基于高通量测序的椭圆食粉螨体内微生物群落结构及多样性分析

目的:阐明椭圆食粉螨体内微生物群落结构及多样性。方法:实验室饲养椭圆食粉螨,利用Illumina MiSeq技术对其体内细菌16S rRNA基因的V4区和真菌ITS1序列进行测序,统计体内微生物的操作分类单元(OTUs)数量,分析其体内微生物群落结构及Alpha多样性。结果:获得椭圆食粉螨体内细菌16s rRNA和真菌ITS1有效序列209643和145646条,根据序列相似性>97%进行聚类分析,分别得到了248和146个OTUs。基于OTUs进行物种注释,共注释到细菌类群20门,32纲,110目,177科,128属;共注释到真菌类群3门,15纲,36目,65科,92属。其中,在门分类水平,本实验室饲养椭圆食粉螨体内细菌群落主要注释到厚壁菌门Firmicutes(43.52%)、拟杆菌门Bacteroidota(31.94%)、放线菌门Actinobacteriota(20.04%)、变形菌门Proteobacteria(4.40%);真菌类群以子囊菌门Ascomycota(98.60%)为绝对优势菌门。在属分类水平,细菌类群主要注释到葡萄球菌属Staphylococcus(43.27%)、土壤杆形菌属Solitalea(31.81%)、棒杆菌属Corynebacterium(7.61%)、考克氏菌属Kocuria(7.06%)、短杆菌属Brevibacterium(4.11%)、鞘氨醇单胞菌属Sphingomonas(2.45%);真菌优势属为Trichomonascus(71.52%)、曲霉属Aspergillus(10.38%)、链格孢属Alternaria(9.29%)。Alpha多样性指数表明椭圆食粉螨体内微生物群落结构具有较高的丰富度和多样性。结论:椭圆食粉螨体内细菌和真菌群落具有较高的多样性和丰富度,且个体间微生物多样性存在差异。

吃货陈

我们班的“食王唐”连霸四年“吃货大王”的称号,因为过于肥胖,在他双亲的强力干预下,他的食量大降。大家正愁着班级里的菜锅、饭盆再不能“光锅”“光盆”了,没想到,一位新的吃货横空出世。

深度学习在汉语语义分析的应用与发展趋势

人工智能分为感知和认知两个研究阶段。近年来,随着大数据技术和以深度学习为代表的机器学习技术的迅猛发展,人工智能在感知阶段进展飞速。然而,在认知阶段,尤其是在自然语言理解方面的发展仍较为有限。与人类丰富的语言经验、语言知识储备相比,仅仅依靠基于数据驱动的深度学习很难产生真正的智能。为了打破深度学习的性能瓶颈,必须将语义分析的理论和技术与深度学习模型相结合。因此,汉语语义分析理论和技术具有重要研究价值。汉语语义分析可以从海量的中文文本信息中挖掘语义信息,并提供智能的知识服务。文中主要描述了目前主流的汉语语义体系及其语义知识库的构建情况,介绍了汉语语义自动分析方法的研究进展和将汉语语义信息融入深度学习模型中的应用,最后对汉语语义分析的发展与态势进行了展望。

融合序列语法知识的卷积-自注意力生成式摘要方法

针对基于编码-解码的生成式摘要模型不能充分提取语法知识导致摘要出现不符合语法规则的问题,循环神经网络易遗忘历史信息且训练时无法并行计算导致处理长文本时生成的摘要主旨不显著以及编码速度慢的问题,提出了一种融合序列语法知识的卷积-自注意力生成式摘要方法.该方法对文本构建短语结构树,将语法知识序列化并嵌入到编码器中,使编码时能充分利用语法信息;使用卷积-自注意力模型替换循环神经网络进行编码,更好学习文本的全局和局部信息.在CNN/Daily Mail语料上进行实验,结果表明提出的方法优于当前先进方法,生成的摘要更符合语法规则、主旨更显著且模型的编码速度更快.

变应原体外检测技术研究进展

变应原的准确检测对过敏性疾病的预防和诊疗至关重要。体外检测是当前变应原检测的主要研究方向。本文主要对检测血清sIgE的放射变应原吸附试验、酶联免疫吸附试验、荧光酶免疫分析、纳米磁微粒化学发光法、免疫印迹法、液相芯片法,以及直接检测变应原的生物共振法进行了概述,并对各种体外检测技术的优缺点进行了比较,以期为临床上选择合适的变应原体外检测方法提供参考。

文学爱好者同盟——毕业的夏天

毕业时校园里没有香樟树，也没有散发着幽香的林阴道。在我熟悉的季节里，那个记忆中永远的夏天，似乎在梦里的一切却吹来带着无尽绚丽的夏日风。

基于高通量测序的粉尘螨体内细菌多样性研究

目的探讨粉尘螨(Dermatophagoides farinae)体内细菌多样性。方法取实验室人工饲养的粉尘螨,采用Illumina PE250高通量测序平台扩增测序细菌16S核糖体RNA(16S ribosomal RNA,16S rRNA)基因V4区,获得的原始序列经质控过滤后得到有效序列。采用Usearch软件、Silva数据库、Mothur软件对有效序列进行操作分类单元(operational taxonomic units,OTU)聚类并分析细菌群落组成与alpha多样性指数。结果共获得187616条有效序列,根据序列相似性>97%进行聚类,得到469个OTUs。OTU注释结果表明,粉尘螨体内细菌分属于26个门、43个纲、100个目、167个科、284个属。在门分类阶元水平,粉尘螨体内细菌主要注释到变形菌门、厚壁菌门、拟杆菌门、放线菌门和酸杆菌门,其中变形菌门为优势菌门;在属分类阶元水平,罗尔斯通氏菌属、立克次体目未确定属、葡萄球菌属和鞘氨醇单胞菌属为优势菌属。在非优势菌属中,发现沃尔巴克氏体。结论粉尘螨体内细菌群落组成具有较高多样性,个体间细菌群落多样性与丰度存在差异。