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丝瓜TIFY基因克隆及组织表达分析
1
作者
刘同金
刘振洋
+2 位作者
班秋妍
周露
崔群香
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第11期1752-1759,共8页
【目的】TIFY基因在植物生长发育过程中发挥重要的调节作用,对丝瓜TIFY基因家族成员进行鉴定,筛选果实中高表达的成员,并对其进行克隆和组织表达分析,为阐明其生物学功能奠定基础。【方法】通过生物信息学方法对丝瓜TIFY基因家族成员进...
【目的】TIFY基因在植物生长发育过程中发挥重要的调节作用,对丝瓜TIFY基因家族成员进行鉴定,筛选果实中高表达的成员,并对其进行克隆和组织表达分析,为阐明其生物学功能奠定基础。【方法】通过生物信息学方法对丝瓜TIFY基因家族成员进行鉴定,基于转录组分析筛选果实中高表达的成员,基于RT-PCR技术对其进行克隆,基于qRT-PCR研究其组织表达。【结果】丝瓜基因组中包含17个TIFY基因,不均匀地分布于9条染色体上,CDS序列全长297~1353 bp,可分为4个亚家族;LcTIFY2、LcTIFY7、LcTIFY11和LcTIFY13在丝瓜果实中的表达量显著高于其他成员;克隆了其CDS序列,分别具有3,5,6,2个外显子;上述4个基因均在丝瓜果皮中的表达量最高,此外,LcTIFY7和LcTIFY13在生殖器官中的表达量显著高于营养器官;LcTIFY11在雌花蕾和子房中的表达量显著高于雄花蕾。【结论】丝瓜TIFY家族成员LcTIFY2、LcTIFY7、LcTIFY11和LcTIFY13可能在其生殖生长和果实发育过程中发挥作用。
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关键词
丝瓜
TIFY基因表达
果实发育
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职称材料
影响猕猴桃保鲜贮藏环境因子的研究概况
被引量:
2
2
作者
班秋妍
舒娜
《食品安全导刊》
2018年第13期57-61,共5页
猕猴桃鲜果味道鲜美,营养丰富,广受消费者喜爱。但如果贮藏环境控制不当,果实品质会严重下降,造成经济损失,因此采后贮藏保鲜是猕猴桃产业发展的重要环节。本文就影响猕猴桃采后贮藏保鲜效果的主要环境因素——温度、湿度、气体成分及...
猕猴桃鲜果味道鲜美,营养丰富,广受消费者喜爱。但如果贮藏环境控制不当,果实品质会严重下降,造成经济损失,因此采后贮藏保鲜是猕猴桃产业发展的重要环节。本文就影响猕猴桃采后贮藏保鲜效果的主要环境因素——温度、湿度、气体成分及微生物进行了阐述,结合国内外保鲜技术效果研究,评价适宜猕猴桃采后贮藏的条件。
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关键词
猕猴桃
贮藏
环境
采后处理
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职称材料
茄子Ⅳ型查尔酮异构酶基因SmCHI2的克隆与分析
3
作者
周露
崔群香
+6 位作者
刘同金
班秋妍
袁颖辉
宁坤
范俊俊
张‧敏
沈慧玲
《西南农业学报》
CSCD
北大核心
2023年第7期1475-1481,共7页
【目的】探究茄子花青素合成通路中关键酶SmCHI2的蛋白特性和表达特性,为完善茄子花青素生物合成途径和品质育种提供一定的理论基础。【方法】通过同源克隆获得茄子SmCHI2基因全长序列,利用在线分析工具对其蛋白理化性质进行预测,利用Cl...
【目的】探究茄子花青素合成通路中关键酶SmCHI2的蛋白特性和表达特性,为完善茄子花青素生物合成途径和品质育种提供一定的理论基础。【方法】通过同源克隆获得茄子SmCHI2基因全长序列,利用在线分析工具对其蛋白理化性质进行预测,利用ClustalX 1.7、GeneDoc 2.7.0和Mega 6.0软件进行蛋白序列比对和系统进化树分析,利用qRT-PCR分析SmCHI2基因的表达模式。【结果】SmCHI2基因编码区全长633 bp,编码210个氨基酸。蛋白理化性质分析显示SmCHI2蛋白分子量为23.98 kDa,理论等电点为4.81,且为不稳定的亲水性蛋白。二级和三级结构预测显示SmCHI2蛋白结构主要包括α-螺旋、随机卷曲、延伸链和β-转角。多序列比对表明SmCHI2与LcCHI(枸杞AIC33515.1)、LrCHI(黑枸杞AQZ26680.1)、CaCHI2(辣椒XP_016573438.1)和StCHI3(马铃薯XP_006365329.1)等Ⅳ型CHI蛋白具有相同的活性和识别位点,且在系统进化树中属于同一分支。亚细胞定位结果显示,SmCHI2蛋白在细胞核、细胞膜和细胞质中均有分布。表达分析显示,SmCHI2基因主要在紫色组织中表达,且在白色果皮中表达量显著低于紫色果皮。【结论】茄子中Ⅳ型CHI蛋白SmCHI2正调控茄子花青素的生物合成。
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关键词
茄子
SmCHI2基因
克隆
生物信息学分析
表达特征
花青素
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职称材料
题名
丝瓜TIFY基因克隆及组织表达分析
1
作者
刘同金
刘振洋
班秋妍
周露
崔群香
机构
金陵科技学院园艺园林学院
出处
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第11期1752-1759,共8页
基金
国家级大学生创新训练计划项目(202313573033Z)
南京市品种选育专项项目(202210020)
+1 种基金
金陵科技学院高层次人才科研启动项目(jit-b-202009)
金陵科技学院科研基金孵化项目(jit-fhxm-202113)。
文摘
【目的】TIFY基因在植物生长发育过程中发挥重要的调节作用,对丝瓜TIFY基因家族成员进行鉴定,筛选果实中高表达的成员,并对其进行克隆和组织表达分析,为阐明其生物学功能奠定基础。【方法】通过生物信息学方法对丝瓜TIFY基因家族成员进行鉴定,基于转录组分析筛选果实中高表达的成员,基于RT-PCR技术对其进行克隆,基于qRT-PCR研究其组织表达。【结果】丝瓜基因组中包含17个TIFY基因,不均匀地分布于9条染色体上,CDS序列全长297~1353 bp,可分为4个亚家族;LcTIFY2、LcTIFY7、LcTIFY11和LcTIFY13在丝瓜果实中的表达量显著高于其他成员;克隆了其CDS序列,分别具有3,5,6,2个外显子;上述4个基因均在丝瓜果皮中的表达量最高,此外,LcTIFY7和LcTIFY13在生殖器官中的表达量显著高于营养器官;LcTIFY11在雌花蕾和子房中的表达量显著高于雄花蕾。【结论】丝瓜TIFY家族成员LcTIFY2、LcTIFY7、LcTIFY11和LcTIFY13可能在其生殖生长和果实发育过程中发挥作用。
关键词
丝瓜
TIFY基因表达
果实发育
Keywords
Luffa cylindrica
gene expression of TIFY
fruit development
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
S642.4 [农业科学—蔬菜学]
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职称材料
题名
影响猕猴桃保鲜贮藏环境因子的研究概况
被引量:
2
2
作者
班秋妍
舒娜
机构
西北农林科技大学园艺学院
美安康质量检测技术(上海)有限公司
出处
《食品安全导刊》
2018年第13期57-61,共5页
文摘
猕猴桃鲜果味道鲜美,营养丰富,广受消费者喜爱。但如果贮藏环境控制不当,果实品质会严重下降,造成经济损失,因此采后贮藏保鲜是猕猴桃产业发展的重要环节。本文就影响猕猴桃采后贮藏保鲜效果的主要环境因素——温度、湿度、气体成分及微生物进行了阐述,结合国内外保鲜技术效果研究,评价适宜猕猴桃采后贮藏的条件。
关键词
猕猴桃
贮藏
环境
采后处理
分类号
TS255.3 [轻工技术与工程—农产品加工及贮藏工程]
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职称材料
题名
茄子Ⅳ型查尔酮异构酶基因SmCHI2的克隆与分析
3
作者
周露
崔群香
刘同金
班秋妍
袁颖辉
宁坤
范俊俊
张‧敏
沈慧玲
机构
金陵科技学院园艺园林学院
出处
《西南农业学报》
CSCD
北大核心
2023年第7期1475-1481,共7页
基金
金陵科技学院高层次人才科研启动项目(jit-b-202053)
江苏省种业振兴“揭榜挂帅”项目[JBGS(2021)074]
江苏省农业自主创新项目[CX(21)3028]。
文摘
【目的】探究茄子花青素合成通路中关键酶SmCHI2的蛋白特性和表达特性,为完善茄子花青素生物合成途径和品质育种提供一定的理论基础。【方法】通过同源克隆获得茄子SmCHI2基因全长序列,利用在线分析工具对其蛋白理化性质进行预测,利用ClustalX 1.7、GeneDoc 2.7.0和Mega 6.0软件进行蛋白序列比对和系统进化树分析,利用qRT-PCR分析SmCHI2基因的表达模式。【结果】SmCHI2基因编码区全长633 bp,编码210个氨基酸。蛋白理化性质分析显示SmCHI2蛋白分子量为23.98 kDa,理论等电点为4.81,且为不稳定的亲水性蛋白。二级和三级结构预测显示SmCHI2蛋白结构主要包括α-螺旋、随机卷曲、延伸链和β-转角。多序列比对表明SmCHI2与LcCHI(枸杞AIC33515.1)、LrCHI(黑枸杞AQZ26680.1)、CaCHI2(辣椒XP_016573438.1)和StCHI3(马铃薯XP_006365329.1)等Ⅳ型CHI蛋白具有相同的活性和识别位点,且在系统进化树中属于同一分支。亚细胞定位结果显示,SmCHI2蛋白在细胞核、细胞膜和细胞质中均有分布。表达分析显示,SmCHI2基因主要在紫色组织中表达,且在白色果皮中表达量显著低于紫色果皮。【结论】茄子中Ⅳ型CHI蛋白SmCHI2正调控茄子花青素的生物合成。
关键词
茄子
SmCHI2基因
克隆
生物信息学分析
表达特征
花青素
Keywords
Eggplant
SmCHI2 gene
Cloning
Bioinformatics analysis
Expression characteristics
Anthocyanin
分类号
S641.10 [农业科学—蔬菜学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
丝瓜TIFY基因克隆及组织表达分析
刘同金
刘振洋
班秋妍
周露
崔群香
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
下载PDF
职称材料
2
影响猕猴桃保鲜贮藏环境因子的研究概况
班秋妍
舒娜
《食品安全导刊》
2018
2
下载PDF
职称材料
3
茄子Ⅳ型查尔酮异构酶基因SmCHI2的克隆与分析
周露
崔群香
刘同金
班秋妍
袁颖辉
宁坤
范俊俊
张‧敏
沈慧玲
《西南农业学报》
CSCD
北大核心
2023
0
下载PDF
职称材料
已选择
0
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