中国家驴MSTN基因第1内含子多态性分析

为探究中国家驴的遗传多样性,本研究采用PCR-SSCP方法对中国14个品种家驴542个个体MSTN基因第1内含子的遗传多样性进行分析。结果显示:中国家驴MSTN基因第1内含子存在g.1323T→C突变位点,由此产生TT、TC和CC 3种基因型。等位基因T频率高于C,德州驴CC基因型频率最高,太行驴TC基因型频率最高,渤海驴TT基因型频率最高,不同品种和类型之间基因和基因型频率分布没有明显规律。所有品种的遗传多样性均为中度多态(0.250.05)。

阳原驴MSTN基因生物信息学分析及组织表达研究

【目的】试验旨在分析阳原驴肌生长抑制素(myostatin,MSTN)基因CDS序列特征及其在不同生长发育时期和不同组织中的表达水平。【方法】采集6、12、18、24月龄阳原驴的血样及不同组织样,提取其基因组DNA及不同组织样总RNA。利用PCR技术扩增阳原驴MSTN基因CDS序列,并对其进行生物信息学分析。利用实时荧光定量PCR技术检测MSTN基因在阳原驴不同生长发育时期背最长肌、腿肌和18月龄不同组织(心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏)中的表达水平。【结果】阳原驴MSTN基因CDS序列长1128 bp,编码375个氨基酸,与马的核苷酸序列相似性最高(99.9%),编码蛋白属于不稳定的亲水性蛋白,含有转化生长因子-β(TGF-β)超家族结构域,不含跨膜区,存在1个信号肽区域,包含6个O-糖基化位点、1个N-糖基化位点和34个磷酸化位点,主要分布于细胞核中(39.1%),二级结构中无规则卷曲占比最高(50.93%)。MSTN基因在18月龄阳原驴背最长肌和腿肌中的表达水平显著高于6、12、24月龄(P<0.05);MSTN基因在18月龄阳原驴不同组织中均有表达,其中背最长肌中的表达水平显著高于其他组织(P<0.05),其次是腿肌、肺脏、脾脏、肾脏和肝脏,心脏中的表达水平最低。【结论】试验成功扩增出阳原驴MSTN基因CDS序列,MSTN基因在阳原驴不同生长发育时期背最长肌和腿肌中的表达水平均以18月龄最高,且在18月龄不同组织中以背最长肌和腿肌中表达水平较高。研究结果为进一步探讨MSTN基因在阳原驴骨骼肌生长发育中的作用机制提供参考。

中国家驴TYRP1基因第二内含子多态性分析

为了探究TYRP1基因对中国家驴毛色的影响,试验采集410只不同毛色中国家驴的血液样本,采用聚合酶链式反应及单链构象多态性(polymerase chain reaction and single-strand conformation polymorphism, PCR-SSCP)方法检测中国家驴TYRP1基因第二内含子中的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)位点,对不同毛色中国家驴个体进行基因分型,并计算基因型频率和等位基因频率,分析TYRP1基因第二内含子多态性与中国家驴不同毛色之间的关系。结果表明:在中国家驴TYRP1基因第二内含子中检测到1个SNP位点(g.1 702A→G),该位点存在AA、AG、GG三种基因型;乌头、黑三粉、青三粉、灰三粉、白色和白化家驴的优势等位基因均为A。乌头、黑三粉和青三粉均为AA基因型频率最高,GG基因型频率最低;灰三粉为AA基因型频率最高,AG基因型频率最低(0)。在乌头、黑三粉、青三粉、灰三粉家驴中,AA基因型频率为灰三粉最高,然后依次为青三粉、黑三粉和乌头;以黑毛色为主色调的家驴(乌头、黑三粉、青三粉)GG基因型频率低于以灰毛色为主色调的家驴(灰三粉),有白毛混杂的黑三粉和青三粉的GG基因型频率低于纯黑的乌头。样本中的白色家驴和白化家驴各有2头,其基因型均为AA纯合子。说明随着中国家驴黑色被毛比例的增加,TYRP1基因g.1 702A→G位点的AA基因型频率逐渐降低,推测该位点可能与中国家驴毛色性状有关。

中国家驴TYR基因第一外显子多态性分析

为了探究TYR基因对中国家驴毛色的影响,试验利用PCR-SSCP方法对14个品种408个毛色表型记录清晰的中国家驴TYR基因第一外显子的多态性与毛色的关系进行了研究,并根据其毛色进行分类,计算不同毛色的基因型频率和基因频率。结果表明:中国家驴TYR基因在第一外显子存在g.259A→G突变位点,由此产生了三种基因型AA、AG和GG,该位点为异亮氨酸到缬氨酸的非同义突变。AA基因型频率在乌头驴、黑三粉驴、青三粉驴和灰三粉驴中的分布逐渐降低,GG基因型频率分布逐渐提高,2头白驴均为GG基因型;等位基因A和G的频率在灰三粉驴中相等,在其他毛色中,等位基因A的频率大于G。说明随着中国家驴被毛中黑色被毛分布的减少,AA基因型频率逐渐下降,GG基因型频率逐渐提高,该位点与中国家驴黑白被毛的形成有关。

阳原驴MSTN基因5'UTR多态性分析

为探究MSTN基因5'UTR多态性及其对阳原驴体尺指标(体高、体长、胸围)的影响,试验测量了舍饲的70头2岁以上阳原驴的体尺指标,用PCR-SSCP技术进行MSTN基因5'UTR多态位点检测,并对不同基因型个体的体尺性状进行差异分析。结果表明:阳原驴MSTN基因5'UTR存在g.229T>C突变,产生TT、CC和TC三种基因型,不同基因型个体之间的体高、体长差异不显著(P>0.05),而CC基因型个体胸围显著大于其他两个基因型(P<0.05)。说明第229位点可以作为阳原驴选择育种的候选标记。