影响肝癌预后独立危险因子的信息学分析

目的:通过生物信息学调研和分析,探讨对肝癌预后产生影响的独立危险因子及其与肝癌靶向药索拉非尼作用靶点的相互关联特征。方法:从TCGA数据库收集的248例肝癌患者中选取79例死亡患者的基因表达量、生存时间、生存状态数据,以中位生存时间360 d为界将这些死亡患者分为2组,用DEseq算法对这2组患者的基因表达量数据进行差异基因筛选。不考虑其他混杂因素,仅考虑差异基因表达单个因素与患者生存时间相关,用Kaplan-Meier法对差异基因进行单因素分析。将分析得到的差异基因表达量和患者生存时间、生存状态整合的矩阵用COX回归模型作生存分析,寻找对肝癌预后产生影响的独立危险因子。以STRING数据库为基础,将得到的差异基因与肝癌靶向药索拉非尼的作用靶点结合构建蛋白互联网络,探寻索拉菲尼作用靶点与差异基因的关系。结果:DEseq算法初筛得到52个有可能对肝癌预后产生影响的差异基因。Kaplan-Meier法分析得到26个与患者生存时间相关的差异基因。COX分析最终确认3个差异基因(SQSTM1、ANXA10和STMN1)为影响肝癌预后的独立危险因子。其中ANXA10为负向影响因素,而STMN1与SQSTM1为肝癌患者预后的正向影响因素。蛋白质相互作用网络显示,肝癌靶向药索拉非尼的作用靶点与多个差异基因密切相关。ANXA10参与钙离子结合和钙依赖性磷脂结合,STMN1和SQSTM1在多种信号通路中起重要作用。结论:ANXA10、STMN1和SQSTM1可能是对肝癌预后产生影响的独立危险因子,可作为未来开发靶向药物的作用靶点或患者预后预测指标。

锚固力在钢筋黏结和端板承压间的分配规律

为获得锚固力在高强热轧钢筋直锚段黏结和端部锚固板承压间的分配规律,以钢筋与混凝土间的黏结-滑移本构关系为基础,利用MATLAB编写出带锚固板钢筋受力计算程序,并通过120个带锚固板钢筋混凝土试件的拉拔试验结果对程序的准确性进行验证.依托程序,分析相对保护层厚度c/d和钢筋屈服强度与混凝土抗拉强度之比fy/ft,对钢筋稳定锚固长度与钢筋公称直径之比las/d的影响以及钢筋屈服强度、混凝土强度等级、混凝土相对保护层厚度、钢筋相对埋置长度等参数对直锚段钢筋黏结应力fb的影响,并拟合得到以fy/ft和c/d为自变量的las/d计算公式.结果表明:las/d随fy/ft的增大而线性增大,随c/d的增大而非线性减小;fb/fy随钢筋埋置长度与稳定锚固长度之比lat/las的变化规律只与混凝土相对保护层厚度有关.继而通过拟合得到加载端钢筋受拉屈服强度时刻,以c/d和lat/las为自变量的fb/fy计算公式.

盐酸小檗碱透过羧甲基壳聚糖-海藻酸钠聚电解质水凝胶的规律研究

目的探究伤科黄水中黄连和黄柏的主要有效成分盐酸小檗碱(berberine hydrochloride,BBH)在羧甲基壳聚糖(carboxymethyl chitosan,CMCS)-海藻酸钠(sodium alginate,SA)体系中的传递与扩散规律。方法CMCS和SA按照一定比例搅拌,加入D-葡萄糖酸内酯(D-gluconolactone,GDL)后形成聚电解质水凝胶。采用流变仪研究CMCS-SA的水凝胶的流变学性能,包括弹性模量G'和黏性模量G''。设计针对CMCS-SA水凝胶的BBH扩散模型并通过UV观察BBH透过CMCS-SA聚电解质水凝胶的相关规律。结果测定CMCS与SA配比为3∶1,2∶1,1∶1,1∶2,1∶3时的水凝胶弹性模量G',当CMCS∶SA=1∶1时,G'最高,此时水凝胶交联强度最高。通过BBH传递模型测定其累积传递量,经Peppas方程拟合BBH在CMCS-SA水凝胶中的扩散为骨架溶蚀作用,表明随着CMCS的氨基减少或SA的羧基增加,BBH解离,传递效率增加。CMCS-SA水凝胶的弹性模量G'随着GDL含量增加而增加,是因为pH的降低导致CMCS和SA分子间的结合力逐渐增加,水凝胶交联度增强。固定CMCS与SA比例1∶1,GDL含量0.15 g·mL^(−1),CMCS-SA水凝胶成型性良好。此外BBH在不同浓度GDL的水凝胶中传递时,随着GDL含量增加,传递效率上升。BBH在不同厚度水凝胶中传递时,随着厚度减小,CMCS-SA水凝胶的传递效率增加。结论CMCS-SA水凝胶体系作为潜在的BBH等中药提取物的药物载体有望作为经皮给药的凝胶载体。

基于RNA-Seq技术大鼠放射性肺损伤转录组学分析

目的分析放射性肺损伤(RILI)大鼠的差异表达基因,从转录组水平探讨大鼠RILI的机制。方法选取40只SD大鼠并随机分为实验组(30 Gy右肺照射组)与对照组。建立RILI大鼠模型,提取两组大鼠右肺组织RNA,采用Illumina平台进行测序。采用DESeq2软件(1.20.0)分析两组的基因表达变化,并采用实时逆转录聚合酶链反应对其中6个关键差异表达基因进行验证。对差异表达基因进行聚类分析、GO功能富集分析及KEGG通路富集分析。结果转录组学分析实验组与对照组之间有414个差异表达基因[P<0.05,|log2(FC)|>1.0],其中,270个上调基因,144个下调基因。根据基因的差异倍数和所富集到的炎症相关的通路筛选出的关键差异基因包括Fos、Cxcl2、Nr1d1、Angptl4、Ccn4、Tnc,实时逆转录聚合酶链反应验证结果与转录组测序分析趋势一致。GO功能富集分析的结果显示,差异基因主要参与染色体分离、核分裂、细胞器裂变等过程;KEGG通路富集分析的结果显示,差异基因参与昼夜节律、ECM受体相互作用、cAMP信号通路、TNF信号通路等重要生物学过程。结论本研究初步分析获得了大鼠RILI相关差异表达基因及其相关通路,为RILI的临床诊治提供了实验依据。

带锚固板高强热轧钢筋与混凝土黏结锚固性能试验研究

为研究带锚固板高强热轧钢筋（HRB500、HRB600）与混凝土之间的黏结性能,设计了24组共120个试件,对其进行拉拔试验。试件主要变化参数为钢筋公称直径、钢筋屈服强度、钢筋的锚固长度、混凝土强度。通过在纵肋一侧槽底面粘贴应变片（间距为30 mm）的实测值,获得了各级荷载下拉拔力在锚固段钢筋黏结力和端部锚固板承压力间的分配。基于试验结果,分析了钢筋锚固板的锚固长度与钢筋公称直径之比和钢筋屈服强度与混凝土抗拉强度之比对钢筋屈服时拉拔力在钢筋锚固段黏结力和端部锚固板承压力间的分配影响。试验结果表明,锚固板承压力与加载端钢筋屈服力的比值随钢筋锚固板的锚固长度与钢筋公称直径之比的增加、随钢筋强度与混凝土抗拉强度之比的减小而线性减小。基于试验结果,拟合得到了以两个影响因素为自变量的计算公式。

幽门螺旋杆菌感染对胃癌的影响研究

目的 探讨未感染幽门螺旋杆菌（HP）的胃癌样本与感染HP的胃癌样本之间的差异.方法 提取TCGA数据库中胃癌样本基因表达量（MRNA）的数据.根据胃癌样本中有无HP感染将样本分为2组,通过edgeR算法分别对比表达量数据,并得到差异基因.再将得到的两组差异基因分别进行富集分析,最后比较两组富集分析的结果,得出未感染HP的胃癌样本与感染HP的胃癌样本之间富集通路的差异.结果 由KEGG数据库可知,未感染HP的胃癌样本在代谢途径、蛋白质消化和吸收、脂肪消化和吸收、胃酸分泌、胰腺分泌、cAMP信号通路、血管平滑肌收缩方面与癌旁比较,差异有统计学意义（P〈0.00001）.感染HP的胃癌样本在细胞因子-细胞因子受体相互作用方面与癌旁比较,差异有统计学意义（P〈0.00001）.结论 HP感染导致细胞因子-细胞因子受体相互作用异常.可能有2种不同的胃癌亚型,分别对于代谢途径、蛋白质消化和吸收、脂肪消化和吸收、胃酸分泌、胰腺分泌、cAMP信号通路、血管平滑肌收缩方面与细胞因子-细胞因子受体相互作用方面产生影响.