2020—2022年湖北省生猪屠宰场伪狂犬病病毒的分离鉴定及遗传进化分析

旨在监测湖北省生猪屠宰场中伪狂犬病病毒(pseudorabies virus,PRV)的流行情况。采集2020—2022年湖北省4个区域(鄂东、鄂北、鄂西、鄂中)共9个县市不同规模屠宰场的1795份血液样品和2081份肺样品(肺、肺门淋巴结),分别使用靶向PRV gE基因的ELISA和PCR方法检测血清中的抗体和肺样品中的病原,同时对阳性样品进行病原分离鉴定、全基因组测序和遗传进化分析。血清学检测结果显示,共有104份样品为阳性,平均阳性检出率为5.79%。病原学检测结果显示,共有82份样品为阳性,平均阳性检出率为3.94%。按不同因素对检出率进行分析,显示抗体和病原都在春季检出率最高,分别为18.57%和9.74%;湖北省东部的抗体检出率最高(10.77%),中部的病原检出率最高(4.93%);A类小型屠宰场的病原和抗体检出率都显著高于其他3个类型,分别为16.28%和6.01%。从病原阳性样品中共分离到PRV 17株,经全基因组和gB、gC、gE基因遗传进化分析结果显示均属于基因Ⅱ型变异株,与Bartha、NIA-3、Becker等早期国外分离株处于不同的遗传进化分支。其中HBXG疑似发生了基因Ⅰ型毒株与基因Ⅱ型毒株的重组,与早期报道的重组病毒HuB1/CHN2017同处于独立的clade2.2遗传分支。综上所述,湖北省屠宰场关联的猪场中主要流行PRV变异毒株,且免疫过疫苗的猪场还在发生疫苗株与野毒的重组与变异,因此本研究对PRV的持续监测与新型疫苗的研发工作有十分重要的意义。