目的基于网络药理学探讨温胆汤对心力衰竭合并抑郁共病同治机制,并通过分子对接初步验证。方法通过TCMSP数据库与文献搜索得到温胆汤有效成分并预测作用靶点;在GeneCards、OMIM、DisGeNET以及TTD数据库搜索心力衰竭、抑郁症相关疾病靶点...目的基于网络药理学探讨温胆汤对心力衰竭合并抑郁共病同治机制,并通过分子对接初步验证。方法通过TCMSP数据库与文献搜索得到温胆汤有效成分并预测作用靶点;在GeneCards、OMIM、DisGeNET以及TTD数据库搜索心力衰竭、抑郁症相关疾病靶点,与温胆汤作用靶点取交集。通过STRING平台完成交集靶点的蛋白质相互作用网络的构建并预测核心靶点,并对交集靶点进行基因本体注释及京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析,最后利用分子对接验证核心成分及核心靶点的结合能力。结果温胆汤治疗心力衰竭合并抑郁的核心成分为木犀草素、川陈皮素、β-谷甾醇、黄芩苷、豆甾醇等,核心靶点主要包括肿瘤坏死因子、白细胞介素-6、蛋白激酶B1、白细胞介素-1β、肿瘤蛋白p53等,通过KEGG主要富集在晚期糖基化终产物及其受体、磷脂酰肌醇-3激酶/蛋白激酶B、环磷酸腺苷、丝裂原活化蛋白激酶等信号通路。分子对接结果表明,木犀草素等核心成分与肿瘤坏死因子、白细胞介素-6等核心靶点的结合活性较好。结论温胆汤可能通过抑制炎症反应及氧化应激反应、调节神经递质的释放等方面来治疗心力衰竭合并抑郁。展开更多
目的:利用网络药理学的技术和方法探索“金银花-连翘”(简称“银翘”)药对对防治新型冠状病毒肺炎(coronavirus disease 2019,COVID-19)作用的活性成分及其作用机制。方法:通过中药系统药理学分析平台(traditional Chinese medicine sys...目的:利用网络药理学的技术和方法探索“金银花-连翘”(简称“银翘”)药对对防治新型冠状病毒肺炎(coronavirus disease 2019,COVID-19)作用的活性成分及其作用机制。方法:通过中药系统药理学分析平台(traditional Chinese medicine system pharmacology,TCMSP)根据口服生物利用度(oral bioavailability,OB)和类药性(drug-likeness,DL)检索中药“金银花”“连翘”中的化学成分和作用靶点,并在人类基因数据库(genecards:the human gene database)数据库中寻找“novel coronavirus pneumonia”的相关靶点,将“银翘”药对作用靶点与COVID-19相关靶点进行映射分析,筛选“银翘”药对防治COVID-19的活性成分和作用靶点。并用Cytoscape 3.7.2软件建立“中药活性成分-作用靶点-疾病”网络、通过STRING平台构建蛋白相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络、通过DAVID分析平台,对靶点基因GO富集分析和KEGG代谢通路进行分析,探究“银翘”药对防治COVID-19的作用机制。结果:从“金银花”中筛选化合物23个,“连翘”中化合物23个,二者有效作用靶点204个,通过Venn图获得与COVID-19有关的作用靶点44个,PPI网络发现IL-6、IL-1B、MAPK1、MAPK8、CXCL8、RELA、CCL2、IL10、ICAM1、IL-2、PTGS2、CASP3、MAPK14、STAT1、EGFR、FOS、IL-4等可能是“银翘”药对防治COVID-19的作用靶点。GO功能分析发现79个条目,涉及转录因子活性、受体活性、细胞因子活性、酶活性及生物合成过程的调控等方面。KEGG通路分析发现44个疾病药物交集靶点显著富集在146条通路上(P<0.01),涉及炎症、免疫、凋亡、自噬、激素代谢、肿瘤等方面,通路包括糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路、IL-17信号通路、TNF信号通路、Toll样受体信号通路、C型凝集素受体信号通路、HIF-1信号通路、NF-κB信号通路、NOD样受体信号通路等经典信号通路,此外还参与细菌或病毒感染通路,如甲型流感、丙肝、百日咳、结核、巨细胞病毒感染、EB病毒感染等。这些作用通路可能是“银翘”药对防治COVID-19的依据。结论:初步验证了“银翘”药对防治COVID-19的作用机制,“银翘”药对相须配伍具有多个活性成分,能通过多个靶点、多个通路以发挥抗病毒、抑菌抗炎、调节免疫作用来防治COVID-19。展开更多
文摘目的基于网络药理学探讨温胆汤对心力衰竭合并抑郁共病同治机制,并通过分子对接初步验证。方法通过TCMSP数据库与文献搜索得到温胆汤有效成分并预测作用靶点;在GeneCards、OMIM、DisGeNET以及TTD数据库搜索心力衰竭、抑郁症相关疾病靶点,与温胆汤作用靶点取交集。通过STRING平台完成交集靶点的蛋白质相互作用网络的构建并预测核心靶点,并对交集靶点进行基因本体注释及京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析,最后利用分子对接验证核心成分及核心靶点的结合能力。结果温胆汤治疗心力衰竭合并抑郁的核心成分为木犀草素、川陈皮素、β-谷甾醇、黄芩苷、豆甾醇等,核心靶点主要包括肿瘤坏死因子、白细胞介素-6、蛋白激酶B1、白细胞介素-1β、肿瘤蛋白p53等,通过KEGG主要富集在晚期糖基化终产物及其受体、磷脂酰肌醇-3激酶/蛋白激酶B、环磷酸腺苷、丝裂原活化蛋白激酶等信号通路。分子对接结果表明,木犀草素等核心成分与肿瘤坏死因子、白细胞介素-6等核心靶点的结合活性较好。结论温胆汤可能通过抑制炎症反应及氧化应激反应、调节神经递质的释放等方面来治疗心力衰竭合并抑郁。
文摘目的:利用网络药理学的技术和方法探索“金银花-连翘”(简称“银翘”)药对对防治新型冠状病毒肺炎(coronavirus disease 2019,COVID-19)作用的活性成分及其作用机制。方法:通过中药系统药理学分析平台(traditional Chinese medicine system pharmacology,TCMSP)根据口服生物利用度(oral bioavailability,OB)和类药性(drug-likeness,DL)检索中药“金银花”“连翘”中的化学成分和作用靶点,并在人类基因数据库(genecards:the human gene database)数据库中寻找“novel coronavirus pneumonia”的相关靶点,将“银翘”药对作用靶点与COVID-19相关靶点进行映射分析,筛选“银翘”药对防治COVID-19的活性成分和作用靶点。并用Cytoscape 3.7.2软件建立“中药活性成分-作用靶点-疾病”网络、通过STRING平台构建蛋白相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络、通过DAVID分析平台,对靶点基因GO富集分析和KEGG代谢通路进行分析,探究“银翘”药对防治COVID-19的作用机制。结果:从“金银花”中筛选化合物23个,“连翘”中化合物23个,二者有效作用靶点204个,通过Venn图获得与COVID-19有关的作用靶点44个,PPI网络发现IL-6、IL-1B、MAPK1、MAPK8、CXCL8、RELA、CCL2、IL10、ICAM1、IL-2、PTGS2、CASP3、MAPK14、STAT1、EGFR、FOS、IL-4等可能是“银翘”药对防治COVID-19的作用靶点。GO功能分析发现79个条目,涉及转录因子活性、受体活性、细胞因子活性、酶活性及生物合成过程的调控等方面。KEGG通路分析发现44个疾病药物交集靶点显著富集在146条通路上(P<0.01),涉及炎症、免疫、凋亡、自噬、激素代谢、肿瘤等方面,通路包括糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路、IL-17信号通路、TNF信号通路、Toll样受体信号通路、C型凝集素受体信号通路、HIF-1信号通路、NF-κB信号通路、NOD样受体信号通路等经典信号通路,此外还参与细菌或病毒感染通路,如甲型流感、丙肝、百日咳、结核、巨细胞病毒感染、EB病毒感染等。这些作用通路可能是“银翘”药对防治COVID-19的依据。结论:初步验证了“银翘”药对防治COVID-19的作用机制,“银翘”药对相须配伍具有多个活性成分,能通过多个靶点、多个通路以发挥抗病毒、抑菌抗炎、调节免疫作用来防治COVID-19。
