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成都动物园野生动物源贾第虫的多位点基因分型鉴定
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作者 李威 屈羽 +7 位作者 钟志军 杨平 李云娇 王吴优 刘学涵 谢娜 邓家波 彭广能 《四川大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2017年第1期185-190,共6页
为了解四川省成都市动物园野生动物贾第虫的流行及基因型,本研究采集了146份不同野生动物的新鲜粪便并提取基因组DNA.通过巢式PCR扩增β-giardin、tpi和gdh基因,扩增产物测序后进行种系发育分析.结果表明,CDZOO1黇鹿源和CDZOO3龟源贾第... 为了解四川省成都市动物园野生动物贾第虫的流行及基因型,本研究采集了146份不同野生动物的新鲜粪便并提取基因组DNA.通过巢式PCR扩增β-giardin、tpi和gdh基因,扩增产物测序后进行种系发育分析.结果表明,CDZOO1黇鹿源和CDZOO3龟源贾第虫通过多位点基因分型(MLG)鉴定为AI-1亚型;CDZOO2鹿源贾第虫为E型(β-giardin基因位点);CDZOO4黇鹿源贾第虫为A型(β-giardin和tpi基因位点);CDZOO5浣熊源和CDZOO6细尾獴源贾第虫在β-giardin位点为D型而在tpi位点为A型. 展开更多
关键词 贾第虫 β-giardin基因 tpi基因 gdh基因 MLG 种系发育 人畜共患
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林麝肺炎克雷伯氏菌的分离鉴定及其kp05372基因的生物信息学分析 被引量:8
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作者 赵位 王吴优 +2 位作者 程建国 田青 罗燕 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2017年第12期23-30,共8页
【目的】对1株疑似肺炎克雷伯氏菌进行分离鉴定及全基因测序分析,并对发现的新基因kp05372编码产物进行生物信息学分析。【方法】采用传统的细菌鉴定方法和分子生物学方法,分别对采自麝粪便的1株病原菌的生理生化特征及16SrRNA序列进行... 【目的】对1株疑似肺炎克雷伯氏菌进行分离鉴定及全基因测序分析,并对发现的新基因kp05372编码产物进行生物信息学分析。【方法】采用传统的细菌鉴定方法和分子生物学方法,分别对采自麝粪便的1株病原菌的生理生化特征及16SrRNA序列进行测定;以小鼠感染试验和半数致死量(LD50)测试该病原菌的致病性;用全基因组测序方法对病原菌基因组进行测序分析,并对发现的新基因编码产物进行生物信息学分析。【结果】经生理生化试验和16SrRNA序列分析发现,分离菌株为肺炎克雷伯氏菌,命名为GPKP,其对小鼠致死的LD50为6.3×107CFU/mL。该菌基因组大小为4 879 707bp,包含5 490个开放阅读框,共注释到22组COG功能。kp05372基因编码产物由302个氨基酸组成,无信号肽,是一种不稳定的、在细胞内发挥生理作用的亲水性蛋白。【结论】分离的细菌为肺炎克雷伯氏菌,kp05372基因编码产物属于典型的LysR家族转录因子(LTTR)。 展开更多
关键词 林麝 肺炎克雷伯氏菌 kp05372 生物信息学分析
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林麝源解没食子酸链球菌的分离鉴定及进化分析 被引量:1
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作者 姜俊庆 程建国 +3 位作者 赵位 罗燕 王吴优 田青 《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2017年第10期20-23,共4页
采用传统的细菌鉴定方法和分子生物学方法,对四川省某养麝场2只患化脓性疾病林麝病原菌进行生理生化特征和16S rRNA基因序列测定,以小鼠感染试验测试分离菌株的致病性,用K-B纸片扩散法进行药敏试验,并通过构建进化树对分离菌株进行进化... 采用传统的细菌鉴定方法和分子生物学方法,对四川省某养麝场2只患化脓性疾病林麝病原菌进行生理生化特征和16S rRNA基因序列测定,以小鼠感染试验测试分离菌株的致病性,用K-B纸片扩散法进行药敏试验,并通过构建进化树对分离菌株进行进化分析。该研究分别从2只林麝机体内分离出1株解没食子酸链球菌解没食子酸亚种和1株解没食子酸链球菌马其顿亚种,两分离菌均能够引起小鼠肝脏肿大,且对多类抗生素产生耐药性,进化分析显示,2分离菌处于不同的分支。本试验结果为进一步研究解没食子酸链球菌以及林麝化脓性疾病奠定基础。 展开更多
关键词 林麝 解没食子酸链球菌 分离鉴定 进化分析
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林麝肺源致病性大肠杆菌感染BALB/c小鼠模型的建立及评价 被引量:1
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作者 王吴优 田青 +3 位作者 程建国 赵位 邓磊 罗燕 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第6期1333-1341,共9页
【背景】林麝肺源致病性大肠杆菌(Lung pathogenic Escherichia coli,LPEC)属于肠外致病性大肠杆菌(Extraintestinal pathogenic Escherichia coli,Ex PEC),是重要的人畜共患病病原菌之一。【目的】建立林麝肺源致病性大肠杆菌感染BALB/... 【背景】林麝肺源致病性大肠杆菌(Lung pathogenic Escherichia coli,LPEC)属于肠外致病性大肠杆菌(Extraintestinal pathogenic Escherichia coli,Ex PEC),是重要的人畜共患病病原菌之一。【目的】建立林麝肺源致病性大肠杆菌感染BALB/c小鼠模型,为研究林麝LPEC O78的致病性提供实验基础。【方法】采用实验室保存的林麝LPEC优势血清型O78菌株腹腔注射BALB/c小鼠,计算LD50,确定造模感染剂量,通过监测感染后体重、生化指标、器官中细菌定殖量变化,以及进行细菌分离鉴定和组织病理学检查,评价造模效果。【结果】确定了LPEC O78致BALB/c小鼠的LD50为3.6×108 CFU/m L。实验组小鼠于攻毒后3 h出现精神萎靡、食欲不振、反应迟钝,剖检见肺脏及肝脏肿大、小肠出血。24 h内体重下降3.2 g左右,随后缓慢升高。生化指标中除尿酸含量与对照组不显著(P>0.05)外,谷丙转氨酶、谷草转氨酶、总蛋白、白蛋白、磷、钙、镁、总胆红素、尿素、血糖、胆碱酯酶和乳酸脱氢酶等指标均高于对照组水平,且组间变化显著(P<0.05)。各器官均有细菌定殖,心、脾及肾脏24 h达到最高,肝、肺及肠道12 h达到最高,之后随时间逐渐减少。小鼠各器官有不同程度的炎性细胞浸润和细胞坏死。【结论】成功建立了林麝LPEC O78感染BALB/c小鼠模型,为林麝LPEC O78的发病机制、病理生理等方面的研究奠定了一定基础。 展开更多
关键词 林麝 肺源致病性大肠杆菌 BALB/C小鼠 感染模型
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