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基于多色流式降维聚类方法的自发性细菌性腹膜炎患者T淋巴细胞亚群分析
1
作者
王锃涛
王宪波
+3 位作者
曹钰
郝禹
韩俊燕
曾辉
《中华实验和临床感染病杂志(电子版)》
CAS
2023年第2期92-101,共10页
目的建立多色流式降维聚类分析方法,检测自发性细菌性腹膜炎(SBP)患者外周血和腹水中T细胞亚群,探讨SBP患者外周以及腹腔局部T淋巴细胞的表面标志物表达差异。方法选取2021年12月至2022年1月就诊于首都医科大学附属北京地坛医院的4例SB...
目的建立多色流式降维聚类分析方法,检测自发性细菌性腹膜炎(SBP)患者外周血和腹水中T细胞亚群,探讨SBP患者外周以及腹腔局部T淋巴细胞的表面标志物表达差异。方法选取2021年12月至2022年1月就诊于首都医科大学附属北京地坛医院的4例SBP患者为研究对象。根据多色流式荧光搭配原则,初步确立检测外周血及腹水T淋巴细胞亚群比例的多色流式配色方案。利用健康对照者外周血单个核细胞(PBMCs)调节最适检测电压及荧光补偿;设定条件后,检测4例SBP水样本。建立多色流式降维聚类分析方案以检测SBP患者外周血和腹水中T淋巴细胞的差异。结果采用统一流形逼近和投影(UMAP)结合FlowSOM插件的多色流式降维分析法将CD4^(+)T细胞和CD8^(+)T细胞均分为12个细胞群。该降维聚类方法通过可视化UMAP图定位,并结合统计学分析初步发现,与外周血相比,SBP患者腹水中CD69^(+)PD-1^(+)CD4^(+)T_(EM)(t=3.427、P=0.0416)以及CD25-TIGIT-CD4^(+)T_(EM)(t=3.203、P=0.0492)比例较高,差异有统计学意义。结论多色流式降维聚类分析法用于检测SBP患者外周血及腹水样本中T淋巴细胞分群及功能,具有快速、准确、多维度并且可视化强的优点。
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关键词
多色流式
自发性细菌性腹膜炎
降维聚类分析
T细胞亚群
原文传递
内毒素打击后小鼠脾脏T淋巴细胞功能恢复动态研究
2
作者
樊洋
李国力
+4 位作者
郝禹
曹钰
李方园
王锃涛
曾辉
《中华实验和临床感染病杂志(电子版)》
CAS
2023年第1期32-40,共9页
目的探讨脂多糖(LPS)打击后,小鼠脾脏T淋巴细胞亚群及功能的动态恢复过程。方法采用高剂量LPS(10 mg/kg)腹腔单次注射建立小鼠脓毒症模型,在LPS打击后第0 d、7 d,14 d和28 d,使用流式细胞术动态检测脾脏CD4^(+)T和CD8^(+)T细胞中初始T...
目的探讨脂多糖(LPS)打击后,小鼠脾脏T淋巴细胞亚群及功能的动态恢复过程。方法采用高剂量LPS(10 mg/kg)腹腔单次注射建立小鼠脓毒症模型,在LPS打击后第0 d、7 d,14 d和28 d,使用流式细胞术动态检测脾脏CD4^(+)T和CD8^(+)T细胞中初始T细胞、效应记忆T细胞和中央记忆T细胞的比例以及细胞表面活化分子(CD38和CD69)和共抑制分子(PD-1和TIGIT)的表达水平,分泌细胞因子IL-2和IFN-γ及释放颗粒酶B的能力。正态分布数据采用one-way ANOVA检验进行方差分析,Holm-Sidak’s进行多重比较;偏态分布数据则采用Kruskal-Wallis检验进行分析,Bonferroni法进行多重比较。结果LPS打击7 d后,与基线相比,小鼠脾脏初始CD4^(+)T和CD8^(+)T细胞比例均显著降低(F=52.22、P<0.0001,F=10.87、P=0.0019);效应记忆CD4^(+)T和CD8^(+)T细胞比例均显著增高(F=20.54、P<0.0001,F=26.03、P<0.0001);CD4^(+)CD38^(+)(F=35.40、P<0.0001)、CD4^(+)CD69^(+)(F=45.65、P<0.0001)、CD4^(+)PD-1^(+)(F=20.55、P<0.0001)、CD4^(+)TIGIT^(+)(F=19.20、P<0.0001)、CD8^(+)CD38^(+)(F=56.76、P<0.0001)、CD8^(+)CD69^(+)(F=59.47、P<0.0001)、CD8^(+)PD-1^(+)(F=11.15、P=0.0013)和CD8^(+)TIGIT^(+)(F=21.21、P<0.0001)细胞比例均显著增高,差异均有统计学意义。与基线相比,LPS打击14 d后细胞活化水平、共抑制分子表达水平逐渐恢复,但至28 d时,初始CD4^(+)T细胞(F=52.22、P<0.0001)、效应记忆CD4^(+)T细胞(F=20.54、P=0.0093)、CD4^(+)CD69^(+)(F=45.65、P=0.0037)、CD4^(+)PD-1^(+)(F=20.55、P=0.0255)和CD4^(+)TIGIT^(+)(F=19.20、P=0.0087)未恢复至基线水平;CD8^(+)IFN-γ^(+)T细胞比例(F=14.33、P=0.0343)仍高于基线水平,差异均有统计学意义。结论LPS打击后28 d小鼠脾脏CD4^(+)T和CD8^(+)T细胞恢复过程存在差异,CD4^(+)T细胞功能总体恢复较CD8^(+)T细胞更为缓慢。
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关键词
脓毒症
脾脏
淋巴细胞
活化
共抑制分子
原文传递
题名
基于多色流式降维聚类方法的自发性细菌性腹膜炎患者T淋巴细胞亚群分析
1
作者
王锃涛
王宪波
曹钰
郝禹
韩俊燕
曾辉
机构
首都医科大学附属北京地坛医院传染病研究所
首都医科大学附属北京地坛医院中西医结合中心
首都医科大学附属北京世纪坛医院生物医学创新中心
出处
《中华实验和临床感染病杂志(电子版)》
CAS
2023年第2期92-101,共10页
基金
国家自然科学基金面上项目(No.81971862)
北京市医院管理中心“登峰”计划(N o.LDFL20191801)
北京市科学技术委员会2019年“首都临床诊疗技术研究及转化应用”项目(No.Z201100005520035)。
文摘
目的建立多色流式降维聚类分析方法,检测自发性细菌性腹膜炎(SBP)患者外周血和腹水中T细胞亚群,探讨SBP患者外周以及腹腔局部T淋巴细胞的表面标志物表达差异。方法选取2021年12月至2022年1月就诊于首都医科大学附属北京地坛医院的4例SBP患者为研究对象。根据多色流式荧光搭配原则,初步确立检测外周血及腹水T淋巴细胞亚群比例的多色流式配色方案。利用健康对照者外周血单个核细胞(PBMCs)调节最适检测电压及荧光补偿;设定条件后,检测4例SBP水样本。建立多色流式降维聚类分析方案以检测SBP患者外周血和腹水中T淋巴细胞的差异。结果采用统一流形逼近和投影(UMAP)结合FlowSOM插件的多色流式降维分析法将CD4^(+)T细胞和CD8^(+)T细胞均分为12个细胞群。该降维聚类方法通过可视化UMAP图定位,并结合统计学分析初步发现,与外周血相比,SBP患者腹水中CD69^(+)PD-1^(+)CD4^(+)T_(EM)(t=3.427、P=0.0416)以及CD25-TIGIT-CD4^(+)T_(EM)(t=3.203、P=0.0492)比例较高,差异有统计学意义。结论多色流式降维聚类分析法用于检测SBP患者外周血及腹水样本中T淋巴细胞分群及功能,具有快速、准确、多维度并且可视化强的优点。
关键词
多色流式
自发性细菌性腹膜炎
降维聚类分析
T细胞亚群
Keywords
Muti-color flow cytometry
Spontaneous bacterial peritonitis
Dimensionality reduction and cluster analysis
T cell subset
分类号
R563.1 [医药卫生—呼吸系统]
原文传递
题名
内毒素打击后小鼠脾脏T淋巴细胞功能恢复动态研究
2
作者
樊洋
李国力
郝禹
曹钰
李方园
王锃涛
曾辉
机构
首都医科大学附属北京地坛医院传染病研究所
出处
《中华实验和临床感染病杂志(电子版)》
CAS
2023年第1期32-40,共9页
基金
国家自然科学基金(No.81772123)
文摘
目的探讨脂多糖(LPS)打击后,小鼠脾脏T淋巴细胞亚群及功能的动态恢复过程。方法采用高剂量LPS(10 mg/kg)腹腔单次注射建立小鼠脓毒症模型,在LPS打击后第0 d、7 d,14 d和28 d,使用流式细胞术动态检测脾脏CD4^(+)T和CD8^(+)T细胞中初始T细胞、效应记忆T细胞和中央记忆T细胞的比例以及细胞表面活化分子(CD38和CD69)和共抑制分子(PD-1和TIGIT)的表达水平,分泌细胞因子IL-2和IFN-γ及释放颗粒酶B的能力。正态分布数据采用one-way ANOVA检验进行方差分析,Holm-Sidak’s进行多重比较;偏态分布数据则采用Kruskal-Wallis检验进行分析,Bonferroni法进行多重比较。结果LPS打击7 d后,与基线相比,小鼠脾脏初始CD4^(+)T和CD8^(+)T细胞比例均显著降低(F=52.22、P<0.0001,F=10.87、P=0.0019);效应记忆CD4^(+)T和CD8^(+)T细胞比例均显著增高(F=20.54、P<0.0001,F=26.03、P<0.0001);CD4^(+)CD38^(+)(F=35.40、P<0.0001)、CD4^(+)CD69^(+)(F=45.65、P<0.0001)、CD4^(+)PD-1^(+)(F=20.55、P<0.0001)、CD4^(+)TIGIT^(+)(F=19.20、P<0.0001)、CD8^(+)CD38^(+)(F=56.76、P<0.0001)、CD8^(+)CD69^(+)(F=59.47、P<0.0001)、CD8^(+)PD-1^(+)(F=11.15、P=0.0013)和CD8^(+)TIGIT^(+)(F=21.21、P<0.0001)细胞比例均显著增高,差异均有统计学意义。与基线相比,LPS打击14 d后细胞活化水平、共抑制分子表达水平逐渐恢复,但至28 d时,初始CD4^(+)T细胞(F=52.22、P<0.0001)、效应记忆CD4^(+)T细胞(F=20.54、P=0.0093)、CD4^(+)CD69^(+)(F=45.65、P=0.0037)、CD4^(+)PD-1^(+)(F=20.55、P=0.0255)和CD4^(+)TIGIT^(+)(F=19.20、P=0.0087)未恢复至基线水平;CD8^(+)IFN-γ^(+)T细胞比例(F=14.33、P=0.0343)仍高于基线水平,差异均有统计学意义。结论LPS打击后28 d小鼠脾脏CD4^(+)T和CD8^(+)T细胞恢复过程存在差异,CD4^(+)T细胞功能总体恢复较CD8^(+)T细胞更为缓慢。
关键词
脓毒症
脾脏
淋巴细胞
活化
共抑制分子
Keywords
Sepsis
Spleen
Lymphocytes
Activation
Co-inhibitory molecules
分类号
R459.7 [医药卫生—急诊医学]
原文传递
题名
作者
出处
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被引量
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1
基于多色流式降维聚类方法的自发性细菌性腹膜炎患者T淋巴细胞亚群分析
王锃涛
王宪波
曹钰
郝禹
韩俊燕
曾辉
《中华实验和临床感染病杂志(电子版)》
CAS
2023
0
原文传递
2
内毒素打击后小鼠脾脏T淋巴细胞功能恢复动态研究
樊洋
李国力
郝禹
曹钰
李方园
王锃涛
曾辉
《中华实验和临床感染病杂志(电子版)》
CAS
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