位点扩增出目的条带,其中25...
为探明海蜇养殖群体的种质情况,了解海蜇自然群体与养殖群体的遗传多样性水平,本研究基于Illumina高通量测序获得的海蜇转录组数据,利用MISA软件筛选出5088个微卫星位点,挑选出100个微卫星位点设计引物,58个位点扩增出目的条带,其中25对微卫星引物具有多态性,并对江苏自然群体和辽宁养殖群体进行遗传多样性分析。结果显示,江苏自然群体和辽宁养殖群体的平均等位基因数分别为3.120、2.360,有效等位基因数分别为2.112、1.738,期望杂合度平均值分别为0.495、0.378,多态信息含量均值分别为0.420、0.311,香农信息指数均值分别为0.823、0.593。统计结果显示,两个群体的遗传多样性处于中度多态性水平,自然群体的遗传多样性水平稍高于养殖群体。本研究的结果为海蜇遗传改良、遗传连锁图谱构建和种质资源评价等方面的研究提供理论基础和参考资料。
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关键词
海蜇
自然群体
养殖群体
微卫星
遗传多样性
下载PDF
职称材料
题名
海蜇4个自然群体遗传多样性的微卫星标记分析
被引量:
10
1
作者
狄明玉
周遵春
李云峰
田梅琳
侯红漫
李玉龙
鲍相渤
赫崇波
机构
大连工业大学食品学院
辽宁省海洋水产科学研究院
出处
《水产科学》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第6期762-768,共7页
基金
国家自然青年科学基金资助项目(31302173)
辽宁省海洋与渔业厅项目(201604)
文摘
利用30对荧光标记微卫星引物对天津大港、辽宁盘锦、山东烟台、江苏射阳近海4个自然群体的120个海蜇样本进行遗传多样性分析。结果显示,各群体平均等位基因数为4.0333~6.8333个,平均观测杂合度为0.3906~0.5059,平均期望杂合度为0.4353~0.5986,4个群体的多态信息含量为0.3902~0.5497。遗传距离分析显示,盘锦群体和烟台群体的遗传距离最小(0.0653),亲缘关系最近;而盘锦群体与射阳群体之间的遗传距离最大(0.1629),亲缘关系最远。基于Nei′s遗传距离构建的系统进化树显示,盘锦和烟台群体聚为一支,之后再与大港群体聚为一支,最后与射阳群体聚为一类。综上,4个群体的遗传多样性水平处于中高程度,遗传距离与试验群体地理距离基本相符。本研究的结果将为海蜇分子遗传育种和种质保护提供参考依据。
关键词
海蜇
自然群体
微卫星
遗传多样性
Keywords
Rhopilema esculenta
wild population
microsatellite
genetic diversity
分类号
Q341 [生物学—遗传学]
下载PDF
职称材料
题名
海蜇微卫星标记开发及自然、养殖群体遗传多样性分析
被引量:
4
2
作者
卢彦先
狄明玉
李云峰
周遵春
侯红漫
赫崇波
王绍政
高美玲
机构
大连花园口经济区农村经济发展局
大连工业大学食品科学与工程学院
辽宁省海洋水产科学研究院
大连理工大学生命科学与技术学院
出处
《水产科学》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第4期472-479,共8页
基金
国家自然科学青年基金资助项目(31302173)
辽宁省海洋与渔业厅项目(201604)
文摘
为探明海蜇养殖群体的种质情况,了解海蜇自然群体与养殖群体的遗传多样性水平,本研究基于Illumina高通量测序获得的海蜇转录组数据,利用MISA软件筛选出5088个微卫星位点,挑选出100个微卫星位点设计引物,58个位点扩增出目的条带,其中25对微卫星引物具有多态性,并对江苏自然群体和辽宁养殖群体进行遗传多样性分析。结果显示,江苏自然群体和辽宁养殖群体的平均等位基因数分别为3.120、2.360,有效等位基因数分别为2.112、1.738,期望杂合度平均值分别为0.495、0.378,多态信息含量均值分别为0.420、0.311,香农信息指数均值分别为0.823、0.593。统计结果显示,两个群体的遗传多样性处于中度多态性水平,自然群体的遗传多样性水平稍高于养殖群体。本研究的结果为海蜇遗传改良、遗传连锁图谱构建和种质资源评价等方面的研究提供理论基础和参考资料。
关键词
海蜇
自然群体
养殖群体
微卫星
遗传多样性
Keywords
Rhopilema esculentum
wild population
cultured population
microsatellite
genetic diversity
分类号
S917 [农业科学—水产科学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
海蜇4个自然群体遗传多样性的微卫星标记分析
狄明玉
周遵春
李云峰
田梅琳
侯红漫
李玉龙
鲍相渤
赫崇波
《水产科学》
CAS
CSCD
北大核心
2018
10
下载PDF
职称材料
2
海蜇微卫星标记开发及自然、养殖群体遗传多样性分析
卢彦先
狄明玉
李云峰
周遵春
侯红漫
赫崇波
王绍政
高美玲
《水产科学》
CAS
CSCD
北大核心
2017
4
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职称材料
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