藏系绵羊、新疆细毛羊及阿勒泰羊mtDNA D-loop基因序列分析及系统进化研究

为研究藏系绵羊的贾洛、红原、欧拉3个类群与新疆细毛羊、阿勒泰羊的遗传多样性及系统进化关系,试验对该5个类群89个绵羊个体的mtDNA D-loop区全序列进行测序分析。结果显示，该5个绵羊类群89个个体总共发现有168个多态性位点，单一多态位点（singleton variable sites） 82个，简约信息位点（parsimony informative sites）86个，碱基A＋T的平均含量达到了62.5%，明显高于C＋G（37.5%），共检测到70种单倍型，核苷酸多样性（Pi）在0.01040～0.02892之间，单倍型多样性在0.640～1.000之间，平均核苷酸差异数（K）为18.340，Tajima’s D中性检验发现这5个类群均不显著。通过构建NJ进化树结果表明，在藏系绵羊中红原类群与欧拉类群的亲缘关系最近，其次藏系绵羊中贾洛类群才与红原、欧拉类群聚为一类，再依次聚类的为新疆细毛羊、欧洲摩弗伦羊、东方盘羊；盘羊与羱羊单独聚为一类。该5个类群存在明显的3个母系起源。

优质肉鸡ADSL及GART基因PCR-SSCP分析

采用PCR-SSCP技术对大恒鸡S01品系共计300只鸡的ADSL及GART基因进行多态性分析,结果显示:ADSL基因第9个外显子存在一个SNP位点,测序结果显示其纯合子CC与TT相比有一个C10191T的单碱基突变;GART基因在5’侧翼序列存一个SNP位点,其纯合子AA与BB相比有一个C153T单碱基突变,采用独立性χ2分析发现,ADSL及GART基因都达到Hardy-Weinberg平衡.

基于D-loop区序列分析的四川省三个地方鸡种遗传多样性及母系亲缘关系研究

为研究四川省少数民族地区泸宁鸡、米易鸡、草科鸡的遗传多样性及母系亲缘关系,通过PCR扩增、产物回收、测序的方法,获得各鸡种30个样本的mtDNA D-loop区的部分序列,利用DNAMAN、MEGA5、DnaSP、Network等生物信息学软件对测序结果进行分析。对90个个体mtDNA D-loop区589 bp的片段通过数据分析及聚类分析,构建了单倍型网络关系图及品种聚类图等。泸宁鸡、米易鸡、草科鸡具有较近的亲缘关系,推测3个地方鸡种起源于分布在印度支那半岛、泰国、苏门答腊的红原鸡Gallus gallus gallus亚种。

HPLC法测定家禽肌肉中IMP的含量

目的:建立HPLC法测定家禽肌肉中IMP含量的方法.方法:采用DIKMATMPlatisil(铂金)ODS C18柱(150×4.6mm),流动相A:0.04M磷酸二氢钾0.06M磷酸氢二钾用0.5M和5M调至PH为7流动相B:甲醇,柱温:25℃,检测波长为254nm,流速1mL/min.结果:IMP在5μg/ml^250μg/ml范围内呈良好的线性范围,回归方程为y=0.0843x-1.5187,R2=0.9994.结论:该法简便可靠,能准确测定家禽肌肉中IMP的含量,适用于肉品质及其风味物质的准确性的检测.

泸宁鸡和米易鸡MSTN基因多态性及其与生长性状的关联性

为探明泸宁鸡、米易鸡肌肉生长抑制素(myostatin,MSTN)基因多态性与生长性状的关联性,采用PCR-SSCP法对MSTN基因的多态性进行检测,同时对泸宁鸡、米易鸡的主要生长性状进行测定,并对MSTN基因多态性与生长性状的关联性进行分析。结果表明:MSTN基因外显子1中有2 100bp(C/T)和2 109bp(C/T)2个SNPs位点,未引起氨基酸变异,为同义突变,表现出CT、TT(2 100bp)和CC、CT、TT(2 109bp)5种基因型,与心脏重、胫围和屠宰率有相关性;泸宁鸡存在CC、CT和TT 3种单倍型,米易鸡存在CC、TC和TT 3种单倍型。内含子1中有4 295bp(T/C)、4 359bp(T/C)和4 404bp(A/C)3个SNPs位点,表现出CT(4 295bp)、CT(4 359bp)、TT、CT和CC(4 404bp)5种基因型,与腺胃重有显著相关;泸宁鸡存在CCC和TTT 2种单倍型,米易鸡存在CCC、TTC和TTT 3种单倍型。3’非编码区有7 637bp(A/G)和7 725bp(A/G)2个SNPs位点,表现出AG(7 637bp)、AA、AG和GG(7 725bp)4种基因型,与腺胃重、腹脂重和半净膛率具有相关性;泸宁鸡存在AG、GA和GG 3种单倍型。MSTN基因是影响泸宁鸡、米易鸡主要生长性状的主效基因之一,可以作为地方鸡品种选育的候选基因。

阿勒泰羊、藏绵羊(贾洛类群、欧拉类群)Sry基因序列分析及亲缘关系研究

利用山羊Sry基因设计引物,PCR扩增获得阿勒泰羊、藏系欧拉羊、藏系贾洛羊包含Sry基因整个编码区的雄性特异性片段.经测序及人工校对、剪切获得Sry基因编码区序列.分析结果表明三个类群羊Sry基因序列完全相同,且与其他品种羊具有高度的同源性:阿勒泰羊、藏系贾洛羊、藏系欧拉羊与普通绵羊、盘羊及摩弗伦羊具有相同的Sry基因序列,亲缘关系最近,其次是赤羊,最远是大角羊.这说明,这三个类群羊可能是由中国盘羊经当地居民长期人工选育而成的地方性品种(系).

四川部分地方鸡种肌苷酸和肌内脂肪含量比较分析

为研究四川部分地方鸡肌苷酸(IMP)和肌内脂肪(IMF)含量变化规律,选取不同日龄(81、119、154、210日龄)泸宁鸡、米易鸡、草科鸡为试验材料,采用索氏浸提法、高效液相色谱法对IMP、IMF含量进行测定。结果显示:草科鸡与米易鸡4日龄段胸肌IMP含量以及81、119日龄腿肌IMP含量均高于泸宁鸡;米易鸡154日龄腿肌IMP含量极显著高于泸宁鸡、草科鸡(P<0.01),210日龄草科鸡腿肌IMP含量显极著高于泸宁鸡与米易鸡(P<0.01);各日龄段草科鸡、米易鸡、泸宁鸡均表现出胸肌IMP含量显著高于腿肌;81、119、154日龄的泸宁鸡、米易鸡IMP含量随日龄的增长而增加,154日龄后则表现出增加减缓或下降的趋势,而草科鸡则从81日龄起,IMP含量表现为下降趋势。81、119、154、210日龄米易鸡的胸肌、腿肌IMF含量均显著高于泸宁鸡;81、119日龄草科鸡的胸肌、腿肌IMF含量较泸宁鸡高,154日龄的则表现为较泸宁鸡低;泸宁鸡、米易鸡、草科鸡在81、119、154、210日龄段胸肌IMF含量均极显著高于腿肌(P<0.01);米易鸡胸腿肌IMF含量与泸宁鸡胸肌IMF含量随日龄的增长而增加;草科鸡胸肌IMF含量从81日龄起表现为随日龄的增长而下降的趋势,腿肌IMF含量则下降至154日龄后回升。综合看来,优质肉鸡中IMP总的变化趋势表现为随日龄的增长而增加,到154日龄左右时,优质肉鸡体内的IMP含量增加缓慢或开始下降,而IMF则表现为随日龄的增长而增加。以上趋势在不同鸡种间呈现出时间先后的差异,且在不同组织间的变化也不尽相同。

草科鸡MSTN基因多态性与其生长性状的相关性

为草科鸡的品种选育及品种改良提供理论依据,以MSTN基因作为候选基因,运用PCR-SSCP和DNA测序技术对MSTN基因进行扫描,研究其多态性位点与生长性状之间的关联性。结果表明:外显子1上有2 100bp(C/T)和2 109bp(C/T)2个突变位点,但未引起氨基酸变异,为同义突变;内含子1上有4 295bp(C/T)、4 359bp(C/T)、4 404bp(A/C)3个突变位点。外显子1表现出CC、CT、TT(2 109bp)和CT、TT(2 100bp)5种基因型,不同基因型间生长性状并没有表现出显著性差异;内含子1表现出CT(4 295bp)、CT(4 359bp)和CC、CT、TT(4 404bp)5种基因型,4 295bp和4 404bp位点TT基因型个体的胸肌率均显著高于CT基因型个体(P<0.05),4 359bp位点TT基因型个体的半净膛率显著高于CT基因型个体(P<0.05)。外显子1上有CC、CT、TC和TT共4种单倍型,内含子1上有CCC、CCT、CTC、CTT、TCC、TCT、TTC和TTT共8种单倍型。MSTN基因可作为影响草科鸡生长性状的候选基因。

优质肉鸡硫胺素含量以及TPK1基因的多态性分析

为研究大恒优质肉鸡硫胺素沉积规律及大恒肉鸡不同家系间硫胺素的差异,选取大恒优质肉鸡的4个品系(S08、S07×S01、D2、D1)为试验材料,采用高效液相色谱法对硫胺素含量进行测定,并对其相关基因TPK1进行多态性分析。结果显示:10周龄时,S08品系胸肌中硫胺素含量极显著高于品系D1、D2(P<0.01),4个品系中公鸡胸肌中的硫胺素含量均高于母鸡,差异不明显;10周龄时,公鸡、母鸡中腿肌的硫胺素含量极显著高于胸肌(P<0.01),公鸡中的腿肌、胸肌硫胺素含量均分别高于母鸡的腿肌、胸肌,但都差异不明显。对大恒肉鸡5个品系(S07×S05、S07、S08、S07×01、S08×01)TPK1基因的所有外显子及部分3'非编码区进行了多态性位点的检测,在3'非编码区发现了1个G878A单碱基突变,该SNP位点对腹脂质量具有显著影响(P<0.05),该基因座上的基因型NN个体的腹脂质量显著高于基因型MN个体的腹脂质量,但与大恒优质肉鸡2个品系鸡肉中硫胺素含量差异不显著。