病毒宏基因组学及其在临床诊断中的应用

近年来SARS病毒、埃博拉病毒(Ebola virus)、尼帕病毒(Nipah virus)、新型流感病毒(如H1N1,H7N9等)等新发或再发病毒疫情不断出现,对人类健康构成严重威胁。然而面对这些新发病毒性传染病,人类还没有有效的早期预防、诊断和治疗措施,因而快速的病毒检测是临床治疗、疫情防控的关键所在。传统的病毒鉴定方法包括组织细胞培养、电子显微镜观察、抗原抗体检测、基因扩增测序等,但这些方法都依赖于成熟的体外培养体系或病毒的蛋白和核酸序列已知,因此对新发病毒或者变异度较高的病毒就无能为力。病毒宏基因组学(viral metagenomics)的出现则有效地解决了这一难题,同时也促进了人类对于未知病毒的认识。病毒宏基因组学是一种新兴的病毒学研究技术,该方法不依赖于病毒培养,无需已知病毒基因序列,它可以直接以待测样本中所有病毒的遗传物质为研究对象,一次性地鉴定出样本中的所有病毒组成。本文介绍了病毒宏基因组学的产生过程、研究方法,并对其临床应用前景及局限性进行阐述。