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波纹龙虾对亚硝酸盐胁迫响应的转录组学分析
被引量:
1
1
作者
梁妃爽
梁华芳
+3 位作者
卓宏标
孙榕泽
王潘妹
温崇庆
《大连海洋大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第5期809-816,共8页
为了探究波纹龙虾Panulirus homarus对亚硝酸盐的胁迫响应机理,采用转录组学测序分析方法,进行了正常养殖条件下波纹龙虾(体质量为39.00 g±5.31 g)肝胰腺和质量浓度为80 mg/L亚硝酸盐胁迫7 d的肝胰腺转录组比较研究。结果表明:转...
为了探究波纹龙虾Panulirus homarus对亚硝酸盐的胁迫响应机理,采用转录组学测序分析方法,进行了正常养殖条件下波纹龙虾(体质量为39.00 g±5.31 g)肝胰腺和质量浓度为80 mg/L亚硝酸盐胁迫7 d的肝胰腺转录组比较研究。结果表明:转录组共筛选得到264个差异表达基因,其中,86个基因上调表达,178个基因下调表达;GO功能注释显示,被注释的差异表达基因主要与结合、催化和代谢等功能有关;KEGG通路富集分析显示,差异表达基因在黏着斑、白细胞跨内皮层迁移、胰岛素抵抗、紧密连接、淀粉与蔗糖代谢等通路中显著富集;随机挑选9个差异表达基因进行qRT-PCR验证,发现荧光定量结果与测序结果基本一致。研究表明,在亚硝酸盐胁迫下,通过GO和KEGG分析发现差异表达基因主要富集在能量代谢、生长和免疫等通路中,挖掘出的数据可为后续研究提供科学参考。
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关键词
波纹龙虾
亚硝酸盐胁迫
转录组
差异表达基因
下载PDF
职称材料
RNA干扰PhCatC 1/2基因对波纹龙虾相关免疫基因表达的影响
2
作者
梁妃爽
梁华芳
+2 位作者
黄佳宇
王潘妹
温崇庆
《浙江农业学报》
CSCD
北大核心
2023年第5期1037-1047,共11页
初步研究RNA干扰PhCatC 1/2基因对波纹龙虾(Panulirus homarus)相关免疫基因表达的影响,采用qPCR技术检测PhCatC 1/2、PhTlr 13、PhLys和Phβ-G基因的表达,并观察肝胰腺组织的变化情况。结果表明:注射PhCatC 1-dsRNA后,PhCatC2表达量比...
初步研究RNA干扰PhCatC 1/2基因对波纹龙虾(Panulirus homarus)相关免疫基因表达的影响,采用qPCR技术检测PhCatC 1/2、PhTlr 13、PhLys和Phβ-G基因的表达,并观察肝胰腺组织的变化情况。结果表明:注射PhCatC 1-dsRNA后,PhCatC2表达量比对照组显著下降(P<0.05),与对照组相比PhTlr 13基因表达量在前期呈现显著升高,后下降的趋势,PhLys和Phβ-G基因的表达量均随dsRNA干扰时效的增加而增加;沉默PhCatC 2基因后PhTlr 13和Phβ-G基因的表达量随dsRNA干扰时效的增加而增加,PhCatC 1基因表达量呈现下上调交替的趋势,PhLys基因表达量表现出先下调后上调的趋势。通过PhCatC 1/2基因沉默后的分析初步推测,波纹龙虾可能通过促进Toll样受体和溶酶体通路来参与免疫应答,得出PhCatC 1/2基因具有免疫功能。
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关键词
波纹龙虾
RNA干扰
PhCatC
1/2
PhTlr
13
PhLys
Phβ-G
表达分析
下载PDF
职称材料
题名
波纹龙虾对亚硝酸盐胁迫响应的转录组学分析
被引量:
1
1
作者
梁妃爽
梁华芳
卓宏标
孙榕泽
王潘妹
温崇庆
机构
广东海洋大学水产学院
出处
《大连海洋大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第5期809-816,共8页
基金
广东省科技厅农业攻关项目(2013B020308009)
广东海洋大学科研项目(C16394)。
文摘
为了探究波纹龙虾Panulirus homarus对亚硝酸盐的胁迫响应机理,采用转录组学测序分析方法,进行了正常养殖条件下波纹龙虾(体质量为39.00 g±5.31 g)肝胰腺和质量浓度为80 mg/L亚硝酸盐胁迫7 d的肝胰腺转录组比较研究。结果表明:转录组共筛选得到264个差异表达基因,其中,86个基因上调表达,178个基因下调表达;GO功能注释显示,被注释的差异表达基因主要与结合、催化和代谢等功能有关;KEGG通路富集分析显示,差异表达基因在黏着斑、白细胞跨内皮层迁移、胰岛素抵抗、紧密连接、淀粉与蔗糖代谢等通路中显著富集;随机挑选9个差异表达基因进行qRT-PCR验证,发现荧光定量结果与测序结果基本一致。研究表明,在亚硝酸盐胁迫下,通过GO和KEGG分析发现差异表达基因主要富集在能量代谢、生长和免疫等通路中,挖掘出的数据可为后续研究提供科学参考。
关键词
波纹龙虾
亚硝酸盐胁迫
转录组
差异表达基因
Keywords
Panulirus homarus
nitrite stress
tanscriptome
differential gene expression
分类号
S968.22 [农业科学—水产养殖]
下载PDF
职称材料
题名
RNA干扰PhCatC 1/2基因对波纹龙虾相关免疫基因表达的影响
2
作者
梁妃爽
梁华芳
黄佳宇
王潘妹
温崇庆
机构
广东海洋大学水产学院
出处
《浙江农业学报》
CSCD
北大核心
2023年第5期1037-1047,共11页
基金
广东省科技厅农业攻关项目(2013B020308009)
广东海洋大学科研项目(C16394)。
文摘
初步研究RNA干扰PhCatC 1/2基因对波纹龙虾(Panulirus homarus)相关免疫基因表达的影响,采用qPCR技术检测PhCatC 1/2、PhTlr 13、PhLys和Phβ-G基因的表达,并观察肝胰腺组织的变化情况。结果表明:注射PhCatC 1-dsRNA后,PhCatC2表达量比对照组显著下降(P<0.05),与对照组相比PhTlr 13基因表达量在前期呈现显著升高,后下降的趋势,PhLys和Phβ-G基因的表达量均随dsRNA干扰时效的增加而增加;沉默PhCatC 2基因后PhTlr 13和Phβ-G基因的表达量随dsRNA干扰时效的增加而增加,PhCatC 1基因表达量呈现下上调交替的趋势,PhLys基因表达量表现出先下调后上调的趋势。通过PhCatC 1/2基因沉默后的分析初步推测,波纹龙虾可能通过促进Toll样受体和溶酶体通路来参与免疫应答,得出PhCatC 1/2基因具有免疫功能。
关键词
波纹龙虾
RNA干扰
PhCatC
1/2
PhTlr
13
PhLys
Phβ-G
表达分析
Keywords
Panulirus homarus
RNA interference
PhCatC1/2
PhTlr13
PhLys
Phβ-G
expression analysis
分类号
S917 [农业科学—水产科学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
波纹龙虾对亚硝酸盐胁迫响应的转录组学分析
梁妃爽
梁华芳
卓宏标
孙榕泽
王潘妹
温崇庆
《大连海洋大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022
1
下载PDF
职称材料
2
RNA干扰PhCatC 1/2基因对波纹龙虾相关免疫基因表达的影响
梁妃爽
梁华芳
黄佳宇
王潘妹
温崇庆
《浙江农业学报》
CSCD
北大核心
2023
0
下载PDF
职称材料
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
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