石斑鱼类的分子系统学研究进展

石斑鱼类是世界上最重要的海洋经济鱼类之一,其种类繁多,大部分营定居性生活.由于种间缺乏明显的外部形态区别特征,石斑鱼的分类一直是鱼类系统分类学中的一个难题,存在着很多争议和混淆.通过DNA序列分析在分子水平重建物种的系统进化关系是当前系统学研究的一个新热点,是传统系统学研究的重要补充和佐证.本文简要综述了石斑鱼类传统分类研究状况、存在问题及当前石斑鱼类的分子系统学研究进展,并对石斑鱼类的系统学研究发展作了展望.

基于16SrDNA部分序列探讨中国近海30种石斑鱼类的分子系统进化关系

石斑鱼因其种类繁多、分布广泛及缺乏显著的形体特征,使其系统分类的研究颇为困难。为探讨中国近海石斑鱼类的系统进化关系,通过PCR扩增获得了石斑鱼亚科(Epinephelinae)6属30个种类的线粒体16SrDNA基因片段序列。采用多个生物软件对序列变异和碱基组成进行分析,计算了Kimura2parameter遗传距离、转换/颠换比等遗传信息指数,并结合GenBank石斑鱼属的同源序列,以多纹长尾(Pronotogrammusmultifasciatus)和皮氏叫姑鱼(Johniusbelengerii)为外群构建NJ、MP和ML系统树。根据所得分子依据并结合形态学特征,推论如下:1)在本研究的30种石斑鱼中,鳃棘鲈属(Plectropomus)最先分化,并呈明显单系性;九棘鲈属(Cephalopholis)是一个单系群,并且较石斑鱼属(Epinephelus)原始;侧牙鲈属(Variola)的进化地位介于鳃棘鲈属与九棘鲈属之间;2)宽额鲈(Promicropslanceolatus)可以归入石斑鱼属,而驼背鲈(Cromileptesaltivelis)也与石斑鱼属有很近的亲缘关系,甚至可能是石斑鱼属内的特化类群;3)石斑鱼属内部存在两个平行进化的姐妹分支,分支内部的种类组成与地理分布无关,暗示了石斑鱼属早期的分化模式。