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题名马尔尼菲篮状菌Septin基因家族鉴定及表达分析
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作者
张单
何涓
王仁巧
黄买银
李玉叶
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机构
昆明医科大学第一附属医院皮肤科
昆明医科大学第二附属医院皮肤科
云南大学生命科学学院
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出处
《微生物学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第11期4535-4544,共10页
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基金
国家自然科学基金(82272356,82260624)
云南省科技厅项目(202201AY070001-038)
+2 种基金
云南省重点研发计划(202403AC100011)
云南省兴滇英才支持计划
云南省教育厅科学研究基金(2023Y0812)。
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文摘
【背景】马尔尼菲篮状菌(Talaromyces marneffei)是重要的致死性病原真菌。【目的】探究T.marneffei隔膜蛋白Septin基因家族的基本特征和表达模式。【方法】通过生物信息学方法鉴定T.marneffei Septin基因家族成员,并分析基因结构、理化性质、二级结构、三级结构和亚细胞定位,同时通过实时荧光定量PCR技术分析Septin基因家族在T.marneffei菌丝相和酵母相不同时相的表达情况。【结果】共鉴定出5个Septin基因家族成员,氨基酸长度在346-575 aa之间,均具有GTP-CDC结合域,均属于亲水性蛋白。亚细胞定位主要位于细胞核和线粒体基质。二级结构以α螺旋和无规则卷曲为主,三级结构复杂。不同病原真菌核心Septin高度保守。TmSep2和TmSep4 mRNA表达量在酵母相较菌丝相明显升高,TmSep5 mRNA表达量在酵母相较菌丝相明显降低。TmSep1和TmSep3 mRNA表达量在酵母相较菌丝相略有上升,但无显著差异。【结论】Septin基因家族各基因在T.marneffei双相转换不同时相表达情况不同,部分差异显著,暗示其可能在T.marneffei双相形态转换和致病中发挥重要作用。本研究为进一步探究Septin在T.marneffei中发挥的功能及调控机制提供理论依据。
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关键词
马尔尼菲篮状菌
隔膜蛋白
生物信息学分析
实时荧光定量PCR
基因表达
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Keywords
Talaromyces marneffei
Septin
bioinformatics analysis
RT-qPCR
gene expression
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分类号
R379
[医药卫生—病原生物学]
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