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基于数据库探索HLA-DPB1基因在泛癌中的潜在价值
1
作者
王司颖
闫瑞玲
+1 位作者
管保章
张伟
《暨南大学学报(自然科学与医学版)》
CAS
北大核心
2023年第5期478-493,共16页
目的:探索HLA-DPB1在泛癌中的表达及其对患者预后、肿瘤免疫细胞浸润的影响及作用机制。方法:从UCSC XENA、TCGA数据库获取基因转录组和临床数据,从UALCAN、HPA数据库获取HLA-DPB1蛋白质在泛癌中的表达情况;使用Cox回归和Kaplan-Meier...
目的:探索HLA-DPB1在泛癌中的表达及其对患者预后、肿瘤免疫细胞浸润的影响及作用机制。方法:从UCSC XENA、TCGA数据库获取基因转录组和临床数据,从UALCAN、HPA数据库获取HLA-DPB1蛋白质在泛癌中的表达情况;使用Cox回归和Kaplan-Meier分析评估HLA-DPB1在泛癌中的预后价值;使用ESTIMATE算法和Timer数据库分析HLA-DPB1表达与免疫细胞浸润的相关性;使用cBioPortal数据库分析泛癌中HLA-DPB1的基因突变及其对预后的影响;使用STRING,GEPIA2及R包对HLA-DPB1相关基因进行GO功能注释及KEGG通路富集分析,进一步通过GSEA软件分析HLA-DPB1的生物学功能;采用Cancer SEA数据库分析HLA-DPB1对单个细胞功能状态的影响。结果:HLA-DPB1在大多数肿瘤组织中表达升高,HLA-DPB1高表达与宫颈鳞癌和腺癌(P=0.03)、肾透明细胞癌(P=1.8×10^(-3))、肺腺癌(P=1.0×10^(-4))、子宫内膜癌(P=0.02)、肉瘤(P=4.5×10^(-3))、皮肤黑色素瘤(P=5.6×10^(-7))的良好预后显著相关。HLA-DPB1基因突变存在于多种恶性肿瘤中,是皮肤恶性肿瘤的不良预后因素。HLA-DPB1表达促进肿瘤微环境中的免疫细胞浸润和免疫检查点相关基因的表达。HLA-DPB1可能通过FcεRI介导Ca^(2+)动员、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)激活及NF-κB激活等信号通路参与肿瘤免疫、炎症反应过程。结论:HLA-DPB1的表达水平与不同肿瘤患者的临床预后及免疫细胞浸润高度相关,HLA-DPB1有望成为新的肿瘤预后标志物和免疫治疗的潜在靶点。
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关键词
HLA-DPB1
泛癌分析
免疫浸润
生存预后
下载PDF
职称材料
女性绝经后肥胖促进乳腺癌发生及转移的研究进展
被引量:
4
2
作者
张瑞琪
王司颖
张伟
《中华内分泌外科杂志》
CAS
2022年第2期244-247,共4页
研究女性绝经后肥胖与乳腺癌发生进展及预后的相关性,为乳腺癌防治提供理论依据,本综述基于Pubmed、中国知网等文献检索平台,综合多篇国内外相关研究分析发现,肥胖是绝经后女性罹患乳腺癌并导致不良预后的重要危险因素。女性绝经后肥胖...
研究女性绝经后肥胖与乳腺癌发生进展及预后的相关性,为乳腺癌防治提供理论依据,本综述基于Pubmed、中国知网等文献检索平台,综合多篇国内外相关研究分析发现,肥胖是绝经后女性罹患乳腺癌并导致不良预后的重要危险因素。女性绝经后肥胖者体内雌激素水平升高直接增强乳腺癌细胞的肿瘤学行为;脂肪组织通过释放炎症介质构成有利于肿瘤生长的免疫环境,间接促进肿瘤发展;肥胖还诱导脂肪干细胞分化成肿瘤相关成纤维细胞进而增强乳腺癌细胞增殖及侵袭潜能。肥胖增加绝经后女性患乳腺癌的风险,并诱导乳腺癌转移,促进疾病进展,增加患者癌性死亡风险。该研究明确了女性绝经后人群中肥胖与乳腺癌发生进展及预后的相关性,为乳腺癌的防治提供新思路,具有重要的临床研究价值。
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关键词
肥胖
绝经后
乳腺癌
雌激素
炎症介质
脂肪干细胞
肿瘤相关成纤维细胞
原文传递
题名
基于数据库探索HLA-DPB1基因在泛癌中的潜在价值
1
作者
王司颖
闫瑞玲
管保章
张伟
机构
暨南大学附属第一医院乳腺外科
暨南大学附属第一医院妇产科
暨南大学附属第一医院肾脏内科
出处
《暨南大学学报(自然科学与医学版)》
CAS
北大核心
2023年第5期478-493,共16页
基金
广州市科技计划项目(2023A03J0599,2023A03J0568,202201020068)。
文摘
目的:探索HLA-DPB1在泛癌中的表达及其对患者预后、肿瘤免疫细胞浸润的影响及作用机制。方法:从UCSC XENA、TCGA数据库获取基因转录组和临床数据,从UALCAN、HPA数据库获取HLA-DPB1蛋白质在泛癌中的表达情况;使用Cox回归和Kaplan-Meier分析评估HLA-DPB1在泛癌中的预后价值;使用ESTIMATE算法和Timer数据库分析HLA-DPB1表达与免疫细胞浸润的相关性;使用cBioPortal数据库分析泛癌中HLA-DPB1的基因突变及其对预后的影响;使用STRING,GEPIA2及R包对HLA-DPB1相关基因进行GO功能注释及KEGG通路富集分析,进一步通过GSEA软件分析HLA-DPB1的生物学功能;采用Cancer SEA数据库分析HLA-DPB1对单个细胞功能状态的影响。结果:HLA-DPB1在大多数肿瘤组织中表达升高,HLA-DPB1高表达与宫颈鳞癌和腺癌(P=0.03)、肾透明细胞癌(P=1.8×10^(-3))、肺腺癌(P=1.0×10^(-4))、子宫内膜癌(P=0.02)、肉瘤(P=4.5×10^(-3))、皮肤黑色素瘤(P=5.6×10^(-7))的良好预后显著相关。HLA-DPB1基因突变存在于多种恶性肿瘤中,是皮肤恶性肿瘤的不良预后因素。HLA-DPB1表达促进肿瘤微环境中的免疫细胞浸润和免疫检查点相关基因的表达。HLA-DPB1可能通过FcεRI介导Ca^(2+)动员、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)激活及NF-κB激活等信号通路参与肿瘤免疫、炎症反应过程。结论:HLA-DPB1的表达水平与不同肿瘤患者的临床预后及免疫细胞浸润高度相关,HLA-DPB1有望成为新的肿瘤预后标志物和免疫治疗的潜在靶点。
关键词
HLA-DPB1
泛癌分析
免疫浸润
生存预后
Keywords
HLA-DPB1
pan-cancer analysis
immune infiltration
survival prognosis
分类号
R73 [医药卫生—肿瘤]
下载PDF
职称材料
题名
女性绝经后肥胖促进乳腺癌发生及转移的研究进展
被引量:
4
2
作者
张瑞琪
王司颖
张伟
机构
广东省暨南大学附属第一医院乳腺外科
出处
《中华内分泌外科杂志》
CAS
2022年第2期244-247,共4页
基金
国家自然科学基金(81602328)。
文摘
研究女性绝经后肥胖与乳腺癌发生进展及预后的相关性,为乳腺癌防治提供理论依据,本综述基于Pubmed、中国知网等文献检索平台,综合多篇国内外相关研究分析发现,肥胖是绝经后女性罹患乳腺癌并导致不良预后的重要危险因素。女性绝经后肥胖者体内雌激素水平升高直接增强乳腺癌细胞的肿瘤学行为;脂肪组织通过释放炎症介质构成有利于肿瘤生长的免疫环境,间接促进肿瘤发展;肥胖还诱导脂肪干细胞分化成肿瘤相关成纤维细胞进而增强乳腺癌细胞增殖及侵袭潜能。肥胖增加绝经后女性患乳腺癌的风险,并诱导乳腺癌转移,促进疾病进展,增加患者癌性死亡风险。该研究明确了女性绝经后人群中肥胖与乳腺癌发生进展及预后的相关性,为乳腺癌的防治提供新思路,具有重要的临床研究价值。
关键词
肥胖
绝经后
乳腺癌
雌激素
炎症介质
脂肪干细胞
肿瘤相关成纤维细胞
Keywords
Obesity
Postmenopausal
Breast cancer
Estrogen
Inflammatory mediators
ASCs
CAFs
分类号
R655.8 [医药卫生—外科学]
R737.9 [医药卫生—肿瘤]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于数据库探索HLA-DPB1基因在泛癌中的潜在价值
王司颖
闫瑞玲
管保章
张伟
《暨南大学学报(自然科学与医学版)》
CAS
北大核心
2023
0
下载PDF
职称材料
2
女性绝经后肥胖促进乳腺癌发生及转移的研究进展
张瑞琪
王司颖
张伟
《中华内分泌外科杂志》
CAS
2022
4
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已选择
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引证文献
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