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题名铅锌胁迫下山苍子雌雄花蕾转录组测序分析
被引量:2
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作者
王钦仪
李斯濛
郁培义
姚雨轩
蒋丽娟
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机构
中南林业科技大学生命科学与技术学院
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出处
《分子植物育种》
CAS
北大核心
2023年第4期1128-1137,共10页
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基金
湖南省科技研发重点项目(2016SK20-31)
长沙市科技计划重点项目(kq1801080)
中南林业科技大学科技创新基金项目(CX20192035)共同资助。
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文摘
为研究山苍子雌雄株的花蕾在铅锌胁迫下基因表达模式的差异,本试验以铅锌尾矿区中无污染和铅锌污染样地的山苍子雌雄株的花蕾作为试验材料,对无污染土地(CK)和铅锌污染土地的山苍子雌雄株的花蕾进行转录组测序,共设置4个差异分组,即无污染雌组、无污染雄组、铅锌污染雌组和铅锌污染雄组。测序结果显示,共获得88.41 Gb的Clean data,Q 30碱基大于94.30%,平均GC含量为45.81%,样品间进行差异基因筛选,得到差异基因的数量分别为3204、4698、5038和4124条。经GO数据库对其注释,结果表明4个比较组的差异基因大量参与生物过程部分,而极少量差异基因参与分子功能部分。根据KEGG通路富集分析可得出,山苍子响应铅锌复合胁迫的主要代谢途径有苯丙素生物合成、植物病原菌互作、次生代谢物生物合成以及芪类,二苯基庚酮和姜酚生物合成等,而山苍子雌雄株间差异主要体现在苯丙素生物合成、淀粉和蔗糖代谢、次生代谢物生物合成以及新陈代谢等代谢通路上。本研究通过对铅锌胁迫下山苍子雌雄株的花蕾进行高通量测序,揭示铅锌复合胁迫对山苍子雌雄花蕾发育和重金属富集在基因层面上的影响及差异,并对后期进行重金属污染区山苍子良种选育以及雌雄株栽植配比具有重要的指导意义。
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关键词
山苍子
雌雄株
铅锌胁迫
花蕾
转录组
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Keywords
Litsea cubeba(Lour.)Pers.
Female and male plants
Pb and Zn stresses
Buds
Transcriptome
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分类号
X173
[环境科学与工程—环境科学]
S565.9
[农业科学—作物学]
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