BHMT和RFC1多态性与中国北方汉族儿童神经管缺陷的易感性研究

目的研究中国北方汉族儿童中甜菜碱同型半胱氨酸甲基转移酶基因(BHMT)和还原叶酸载体1基因(RFC1,又称SLC19A1)的单核苷酸多态性(SNPs)与神经管缺陷(NTDs)易感性的关系。方法以中国北方汉族152例NTDs患儿和169例正常对照为研究对象,采用Sequenom Mass-ARRAY分型技术对BHMT和RFC1两个基因的9个SNPs位点进行基因分型,Haploview4.2软件进行单体型分析。结果 BHMT基因rs3733890位点等位基因频率与NTDs的发病存在显著关联,且携带A等位基因儿童发生NTDs风险高于G等位基因的儿童(OR=1.408,95%CI:1.013~1.956);RFC1基因rs1051266位点等位基因和基因型频率分布与NTDs的发病存在显著关联,且携带G等位基因和GG基因型的儿童患NTDs风险分别高于A等位基因和AA基因型儿童(OR=1.492,95%CI:1.089~2.044;OR=2.020,95%CI:1.081~3.780);RFC1基因rs3788200位点等位基因频率与NTDs发病存在显著关联,携带G等位基因的儿童患NTDs风险高于携带A等位基因儿童(OR=1.368,95%CI:1.002~1.868)。同时,单体型分析结果显示BHMT基因单体型C-A-A-A(rs567754-rs3733890-rs558133-rs585800)和RFC1基因单体型G-G-G-T(rs1051296-rs3788200-rs1051266-rs4819130)可使NTDs发病风险增加,而BHMT基因单体型C-G-A-A可使NTDs发病风险降低。结论BHMT基因rs3733890和RFC1基因rs1051266、rs3788200多态性与中国北方汉族儿童NTDs的易感性相关。

中国北方汉族人群神经管缺陷患儿DACT1基因突变分析

目的探讨中国北方汉族人群神经管缺陷(NTDs)患儿与DACT1基因的相关性,为疾病的诊断及遗传咨询提供依据。方法收集163例NTDs患者和480例无亲缘关系健康个体的外周血标本,采用聚合酶链反应和DNA直接测序的方法检测DACT1基因的突变情况,并对突变位点进行生物信息学分析。结果在NTDs患者中发现6个突变位点,有4个突变位点为错义突变,分别为p.R45W、p.D142G、p.N356K、p.V702G,在正常对照中未检测到这些突变位点。其中3个位点的氨基酸残基(p.45R、p.142D、p.356N)在进化上高度保守,且这3个位点突变携带者均为女性,同时存在无脑畸形。结论中国北方汉族人群NTDs患者存在DACT1基因突变,且可能为该病风险因素之一。

MTHFD1基因G1958A多态性与神经管缺陷易感性的Meta分析

目的系统评价双亲及子代亚甲基四氢叶酸脱氢酶(MTHFD1)基因G1958A多态性与神经管缺陷(NTDs)发病风险的相关性。方法计算机检索The Cochrane Library、Pub Med、Web of Science、CNKI、VIP和Wan Fang Data数据库,搜集MTHFD1基因G1958A多态性与NTDs发病风险的相关性的病例-对照研究,检索时间均为建库至2016年6月。由2位研究者独立筛选文献、提取资料并评价纳入研究的偏倚风险后,采用Stata12.0软件进行Meta分析。结果共纳入13个病例-对照研究,包括1 724例NTDs患儿、1 485例NTDs患儿母亲和774例患儿父亲。Meta分析结果显示,患儿MTHFD1基因G1958A多态性与NTDs发病风险增加有相关性[AA vs.GG:OR=1.437,95%CI(1.100,1.878),P=0.008;AA+AG vs.GG:OR=1.187,95%CI(1.031,1.367),P=0.017;A vs.G:OR=1.210,95%CI(1.050,1.394),P=0.008]。而母亲和父亲MTHFD1基因G1958A多态性与子代NTDs易感性无相关性。结论患儿MTHFD1基因G1958A多态性是NTDs的发病风险因素之一。受纳入研究数量和质量限制,上述结论尚需展开更多的高质量研究予以验证。

神经管缺陷3家系DNA甲基化研究

目的 探讨神经管缺陷（NTDs）家系中全基因组DNA甲基化改变情况及其意义。方法 收集3个NTDs家系，共12例研究对象纳入本研究，以NTDs患者作为病例组，家系中表型正常的成员为对照组。抽取12例研究对象的外周血，提取基因组DNA。使用重亚硫酸盐处理基因组DNA，全基因组扩增方式扩增片段化，置Illumina Infinium人类甲基化450k芯片上，进行杂交、洗脱、延伸、成像，使用iScan软件扫描芯片，Genome Studio读取扫描图像结果。使用Illumina甲基化分析器软件进行数据分析。结果 基因差异甲基化分析显示：差异性甲基化基因位点仅占检出CpG位点的0.2%，617个差异性DNA高甲基化的位点（P〈0.05），其中63个DNA甲基化位点P〈1×10－4，包括E盒结合锌指蛋白2基因、5，10－亚甲基四氢叶酸脱氢酶1基因等；104个差异性DNA低甲基化的位点（P〈0.05），其中65个DNA甲基化位点P〈0.01，包括同源异型盒B7基因、runt相关的转录因子3基因等。聚类分析显示：NTDs患儿呈DNA高甲基化改变的趋势较一致，而对照组呈DNA低甲基化改变的趋势较一致。结论 在NTDs家系中，DNA甲基化异常可能是NTDs发生的危险因素之一。