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改良FIASCO方法筛选砷超富集植物蜈蚣草SSR分子标记(英文)
被引量:
1
1
作者
李磊
敖日格乐
+1 位作者
王玢琪
葛台明
《植物科学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第4期413-420,共8页
蜈蚣草(Pteris vittata L.)是目前用于砷污染土壤修复最好的超富集植物,但其分子水平上的研究数据较少。为了开发蜈蚣草特异性SSR遗传标记,本文采用改良的FIASCO方法从蜈蚣草AG和AC微卫星富集文库中随机挑选100个克隆,分离得到51个微...
蜈蚣草(Pteris vittata L.)是目前用于砷污染土壤修复最好的超富集植物,但其分子水平上的研究数据较少。为了开发蜈蚣草特异性SSR遗传标记,本文采用改良的FIASCO方法从蜈蚣草AG和AC微卫星富集文库中随机挑选100个克隆,分离得到51个微卫星位点,其中60%为完美型(Perfect)SSR。根据这些位点设计、合成了25对引物,并对江西庐山及湖北恩施两地蜈蚣草种群各20个个体进行了遗传多样性检测,结果发现:其中8个完美型及1个间断型(intermittent)SSR位点的引物能够扩增出清晰、稳定且具有多态性的条带。9对引物共扩增出41个等位基因,各位点等位基因数在2~7之间,平均等位基因数为4.56个;期望杂合度在0.0494~0.8169之间;没有连锁不平衡现象发生。采用大叶井栏边草(Pteris multifida Poir.)进行跨种扩增,结果发现其中6对引物能够进行种间扩增。这些SSR分子标记的开发有助于蜈蚣草生态适应性进化分析、揭示蜈蚣草地理分布格局以及探讨蜈蚣草遗传多样性,还可用于品种鉴定及选育等。
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关键词
蜈蚣草
微卫星
多态性
FIASCO
CviQI接头
pig-tail
CviQI-N引物
下载PDF
职称材料
薇菜SSR分子标记的开发及遗传多样性初步探讨
2
作者
赵杰
王玢琪
+3 位作者
贾晓
童益琴
何义发
葛台明
《植物科学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第6期801-807,共7页
利用改良FIASCO法(Fast Isolation by AFLP Sequences COntaining repeats)开发出的9对多态性SSR引物评价了薇菜(Osmunda japonica Thunb.)2个野生居群(庐山和恩施)、1个栽培居群(恩施)的遗传多样性和遗传分化水平。结果显示,9...
利用改良FIASCO法(Fast Isolation by AFLP Sequences COntaining repeats)开发出的9对多态性SSR引物评价了薇菜(Osmunda japonica Thunb.)2个野生居群(庐山和恩施)、1个栽培居群(恩施)的遗传多样性和遗传分化水平。结果显示,9个SSR标记在3个薇菜居群中共检测到47个等位基因,每个SSR位点的平均等位基因数为5.222个,观测杂合度和期望杂合度分别为0.000~0.944和0.577~0.834,香农指数为0.962~1.860,表明各SSR位点多态性较高;各居群的平均期望杂合度均大于平均观测杂合度且种内近交系数均为正值,说明3个薇菜居群中都存在非随机交配现象;对各居群的相关遗传多样性参数分析表明,恩施野生居群遗传多样性最高,而其栽培居群最低;庐山野生居群与恩施野生居群间遗传分化系数为0.092,说明两地野生薇菜居群的遗传分化程度较低,AMOVA分析也表明遗传变异主要存在于野生居群内部。
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关键词
薇菜
遗传多样性
SSR
FIASCO
下载PDF
职称材料
蜈蚣草孢子萌发的最适培养基研究
3
作者
李江浩
王玢琪
《现代园艺》
2012年第16期11-11,共1页
通过在不同培养基上进行培养,观察统计了蜈蚣草孢子的萌发情况,包括萌发率、萌发时间,寻找出了蜈蚣草孢子组织培养的最佳孢子萌发培养基。
关键词
蜈蚣草
培养基
孢子萌发
下载PDF
职称材料
题名
改良FIASCO方法筛选砷超富集植物蜈蚣草SSR分子标记(英文)
被引量:
1
1
作者
李磊
敖日格乐
王玢琪
葛台明
机构
中国地质大学湿地演化与生态恢复湖北省重点实验室
中国地质大学(武汉)环境学院
出处
《植物科学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第4期413-420,共8页
基金
国家自然科学基金重点项目(40930210)
文摘
蜈蚣草(Pteris vittata L.)是目前用于砷污染土壤修复最好的超富集植物,但其分子水平上的研究数据较少。为了开发蜈蚣草特异性SSR遗传标记,本文采用改良的FIASCO方法从蜈蚣草AG和AC微卫星富集文库中随机挑选100个克隆,分离得到51个微卫星位点,其中60%为完美型(Perfect)SSR。根据这些位点设计、合成了25对引物,并对江西庐山及湖北恩施两地蜈蚣草种群各20个个体进行了遗传多样性检测,结果发现:其中8个完美型及1个间断型(intermittent)SSR位点的引物能够扩增出清晰、稳定且具有多态性的条带。9对引物共扩增出41个等位基因,各位点等位基因数在2~7之间,平均等位基因数为4.56个;期望杂合度在0.0494~0.8169之间;没有连锁不平衡现象发生。采用大叶井栏边草(Pteris multifida Poir.)进行跨种扩增,结果发现其中6对引物能够进行种间扩增。这些SSR分子标记的开发有助于蜈蚣草生态适应性进化分析、揭示蜈蚣草地理分布格局以及探讨蜈蚣草遗传多样性,还可用于品种鉴定及选育等。
关键词
蜈蚣草
微卫星
多态性
FIASCO
CviQI接头
pig-tail
CviQI-N引物
Keywords
Chinese brake fern ( Pteris vittata L.)
Microsatellite
Polymorphism
FIASCO
CviQI-adaptor
Pig-tail CviQI-N primer
分类号
Q75 [生物学—分子生物学]
下载PDF
职称材料
题名
薇菜SSR分子标记的开发及遗传多样性初步探讨
2
作者
赵杰
王玢琪
贾晓
童益琴
何义发
葛台明
机构
中国地质大学(武汉)湿地演化与生态恢复湖北省重点实验室
湖北民族学院林学园艺学院
出处
《植物科学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第6期801-807,共7页
基金
国家自然科学基金重点项目(40930210)
文摘
利用改良FIASCO法(Fast Isolation by AFLP Sequences COntaining repeats)开发出的9对多态性SSR引物评价了薇菜(Osmunda japonica Thunb.)2个野生居群(庐山和恩施)、1个栽培居群(恩施)的遗传多样性和遗传分化水平。结果显示,9个SSR标记在3个薇菜居群中共检测到47个等位基因,每个SSR位点的平均等位基因数为5.222个,观测杂合度和期望杂合度分别为0.000~0.944和0.577~0.834,香农指数为0.962~1.860,表明各SSR位点多态性较高;各居群的平均期望杂合度均大于平均观测杂合度且种内近交系数均为正值,说明3个薇菜居群中都存在非随机交配现象;对各居群的相关遗传多样性参数分析表明,恩施野生居群遗传多样性最高,而其栽培居群最低;庐山野生居群与恩施野生居群间遗传分化系数为0.092,说明两地野生薇菜居群的遗传分化程度较低,AMOVA分析也表明遗传变异主要存在于野生居群内部。
关键词
薇菜
遗传多样性
SSR
FIASCO
Keywords
Osmunda japonica Thunb.
Genetic diversity
Simple sequence repeat
Fast Isolation by AFLP Sequences COntaining repeats
分类号
Q75 [生物学—分子生物学]
下载PDF
职称材料
题名
蜈蚣草孢子萌发的最适培养基研究
3
作者
李江浩
王玢琪
机构
中国地质大学环境学院
出处
《现代园艺》
2012年第16期11-11,共1页
文摘
通过在不同培养基上进行培养,观察统计了蜈蚣草孢子的萌发情况,包括萌发率、萌发时间,寻找出了蜈蚣草孢子组织培养的最佳孢子萌发培养基。
关键词
蜈蚣草
培养基
孢子萌发
分类号
S682.35 [农业科学—观赏园艺]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
改良FIASCO方法筛选砷超富集植物蜈蚣草SSR分子标记(英文)
李磊
敖日格乐
王玢琪
葛台明
《植物科学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014
1
下载PDF
职称材料
2
薇菜SSR分子标记的开发及遗传多样性初步探讨
赵杰
王玢琪
贾晓
童益琴
何义发
葛台明
《植物科学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015
0
下载PDF
职称材料
3
蜈蚣草孢子萌发的最适培养基研究
李江浩
王玢琪
《现代园艺》
2012
0
下载PDF
职称材料
已选择
0
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