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基于网络药理学和分子对接探讨消炎利胆片治疗急性胆囊炎的作用机制
1
作者
王闯红
常旭贞
《中医临床研究》
2024年第13期13-19,共7页
目的:基于网络药理学方法和分子对接技术探讨消炎利胆片治疗急性胆囊炎的潜在作用机制。方法:采用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、化学专业数据库及ETCM数据库检索获取消炎利胆片的化学成分,通过Swiss ADME数据库进一步筛选活...
目的:基于网络药理学方法和分子对接技术探讨消炎利胆片治疗急性胆囊炎的潜在作用机制。方法:采用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、化学专业数据库及ETCM数据库检索获取消炎利胆片的化学成分,通过Swiss ADME数据库进一步筛选活性成分并导入Swiss Target Prediction数据库预测药物相关靶点。利用Gene Cards数据库和OMIM数据库检索急性胆囊炎相关靶点,通过Venny 2.1在线平台获取“药物-疾病”交集靶点,并将“药物-疾病”共同靶点导入STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用网络。利用DAVID数据库对“药物-疾病”共同靶点进行基因本体论(GO)功能注释和京都基因与基因百科全书(KEGG)通路富集分析。运用Cytoscape软件构建“药物成分-靶点-信号通路”网络,计算网络拓扑学参数并筛选消炎利胆片发挥治疗急性胆囊炎作用的重要活性成分及核心靶点,通过Auto Dock平台进行分子对接验证。结果:共获得44个消炎利胆片活性成分及186个药物相关靶点,获得823个急性胆囊炎潜在靶点,取交集后得到“药物-疾病”共同靶点33个,这些靶点主要涉及磷脂酰肌醇3激酶(Phosphatidylinositol 3-kinase,PI3K)-蛋白激酶B(Akt)、丝裂原活化蛋白激酶(Mitogen-Activated Protein Kinase,MAPK)及缺氧诱导因子(Hypoxia Inducible Factor,HIF)-1等信号通路;“药物成分-靶点-通路”网络拓扑学分析提示槲皮素、异鼠李素、芹菜素、7-羟基香豆素和咖啡酸等可能是消炎利胆片发挥治疗急性胆囊炎作用的重要活性成分,关键靶点为表皮生长因子受体(Epidermal Growth Factor Receptor,EGFR)、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(Akt Serine/Threonine Kinase 1,AKT1)、醇醛酮还原酶家族1成员B1(Aldo-Keto Reductase Family 1 Member B1,AKR1B1)、胰岛素样生长因子1受体(Insulin-like Growth Factor 1 Receptor,IGF1R)以及ATP结合家族亚家族G成员2(ATP Binding Cassette Sub-Family G Member 2,ABCG2)等;分子对接显示大部分核心靶点与活性成分有较高的结合活性。结论:本研究基于网络药理学方法及分子对接技术初步揭示消炎利胆片通过多成分、多靶点、多途径治疗急性胆囊炎的机制,为探索消炎利胆片的药理机制和合理临床应用提供了一定的参考。
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关键词
消炎利胆片
急性胆囊炎
网络药理学
分子对接
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职称材料
基于网络药理学和分子对接探讨姜黄素治疗溃疡性结肠炎的分子机制
2
作者
王闯红
常旭贞
《医学信息》
2023年第19期13-18,共6页
目的基于网络药理学方法和分子对接技术预测姜黄素改善溃疡性结肠炎(UC)的关键靶点和潜在作用机制。方法通过数据库筛选获取姜黄素分子靶标及UC疾病靶点,利用Venny 2.1在线平台获取交集靶点,将药物疾病共有靶点导入STRING数据库构建蛋...
目的基于网络药理学方法和分子对接技术预测姜黄素改善溃疡性结肠炎(UC)的关键靶点和潜在作用机制。方法通过数据库筛选获取姜黄素分子靶标及UC疾病靶点,利用Venny 2.1在线平台获取交集靶点,将药物疾病共有靶点导入STRING数据库构建蛋白互作(PPI)网络,借助Cytoscape软件进行拓扑学参数分析并筛选核心靶点,利用DAVID数据库进行GO功能注释和KEGG通路富集分析,最后进行分子对接以预测姜黄素与核心靶标的结合活性。结果共获得姜黄素潜在作用靶点324个,UC靶点2907个,姜黄素与UC交集靶点168个;通过PPI网络获得姜黄素改善UC的关键靶点,包括SRC、MAPK1、STAT3、AKT1、HSP90AA1和PTPN11,主要涉及细胞凋亡过程负调控、蛋白质磷酸化、癌症相关通路、脂质和动脉粥样硬化、C型凝集素受体信号通路等通路;分子对接结果显示,姜黄素对潜在核心靶点具有良好的亲和力,其中STAT3结合度最高。结论姜黄素可以通过多靶点、多途径系统地改善UC,为后续运用姜黄素治疗UC的新药开发和临床研究提供了理论依据。
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关键词
姜黄素
溃疡性结肠炎
网络药理学
分子对接
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职称材料
题名
基于网络药理学和分子对接探讨消炎利胆片治疗急性胆囊炎的作用机制
1
作者
王闯红
常旭贞
机构
通渭县人民医院
出处
《中医临床研究》
2024年第13期13-19,共7页
文摘
目的:基于网络药理学方法和分子对接技术探讨消炎利胆片治疗急性胆囊炎的潜在作用机制。方法:采用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、化学专业数据库及ETCM数据库检索获取消炎利胆片的化学成分,通过Swiss ADME数据库进一步筛选活性成分并导入Swiss Target Prediction数据库预测药物相关靶点。利用Gene Cards数据库和OMIM数据库检索急性胆囊炎相关靶点,通过Venny 2.1在线平台获取“药物-疾病”交集靶点,并将“药物-疾病”共同靶点导入STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用网络。利用DAVID数据库对“药物-疾病”共同靶点进行基因本体论(GO)功能注释和京都基因与基因百科全书(KEGG)通路富集分析。运用Cytoscape软件构建“药物成分-靶点-信号通路”网络,计算网络拓扑学参数并筛选消炎利胆片发挥治疗急性胆囊炎作用的重要活性成分及核心靶点,通过Auto Dock平台进行分子对接验证。结果:共获得44个消炎利胆片活性成分及186个药物相关靶点,获得823个急性胆囊炎潜在靶点,取交集后得到“药物-疾病”共同靶点33个,这些靶点主要涉及磷脂酰肌醇3激酶(Phosphatidylinositol 3-kinase,PI3K)-蛋白激酶B(Akt)、丝裂原活化蛋白激酶(Mitogen-Activated Protein Kinase,MAPK)及缺氧诱导因子(Hypoxia Inducible Factor,HIF)-1等信号通路;“药物成分-靶点-通路”网络拓扑学分析提示槲皮素、异鼠李素、芹菜素、7-羟基香豆素和咖啡酸等可能是消炎利胆片发挥治疗急性胆囊炎作用的重要活性成分,关键靶点为表皮生长因子受体(Epidermal Growth Factor Receptor,EGFR)、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(Akt Serine/Threonine Kinase 1,AKT1)、醇醛酮还原酶家族1成员B1(Aldo-Keto Reductase Family 1 Member B1,AKR1B1)、胰岛素样生长因子1受体(Insulin-like Growth Factor 1 Receptor,IGF1R)以及ATP结合家族亚家族G成员2(ATP Binding Cassette Sub-Family G Member 2,ABCG2)等;分子对接显示大部分核心靶点与活性成分有较高的结合活性。结论:本研究基于网络药理学方法及分子对接技术初步揭示消炎利胆片通过多成分、多靶点、多途径治疗急性胆囊炎的机制,为探索消炎利胆片的药理机制和合理临床应用提供了一定的参考。
关键词
消炎利胆片
急性胆囊炎
网络药理学
分子对接
Keywords
The Xiaoyan Lidan tablets
Acute cholecystitis
Network pharmacology
Molecular docking
分类号
R256.4 [医药卫生—中医内科学]
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职称材料
题名
基于网络药理学和分子对接探讨姜黄素治疗溃疡性结肠炎的分子机制
2
作者
王闯红
常旭贞
机构
通渭县人民医院普外科
通渭县人民医院病理科
出处
《医学信息》
2023年第19期13-18,共6页
文摘
目的基于网络药理学方法和分子对接技术预测姜黄素改善溃疡性结肠炎(UC)的关键靶点和潜在作用机制。方法通过数据库筛选获取姜黄素分子靶标及UC疾病靶点,利用Venny 2.1在线平台获取交集靶点,将药物疾病共有靶点导入STRING数据库构建蛋白互作(PPI)网络,借助Cytoscape软件进行拓扑学参数分析并筛选核心靶点,利用DAVID数据库进行GO功能注释和KEGG通路富集分析,最后进行分子对接以预测姜黄素与核心靶标的结合活性。结果共获得姜黄素潜在作用靶点324个,UC靶点2907个,姜黄素与UC交集靶点168个;通过PPI网络获得姜黄素改善UC的关键靶点,包括SRC、MAPK1、STAT3、AKT1、HSP90AA1和PTPN11,主要涉及细胞凋亡过程负调控、蛋白质磷酸化、癌症相关通路、脂质和动脉粥样硬化、C型凝集素受体信号通路等通路;分子对接结果显示,姜黄素对潜在核心靶点具有良好的亲和力,其中STAT3结合度最高。结论姜黄素可以通过多靶点、多途径系统地改善UC,为后续运用姜黄素治疗UC的新药开发和临床研究提供了理论依据。
关键词
姜黄素
溃疡性结肠炎
网络药理学
分子对接
Keywords
Curcumin
Ulcerative colitis
Network pharmacology
Molecular docking
分类号
R392.5 [医药卫生—免疫学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于网络药理学和分子对接探讨消炎利胆片治疗急性胆囊炎的作用机制
王闯红
常旭贞
《中医临床研究》
2024
0
下载PDF
职称材料
2
基于网络药理学和分子对接探讨姜黄素治疗溃疡性结肠炎的分子机制
王闯红
常旭贞
《医学信息》
2023
0
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职称材料
已选择
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