基于网络药理学探讨六合丹治疗急性胰腺炎的物质基础和分子机制

目的探讨六合丹治疗AP的物质基础和分子机制。方法通过中医百科全书数据库(ETCM)及人类疾病信息相关数据库(OMIM、DisGeNET、HPO和NCBI)分别检索并筛选六合丹活性化学成分和对应靶点及AP的候选靶点,在STRING数据库进行蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络分析,利用CPBD及STRING数据库对相应靶点进行富集分析六合丹活性成分治疗AP所涉及的功能及通路,最后通过Cytoscape3.6.0软件构建"中药材-活性化学成分-靶点-通路"网络。结果通过数据库检索六合丹化合物、预测作用靶点及AP的疾病基因筛选出六合丹治疗AP的活性化学成分共111种,分别调控39个AP靶点。经CPBD及STRING数据库对39个靶点进行基因本体(G0)功能富集分析获得生物学过程575条,分子功能49条,细胞组成26条,通过京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集获得46条,涉及胰腺分泌、胆汁分泌、过氧化物酶体增殖物激活受体(PPAR)信号通路、脂肪消化吸收、花生四烯酸代谢和钙信号通路。结论初步明确了六合丹通过多成分、多靶点和多通路治疗AP的作用机制,为深入研究六合丹的活性化合物及作用机制奠定基础。

基于网络药理学探讨大承气汤治疗急性胰腺炎的物质基础和分子机制

采用网络药理学方法预测大承气汤治疗急性胰腺炎的物质基础和分子机制。通过数据库检索并预测大承气汤化合物的作用靶点及急性胰腺炎的疾病基因;并对关键靶点和相关活性化学成分进行分子对接验证;利用DAVID"富集分析"得到大承气汤的活性成分在治疗急性胰腺炎过程中所涉及的功能及通路,最终构建"中药材-活性化学成分-靶点-通路"综合网络。在大承气汤中发现了108种活性化学成分可与28个疾病靶点相关联,分子对接结果显示关键靶点与其对应化合物均有较强的结合能力。经DAVID富集分析得到,生物学过程438条,分子功能31条,细胞组成17条,KEGG通路富集96条。大承气汤可能通过药物反应、脂多糖反应和反向调节凋亡等生物过程,抗炎、抗氧化活性、反向调节细胞凋亡以及调节胰腺分泌等方式来实现其药效作用,涉及IL-17,TNF,NF-κB等多条信号通路。该研究运用网络药理学的方法,揭示了大承气汤以多种成分协同作用于多靶点、多信号通路治疗急性胰腺炎的分子机制,为生物实验提供理论基础。