静原鸡DERA基因生物信息学分析及组织表达研究

【目的】分析2-脱氧-D-核糖-5-磷酸醛缩酶(2-deoxyriboaldolase,DERA)CDS区序列特征及其在静原鸡不同组织和不同生长发育时期的表达水平,为进一步研究DERA基因在静原鸡肌肉中的调控机制提供参考。【方法】以42日龄静原鸡胸肌cDNA为模板,克隆DERA基因完整CDS区,测序并进行生物信息学分析。利用实时荧光定量PCR技术检测DERA基因在静原鸡不同生长发育阶段(7、42、126、180日龄)胸肌、腿肌和42日龄不同组织(心脏、脾脏、肝脏、肾脏、肺脏、胸肌和腿肌)中的表达水平。【结果】静原鸡DERA基因CDS区全长699 bp,编码232个氨基酸,与环颈雉的相似性最高,为99.1%,表明DERA蛋白氨基酸序列在进化过程中保守性较高。DERA属于稳定蛋白,平均亲水系数为0.175,属于疏水性蛋白;存在跨膜结构,没有信号肽,属于跨膜蛋白。蛋白结构域是一种deoC/LacD家族醛缩酶域,二级结构包含α-螺旋、延伸链和无规则卷曲。蛋白互作网络分析表明,DERA蛋白与PGM2、TPI1、TKT等蛋白存在互作关系。DERA基因在静原鸡肾脏、胸肌、腿肌、心脏、肝脏、肺脏、脾脏中均有表达,其中在肾脏和胸肌中的表达量较高,均显著高于其他组织(P<0.05);在肺脏和脾脏中的表达量较低,均显著低于其他组织(P<0.05);DERA基因在7日龄胸肌和腿肌组织中的表达量均显著高于42、126和180日龄(P<0.05)。【结论】试验成功获得静原鸡DERA基因完整CDS区序列,该基因在静原鸡不同生长发育阶段胸肌和腿肌中的表达量以7日龄最高,且在42日龄静原鸡不同组织中以肾脏和胸肌中的表达量较高。结果为进一步研究DERA基因在静原鸡肌肉发育中的作用机制提供参考。

闲不住的小管家

选材亮点:亲子关系并不只是4个字那么简单,"关系",其实有很多类型,比如"完全控制型""大小平等型""亲密朋友型"……每一个家庭的亲子关系类型,都是一个独特的选材切入点。大家好,我是我们家的小管家。你们知道,作为小管家都有哪些工作需要做吗?下面,就让我"隆重地"给你们介绍一下我的工作。首先,我要介绍的工作是"检查二郎腿",这可是我最擅长的工作(之前我还写过关于"二郎腿监督员"的作文呢)。

鹦鹉兄妹

我家最近来了一对龙凤胎小鹦鹉,我每天都会跟它们玩.米拉变形记漂亮的米拉公主这一周遭遇了一场非常疼痛伤心的变形记.因为它笼子上的栅栏被我弄掉了一根,调皮的米拉就从缝隙里钻了出来,想看看外面的世界一不过呢,她也为自己的莽撞行为付出了惨痛代价.

我给爸妈发红包

“新年好呀，新年好呀，祝贺大家新年好……”盼望着，盼望着，新年的脚步近了。

静原鸡miR-2954的靶基因预测及生物信息学分析

为了预测静原鸡miR-2954的靶基因,并分析miR-2954在静原鸡不同组织的表达差异,探索其在静原鸡肌肉组织生长发育中的调控机制,试验采用生物信息学方法对比miR-2954成熟序列,并分析其保守性,使用TargetScan、miRDB、miRmap在线工具预测其靶基因,对靶基因集合进行GO功能注释和KEGG信号通路富集分析,并采用实时荧光定量PCR方法对miR-2954的组织表达水平进行研究。结果表明:miR-2954序列在鸟类间高度保守,靶基因GO功能条目主要集中在RNA聚合酶Ⅱ对转录的正向调节、信号转导、RNA聚合酶Ⅱ对转录的负向调节、氧化-还原过程、免疫反应和G-蛋白偶联受体信号转导途径等,存在于细胞核、胞浆、外泌体等多个组分中,在ATP结合、锌离子结合、金属离子结合、蛋白质结合等分子功能中也发挥作用。靶基因主要富集于细胞因子-细胞因子受体的相互作用、肌动蛋白细胞骨架的调节、细胞黏附分子、AGE-RAGE信号通路在糖尿病并发症中的作用、胰岛素信号传递途径与脂肪细胞因子信号传递途径等信号通路。miR-2954在静原鸡公鸡肺脏、肝脏中的相对表达量极显著高于其他组织(P<0.01),在静原鸡母鸡肺脏、肾脏、胸肌、腿肌中的相对表达量极显著高于其他器官(P<0.01)。说明miR-2954可通过调节其靶向基因影响静原鸡的生长发育。

功能性非编码RNAs在鸡肉肌内脂肪沉积中的调节作用

非编码RNAs(non-conding RNAs,ncRNAs)是一类没有编码蛋白质功能的RNAs,在基因转录、翻译过程中起重要调控作用。肌内脂肪(intramuscular fat,IMF)对鸡肉的风味、嫩度和多汁性具有重要影响,其含量与肌肉品质呈正相关,直接影响家禽肉品质。近年来,利用微小RNAs(microRNAs,miRNAs)、长链非编码RNAs(long non-coding RNAs,lncRNAs)和环状RNAs(circular RNAs,circRNAs)研究鸡IMF沉积的调控机制取得了一定进展,为表观遗传标记应用于动物遗传育种奠定了基础。笔者介绍了IMF形成与沉积的生物学过程、ncRNAs的生物学特点及作用模式,着重阐述了miRNAs、lncRNAs和circRNAs调控鸡肉IMF沉积的研究进展,为进一步研究miRNAs、lncRNAs和circRNAs在家禽肉品质调控方面的作用提供理论依据。

神奇的笔袋之旅

早上,我醒来了,迷迷糊糊地揉着眼睛,发现屋子里还是漆黑一片。真是奇怪了,这时候天应该亮了啊,今天这是怎么了?我眨了眨眼睛,顺便用手拽了拽眼皮,以便让自己的眼睛睁得再大点,好看清楚自己到底在哪里。发现这根本不是自己的卧室,我自言自语道:'这是哪里啊?'没想到黑屋子竟然说话了,'你再仔细看看,这到底是哪里。'

精彩片段

安拉看见米拉光秃凸的尾巴，就上前安慰她，跟她脸贴着脸，头抵着头，偶尔还伸开翅膀握握手，表示对米拉推动尾巴的同情。

扫兴的妈妈

今天我去领奖了,回家的路上我一直都在想怎么给妈妈惊喜。我首先是想把证书和奖牌放在口袋里,可我担心会把证书弄折了,于是就把证书和奖牌揣在了怀里。把证书和奖牌藏好后,我想妈妈见到我就会问:“浩睿,你领的奖呢?”